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Das MagMAX™ Pflanzen-DNA-Isolierungskit wurde für die automatisierte Aufreinigung mit hohem Durchsatz oder die manuelle Aufreinigung von DNA aus einer Vielzahl von Pflanzenarten entwickelt. Das Kit verwendet die MagMAX Magnet-Bead-Technologie, wodurch Phenol-/Chloroformextraktion oder Alkoholausfällung überflüssig werden. Die Verfahren sind für die Isolierung von DNA aus 10–100 mg Pflanzenproben optimiert. Die DNA-Erträge variieren zwischen verschiedenen Spezies und Geweben je nach Genomgröße, Ploidie, Zellzahl, Alter der Gewebeprobe und Lagerungsbedingungen.
Das MagMAX Pflanzen-DNA-Isolierungskit basiert auf der Magnet-Bead-Technologie und ermöglicht reproduzierbare Erträge und eine robuste Leistung. Die hohe Bindungskapazität, die gleichmäßige Partikelgröße und die schnelle magnetische Reaktion der Beads machen die Technologie ideal für die automatische Nukleinsäure-Aufreinigung mit hohem Durchsatz sowie für die manuelle Aufreinigung bei geringem Probendurchsatz. Die dabei entstehende hochwertige DNA enthält keine Proteine, Nukleasen und anderen Kontaminanten oder Inhibitoren und kann in einem breiten Spektrum nachgeschalteter Anwendungen wie PCR, qPCR oder Next-Generation-Sequenzierung verwendet werden. Im Balkendiagramm unten sind typische Genom-DNA-Erträge aus verschiedenen Quellen dargestellt.
Merkmale des MagMAX Pflanzen-DNA-Isolierungskit sind u. a.:
• Vielseitig – Geeignet für jede Art und jeden Teil von Pflanzen, einschließlich holziger, polyphenolreicher und verholzter Proben
• Hohe DNA-Ausbeute – Im Vergleich zur herkömmlichen CTAB-Methode
• Hohe Qualität – Isolierung von DNA mit hoher Integrität, ohne Inhibitoren und RNA-Kontamination
• Flexibel – Einfach einstellbar für automatische Plattformen mit hohem Durchsatz und die manuelle Verarbeitung
Anwendungen
Isolierte DNA ist ideal für die Verwendung bei häufig angewendeten biologischen Verfahren, wie z. B.:
• qPCR
• Next-Generation-Sequenzierung
Vorteile der MagMAX Magnet-Bead-basierten Aufreinigung
Das Magnet-Bead-basierte Aufreinigungsformat des Kits ermöglicht eine einfache Skalierung der Anzahl der Proben, die entweder manuell mit einem magnetischen Ständer oder mit einem Magnetpartikelprozessoren wie dem KingFisher™ Duo Prime oder dem KingFisher™ Flex Prozessor verarbeitet werden.
Magnetische Beads bieten im Vergleich zu anderen Technologien für die Isolierung von Nukleinsäure viele Vorteile. Beads binden RNA und DNA effizienter als Glasfaserfilter, wodurch höhere und gleichmäßigere Erträge möglich sind. Da keine Filter und Vakuum-Sammelleitungen verwendet werden, besteht außerdem nicht die Gefahr, dass diese Elemente während des Extraktionsprozesses durch nicht digeriertes Gewebe verstopft werden. Dieses Verstopfungsproblem ist besonders bei faserigen Pflanzengewebeproben von Bedeutung, die während der Disruptions- und Homogenisierungsschritte nicht vollständig lysiert werden.
Optimierte Oberflächenchemie der Beads
Die Dynabeads™ MyOne™ Carboxylsäure, die im MagMAX Pflanzen-DNA-Kit verwendet wird, verfügt über eine optimierte Oberflächenchemie mit einer hohen spezifischen Oberfläche, die eine effiziente Kinetik und eine hohe Empfindlichkeit bei der Nukleinsäureaufnahme ermöglicht. Dank dieser Aspekte ist die Dynabeads Magnettechnologie ideal für die Rückgewinnung der DNA-Targets geeignet, die in einer Vielzahl von Pflanzenproben gefunden werden. Nach der Aufnahme wird die DNA dann in 150 µl eluiert und ist bereit für nachgeschaltete Anwendungen.