L'essai HCS Click-iT® ARN Alexa Fluor® 488 permet de détecter la transcription de l’ARN global temporellement et spatialement dans les cellules (PNAS (2008) 105:15779-84). La capacité de détecter des ARN nouvellement synthétisés ou des changements dans les niveaux d’ARN résultant de maladies, de dommages environnementaux ou de traitements médicamenteux est un aspect important du profilage toxicologique. Utilisant un nucléoside modifié par l’alcyne, le 5-éthynyl uridine (EU), et une chimie click puissante, l’ARN nouvellement synthétisé peut être détecté sans utilisation de radioactivité ou d’anticorps avec une procédure simple en deux étapes. Dans l’étape 1, le nucléoside contenant l’alcyne est administré à des cellules ou à des animaux et incorporé activement dans l’ARN naissant. La petite taille du tag permet l’incorporation efficace du nucléoside modifié dans l’ARN, mais pas dans l’ADN. La détection utilise la ligature chimiosélective ou la réaction “click entre un azoture et un alcyne où l’ARN modifié est détecté avec un colorant contenant de l’azoture. Grâce à son “empreinte dimunitive, la molécule de détection Click-iT® peut facilement pénétrer des échantillons complexes et offre la possibilité d’analyses multiples avec d’autres sondes, y compris des anticorps pour la détection de protéines interactives de l’ARN pour des perspectives biologiques plus approfondies.