Applied Biosystems™

TaqMan™ Kopienzahl-Assays

Name: TaqMan™ Kopienzahl-Assays
SKU: 4400291
Price: 405.65 EUR

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Katalognummer	Menge
4400291	360, 720 rxn(s)
4400292	M (750 reactions), made to order
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Katalognummer 4400291

Preis (EUR)

405,65

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Each

Menge:

360, 720 rxn(s)

Applied Biosystems TaqMan Kopienzahl-Assays nutzen die Gold Standard TaqMan MGB-Sondenchemie zum Bewerten der Kopienzahl genomischer DNA-Targets mit Applied Biosystems Realtime-PCR-Instrumenten und -Software.TaqMan Kopienzahl-Assays werden zusammen mit einem TaqMan Kopienzahl-Referenzassay in einer Duplex-qPCR-Reaktion ausgeführt. Der Kopienzahl-Assay erkennt die Target-Sequenz, und der Referenzassay erkennt eine Sequenz, von der bekannt ist, dass sie in zwei Kopien im diploiden Genom vorhanden ist.Die Ergebnisse werden dann mit Applied Biosystems CopyCaller Software nach der relativen Quantifizierungsmethode analysiert.

Die vorentwickelte TaqMan Copy Number Assay-Sammlung besteht aus humanen und Maus-Assay-Bibliotheken für die Analyse von Kopienzahlvariationen (CNV).Die menschliche Assay-Sammlung umfasst über 1,6 Millionen Assays, die Genexons und Introns, extragenische Regionen und CNV-Sequenzen aus der Datenbank der genomischen Varianten (DGV) anvisieren.Die Maus-Sammlung umfasst über 180.000 Assays für Genexone.Assays zu gängigen Vektormarkern und Reportergenen sind auch für transgene Studien verfügbar.

Vorteile:
•Spezifisch —Gold-Standard TaqMan Chemie mit MGB-Sonden (Minor Groove Binder) erhöhen die Assay-Spezifität, indem sie kürzere Sonden ermöglichen.
• Reproduzierbar — Die mit unserer Bioinformatik-Pipeline entwickelten robusten Assay-Designs ermöglichen genaue, reproduzierbare und zuverlässige Ergebnisse.
•Einfach zu interpretieren — CopyCaller Software liefert die berechnete Kopienzahl und die vorhergesagte Kopienzahl, zusammen mit dem Vertrauenswert und Z-Score-Qualitätsmetriken
•Schnell und einfach — Von der Einrichtung bis zur Primäranalyse in 3–4 Stunden

Ungefähre Lieferzeit
4–6 Tage in Nordamerika und 6–10 Tage in Europa

Alle Assay-Designs sind das Produkt unserer Bioinformatik-Pipeline, optimiert über einen Zeitraum von mehr als zehn Jahren durch die Nutzung von Assay-Fertigungs- und -Leistungsdaten.TaqMan Assays wurden in über 40.000 Publikationen zitiert und werden durch mehr als 350 Patente unterstützt.

Alle unsere vorgefertigten TaqMan Assays sind durch die TaqMan Assays qPCR-Garantieabgedeckt.*

Die TaqMan Copy Number Reference Assays sind separat erhältlich.

Empfohlener Mastermix (separat erhältlich):TaqMan Genotyping Mastermix

*Es gelten die allgemeinen Geschäftsbedingungen.Ausführliche Informationen finden Sie unter www.thermofisher.com/taqmanguarantee.

Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.

Specifications

3'-Primer-ModifizierungKeine

5'-Primer-ModifizierungKeine

Zur Verwendung mit (Geräte)7500 System, 7500 Fast System, 7900HT System, StepOne™, StepOnePlus™, ViiA™ 7 System, QuantStudio™ 3, QuantStudio™ 5, QuantStudio™ 6 Flex, QuantStudio™ 7 Flex, QuantStudio 6 Pro, QuantStudio 7 Pro, QuantStudio™ 12k Flex, QuantStudio™ Absolute Q Digital PCR System

Interne SondenmodifikationFAM (5'), MGB (Minor Groove Binder) (3')

Anzahl Reaktionen360 Reaktionen

ProduktlinieTaqMan

ProdukttypKopienzahlassay

ReinigungsverfahrenFestphasenextraktion (SPE)

Reinheits- oder QualitätsgradRNase-frei, DNase-frei

Menge360, 720 rxn(s)

VersandbedingungRaumtemperatur

SpeziesHuman

Volumen360 μl

Konzentration20X

NachweisverfahrenPrimer-Sonde

FormGefroren

Marker oder FarbstoffFAM

PCR-MethodeqPCR

ReaktionsgeschwindigkeitSchnell

Unit SizeEach

Inhalt und Lagerung

1 Röhrchen mit 20X (Größen S und M) oder 60X (Größe L) Mischung aus vorformuliertem Assay (1 Sonde und 2 Primer).

Bei -15 bis -25 °C lagern.

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Can I use the CopyCaller Software if I am using a non-Applied Biosystems Real-Time PCR instrument?

Yes, although the data will not be directly compatible. You can use the example files that install with the CopyCaller Software as a template to use with your data. You will have to copy/paste in the sample/target names and Ct values before importing into CopyCaller Software.

My data will not import into the CopyCaller Software. What could be wrong?

In the instrument software, make sure that you selected “Results” from the export options. The data need to be set up as duplex reactions as well. If you ran the copy number assay and the reference assay in separate wells, the data will not be in the correct format.

CopyCaller Software gave the error "XXX.txt is not a compatible file and cannot be added to the analysis. Verify that the file format is compatible with the software." What can I do now?

Check your export results with the instrument software. The data columns need to be in the following order: Well, Sample Name, Target Name, Task Reporter, Quencher, CT. If needed, rearrange the columns and export the data again for CopyCaller Software.

My results are different from what I expected when working with your Copy Number Variation Assay. Is there something wrong with the assay?

Check that the reference assay is performing consistently across all samples. Check the concentration of your samples and make sure they are normalized. We also recommend you to use several copy number assays targeting the same variation to validate the data.

What can I do if the copy number confidence values are very low?

Confidence values can be low for several reasons. Check your data for the following:

- Large variability in ΔCt values across the plate.
- Low number of replicates per sample (recommendation is for at least 4 replicates per sample).
- Sample copy number is high (> 3). You may want to use copy number bins instead for high copy numbers. Also keep in mind that CopyCaller Software is best for copy ranges of 1-5. If you have higher copy numbers, such as with transfections/transductions, it is best to use a standard curve.

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