Das BioPrime™ Komplettsystem für die Markierung genomischer DNA ist ein vollständiges Kit, das zur Markierung genomischer DNA für Anwendungen in arraybasierten vergleichenden genomischen Hybridisierungen (Array-CGH) unter Verwendung von formalinfixierten paraffineingebetteten (FFPE) Proben entwickelt wurde. Frühere Protokolle erfordern große Mengen von DNA von sehr hoher Qualität, die oft nur schwer aus FFPE-Material gewonnen werden kann. Mit einer RPA (Random Prime Amplification)-Methode, bei der speziell für FFPE-Proben formulierte Kennzeichnungsmischungen verwendet werden, erzeugt das BioPrime™ Total FFPE Genommarkierungssystem hohe Ausbeuten an markierter DNA, die für die Ausgangsprobe am repräsentativsten ist. Eine höhere Anrufgenauigkeit wird durch eine höhere Ausbeute an markiertem Material auf dem Array erreicht, wodurch Sie genauere Anrufe erhalten. Das BioPrime™ Gesamt-FFPE-Genommarkierungssystem bietet dem Anwender folgende Vorteile:

- Verbesserte Call-Rate mit einem höheren Signal-Rausch-Verhältnis von Alexa Fluor™ 3 und 5 Farbstoffen
- Die einfache Reinigung mit PureLink™ Aufreinigung macht komplizierte Schritte zur Volumenreduzierung überflüssig
- Weniger Kanalvorspannung durch verbesserte Reaktionsformulierung für FFPE-Proben
- Geringere Anforderungen an das Eingangsmaterial mit enzymatischer RPA-Methode


Dieses vollständige Komplettkit ist für die Verwendung in einem möglichst breiten Probenspektrum optimiert, ohne dass im Vorfeld eine Amplifikation erforderlich ist. Hochkonzentriertes Exo-Klenow-Fragment der DNA-Polymerase I in einer Reaktion mit begrenzten Komponenten ermöglicht konsistente, stabile DNA-Ausbeuten der genomischen FFPE-DNA-Input. BioPrime™ Total für Agilent™ aCGH wird mit einer Purelink™ Aufreinigung geliefert, die eine geringe Elution ermöglicht, wodurch komplizierte Schritte zur Volumenreduzierung überflüssig werden. Die Purelink™ Aufreinigung reduziert auch den Hintergrund durch Farbstoff, der in anderen Aufreinigungssystemen gefunden wurde. Ein optimiertes farbstoffmarkiertes Nukleotid-Gemisch mit neuen dNTP-Linkern, neuartigen, anwendungsspezifischen Alexa Fluor™ 3 und 5 Farbstoffen sowie eine verbesserte Pufferchemie reduzieren die Markierungsvariation und erhöhen das Signal-Rausch-Verhältnis auf Arrays. Anregungs- und Emissionsspektren von Alexa Fluor™ 3- und 5-Farbstoffen eignen sich für herkömmliche Zweifarb-Scanner, ohne dass Einstellungen geändert werden müssen. Komplette Kits werden chargengeprüft, um Qualität in der Leistung von Charge zu Charge zu gewährleisten.