Converge™ Software Case Management and NGS Data Analysis License

Diese Kombinationslizenz ermöglicht den Zugriff auf die Case Management-Anwendung und das NGS-Datenanalysemodul der Converge Software V2.1 (separat erhältlich). Die Software Converge ist eine modulare All-in-One-Unternehmensplattform von Thermo Fisher Scientific, die integrierte DNA-Datenverwaltungs- und Analysesoftware für forensische Labors bietet.

Hauptmerkmale und Vorteile:
• Analysieren Sie NGS-Daten aus Precision ID GlobalFiler NGS STR Panel v2, Precision ID mtDNA Whole Genome oder Control Region Panels, Precision ID Identity Panel und Precision ID Ancestry Panel
• HID Genotyper Plugin enthält optimierte Bioinformatik für die Analyse von Precision ID GlobalFiler NGS STR Panel v2
• Führen Sie relevante DNA-Profilvergleiche durch (CE und CE, CE und NGS, NGS und NGS)

NGS-Datenanalysemodul
Das NGS-Datenanalysemodul ermöglicht Benutzern die Analyse von STR-, SNP- oder mtDNA-Daten aus Precision ID-Workflows und ist für die Erstellung von Profilen aus dem Applied Biosystems Precision ID GlobalFiler NGS STR Panel v2 erforderlich. Die NGS-Analysefunktion umfasst Informationen zum STR-Allele-Aufruf, STR-Sequenzmotiven, SNPs in flankierenden Bereichen und die Fähigkeit zur Unterscheidung isometrischer Heterozygoten (Allele gleicher Fragmentlänge, aber mit unterschiedlichen Sequenzen). Diese zusätzlichen Quellen der allelischen Vielfalt können sowohl bei der Mischungsanalyse als auch bei der Interpretation von Verwandtschaft nützlich sein. Mit einer Schnittstelle, die der der Applied Biosystems GeneMapper ID-X Software ähnelt, können forensische Analytiker NGS-Daten mit bekannten Prozessqualitätswerten (PQVs) und Flags wie Allelnummer (AN), Off-Leiter-Allel (OL), Peak-Höhen-Verhältnis (PHR), unter stochastischer Schwelle (BST) und Kontrollkonkordanz (CC) schnell bewerten. Vorkonfigurierte Analyseeinstellungen sind im NGS-Modul enthalten und können vom Labor bei Bedarf geändert werden. Darüber hinaus ist eine vollständige Auditing-Funktionalität für die Anforderungen an die Aufbewahrungskette enthalten. Die Verwendung des NGS-Datenanalysemoduls mit der Fallmanagement-Anwendung der Converge-Software ermöglicht einen vereinfachten Vergleich von NGS- und CE-Profilen.

Für die mtDNA-Analyse mit dem Precision ID mtDNA Whole Genome Panel oder dem Precision ID mtDNA Control Region Panel bietet das Converge NGS Data Analysis Modul einfache, genaue Variantenaufrufe. Die automatisierte mtDNA-NGS-Analysepipeline integriert verschiedene Wissensquellen für mtDNA-Variationen, einschließlich Phylotree und EMPOP, um fein abgestimmte Ausrichtungen und Variantenaufrufe zu ermöglichen, die die Fallstricke von Standardalgorithmen vermeiden. Labors, die an einer weiterentwickelten Analyse und Berichterstellung für mtDNA-Typen interessiert sind, können Haplotypen- und Haplogruppeninformationen sowie quantitative Bewertungen für Punkt- und Längen-Heteroplasmien erhalten.

Das Converge-Software-NGS-Modul enthält Analyseparameter für die Erstellung von Berichten aus dem Precision ID Ancestry Panel und dem Precision ID Identity Panel. Die SNP-Analyse in Converge bietet eine Vielzahl von Metriken zur Überwachung der Sequenzierungsqualität einschließlich der Abdeckung von ausgerichteten Lesevorgängen an einem Hotspot, der Strangvorspannung, der Anzahl der Lesevorgänge, die jede Basis am Hotspot enthalten, der Genotyp-Aufforderung und der Qualität. Die tertiäre Analyse der Abstammung besteht aus der Erstellung einer Schätzung der Zumischungsvorhersage aus sieben geografischen Regionen: Afrika, Amerika, Ostasien, Europa, Ozeanien, Südasien und Südwest-Asien und der Wahrscheinlichkeit der Population.

Die Fallmanagement-Anwendung
Converge Software wurde entwickelt, um die Effizienz von forensischen und Beziehung-DNA-Testlabors durch die Zentralisierung der Datenerstellung, -analyse und -speicherung an einem einzigen Zugrifspunkt zu steigern. Die Fallmanagement-Anwendung unterstützt die Verwaltung von Fall-, Subjekt-, Genotypprofil- und Labordaten und ermöglicht die automatisierte Datenübertragung und Integration in verschiedene forensische DNA-Laborsysteme. Die Software ist in hohem Maße konfigurierbar, um spezifische Arbeitsabläufe im Labor zu ermöglichen, nicht nur für Analyseparameter, sondern auch für Datenfelder gemäß den Standardbetriebsverfahren des Labors. Darüber hinaus ermöglicht sie die Konfiguration der Benutzeroberfläche und der Ausgabeberichte und bietet Funktionen, die die Datensicherheit und -integrität gewährleisten. Diese Funktionen sind über eine gesicherte Webbrowser-Oberfläche unter dem Schutz der eigenen IT-Abteilung des Labors leicht zugänglich. Eine Vielzahl von Softwaremodulen kann problemlos auf der Converge-Plattform zur Unterstützung verschiedener forensischer Anwendungen aufgebaut werden.

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