Ion PGM™ Dx System
Ion PGM™ Dx System
Ion Torrent™

Ion PGM™ Dx System

El sistema Ion PGM™ Dx es una plataforma de secuenciación de última generación (NGS) de diagnóstico in vitro fiable yMás información
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Número de catálogoCantidad
A255111 System
Número de catálogo A25511
Precio (MXN)
-
Cantidad:
1 System
El sistema Ion PGM™ Dx es una plataforma de secuenciación de última generación (NGS) de diagnóstico in vitro fiable y sólida diseñada para ofrecer el rendimiento y la sencillez probados del sistema Ion Torrent™ PGM, al tiempo que permite a los laboratorios clínicos la flexibilidad de desarrollar ensayos de diagnóstico molecular para ayudar a satisfacer sus necesidades cambiantes.

El sistema Ion PGM™ Dx:
• Constituye una solución de sistema de instrumentos de NGS IVD rentable, simple e integral
• Permite un análisis de variantes genéticas altamente reproducible y preciso con solo 10 ng de ADN de entrada
• Proporciona un tiempo de respuesta rápido desde la muestra hasta el análisis de las variantes en <2 días
• Permite a los desarrolladores de ensayos de diagnóstico molecular la flexibilidad de publicar protocolos en un entorno de flujo de trabajo bloqueado
• Admite flujos de trabajo basados en funciones para ayudar a garantizar un nivel mayor de integridad en los resultados
• Compatible con flujos de trabajo basados en funciones para garantizar un mayor nivel de integridad de los resultados

Tecnología y rendimiento probados
El sistema Ion PGM™ Dx está basado en la tecnología probada de secuenciación de semiconductores de iones Ion Torrent™ Post-Light™, que está establecida y adoptada a nivel mundial en las ciencias biosanitarias y la investigación clínica. Con este sistema, la tecnología se ha perfeccionado y diseñado específicamente para ayudar a satisfacer las crecientes necesidades del entorno del laboratorio de diagnóstico. El sistema proporciona un conjunto integral de instrumentos, reactivos y consumibles. Además, cuenta con un software integrado que se ha desarrollado bajo un estricto control de diseño con un archivo de historial de diseño completo y se ha fabricado según los principios de buenas prácticas de fabricación para ayudar a garantizar el cumplimiento de las normas de rendimiento y calidad.

Los resultados generados con el sistema Ion PGM™ Dx demostraron ser altamente reproducibles en un estudio de validación en varios centros, usuarios y kits de reactivos. El rendimiento general del sistema fue excelente con una sensibilidad de SNV media de >99,5 %. El sistema se ha validado con variantes germinales complejas, mediante la generación de bibliotecas basada en la tecnología probada de Ion AmpliSeq™, lo que permite un análisis genético fiable y preciso incluso con cantidades de ADN de entrada de solo 10 ng.

Flexibilidad y capacidad de ampliación
La plataforma Ion PGM™ Dx proporciona a los laboratorios clínicos la flexibilidad y la capacidad de ampliación necesarias para desarrollar e implementar de forma fiable sus propios ensayos de diagnóstico molecular mediante el sistema Ion PGM™ Dx y los conjuntos de reactivos elaborados según los principios de buenas prácticas de fabricación, combinados con su elección de reactivos específicos para el analito. Gracias a la tecnología de generación de bibliotecas de PCR multiplex ultraalta de Ion Ampliseq™, el sistema permite a los desarrolladores de ensayos definir y personalizar sus conjuntos de primers de ensayo de cualquier tamaño de panel y validar, bloquear y publicar protocolos en un entorno de flujo de trabajo basado en funciones para su implementación en los usos habituales.

Flujo de trabajo sencillo y eficaz para maximizar el rendimiento
El sistema Ion PGM™ Dx ofrece la velocidad y la sencillez de la plataforma Ion Torrent™, junto con las principales ventajas del flujo de trabajo diseñadas específicamente para entornos de laboratorio regulados y aplicaciones de diagnóstico in vitro. Un instrumento y un flujo de trabajo de ensayo simplificados, así como un software intuitivo, automatizan aún más los tiempos de respuesta de las pruebas y proporcionan resultados rápidos de análisis de muestras a variantes en solo 2 días. Además, el flujo de trabajo validado permite la multiplexación de hasta 16 muestras en una sola secuencia, lo que lo convierte en una técnica rentable y flexible.

El software seguro integrado ayuda a garantizar resultados de alta fiabilidad
El software Ion PGM™ Dx Torrent Suite™ es un sistema de software integrado que gestiona y realiza un seguimiento de todo el proceso desde la definición de la muestra hasta el análisis de variantes, lo que proporciona una trazabilidad completa de los datos y una ejecución de análisis auditable, necesario para el cumplimiento de la norma 21CFR Parte 11. Con una interfaz de software intuitiva y fácil de usar, flujos de trabajo basados en funciones múltiples y un conjunto de controles de parámetros, el software ayuda a los laboratorios clínicos a mantener un nivel alto de rendimiento y contribuye a garantizar un nivel de integridad de los resultados mayor.

Las capacidades y características exclusivas del sistema Ion PGM™ Dx diseñado específicamente para entornos de laboratorio regulados lo convierten en una plataforma de secuenciación de última generación adecuada para casi todos los laboratorios de diagnóstico clínico.

Servicios y asistencia
Planes de servicio y asistencia técnica: Planes exhaustivos para maximizar el rendimiento de los instrumentos y garantizar la disponibilidad de los sistemas esenciales
Servicios de cualificación: documente y garantice que el instrumento se instala, opera y cumple con las especificaciones del fabricante
Formación: cursos de diseño experimental, análisis de datos, solución de problemas, aplicaciones y funcionamiento de instrumentos
Bioinformática: soporte diseñado para la ejecución de soluciones informáticas de NGS, el uso de software, los análisis de datos y las aplicaciones posteriores
Solución DataSafe: estrategia de almacenamiento y copia de seguridad, diseño, hardware y soporte para todos los datos de laboratorio

Uso previsto
El sistema Ion PGM™ Dx está compuesto por un instrumento de secuenciación que mide los iones de hidrógeno que se generan durante la incorporación de nucleótidos en la reacción de secuenciación de ADN y la instrumentación auxiliar necesaria para el procesamiento de las muestras. Este sistema de instrumentos se utiliza con el kit de bibliotecas Ion PGM™ Dx específico para el instrumento, el kit de plantillas Ion OneTouch™ Dx, el kit de secuenciación Ion PGM™ Dx, el kit de chips Ion 318™ Dx y el software de análisis de datos. El sistema de instrumentos Ion PGM™ Dx está diseñado para la secuenciación selectiva de ADN genómico humano a partir de muestras de sangre completa periférica. El sistema de instrumentos Ion PGM™ Dx no está diseñado para secuenciación de genoma completo o de novo.
Especificaciones
Para utilizar con (aplicación)Secuenciación
Para utilizar con (equipo)Ion PGM™ Dx System
Línea de productosIon PGM™ Dx
Tipo de productoDx System
Cantidad1 System
Condiciones de envíoTemperatura ambiente
Capacidad de procesamientoUp to 1 Gb per run
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
The Ion PGM™ Dx System includes the following:
• Ion PGM™ Dx Sequencer
• Ion OneTouch™ Dx Instrument
• Ion OneTouch™ ES Dx Instrument
• Ion PGM™ Dx Chip Minifuge
• Ion PGM™ Wireless Scanner
• Ion Torrent™ Server & Ion PGM™ Dx Torrent Suite™ Software

Preguntas frecuentes

What should I do if W1 fails at Raw Traces and the screen turns red during the last step of initialization of my Ion PGM System?

The pH of W1 may be out of range or the volume of W1 may be too small or there may have been a minor problem during measurement. Check the amount of W1, press the 'Start' button on the screen, and restart the measurement. If it passes, continue to start the run. If an error appears again, please note the pH of W1, the amount of W1, as well as the error message, and contact Technical Support.br/>
Please note that passing pH values for the reagents may vary depending on the sequencing kit used, but the instrument will automatically determine the correct pH range depending on the sequencing kit selected during initialization. If you are performing the reagent check outside of the initialization, please contact Technical Support for guidance.

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What are the types of next-generation sequencing data files and which should be archived?

Signal Processing Input - Required to reanalyze an Ion Torrent Ion PGM or Ion Torrent Ion Proton run from scratch. (The Output file category is also required).

Basecalling Input - Required to re-analyze an Ion PGM or Ion Proton run from basecalling. (The Output file category is also required).

Output - Required to see the run report in the Torrent Browser and either to reanalyze the run or to launch a plugin.

Intermediate - Useful to troubleshoot a run. Not required for the run report or for re-analysis.

Intermediate files can be deleted if not needed for run troubleshooting. Depending on your institution, you may need to keep all other files (Signal Processing, Basecalling, and Output).

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How do I change the barcoding set used to analyze a next-generation sequencing run?

Follow these steps to change the DNA barcode ID:

- Open a run reports listing in the “Data,” “Completed Runs & Reports” tab.
- In the list view, click the “Edit” button on the right side of the run listing. The Edit Run window opens.
- Click the barcode menu pull-down and choose the correct barcode set. If you have custom barcode sets, your list is different. Click the “Save” button (in the bottom right corner).
- You can now reanalyze the run from the “Data,” “Completed Runs & Reports” tab.

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How do I reanalyze my next-generation sequencing data with a different reference sequence?

Log in to Torrent Browser and click the “Data” tab, “Completed Runs & Reports page”, and find your run name. In the table view, click the “Reanalyze” option in the gear menu on the right of the run entry. The main run analysis dialog opens. Click the “Advanced” button to display the additional run parameter options. Click the “Alignment Reference” pull-down menu and select the reference for this run. (Optional) Change other advanced options if required. (See “Work with Completed Runs” for a description of the advanced fields.) Click the “Start Analysis” button.

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Why do I see the sequence GGCCAAGGCG at the beginning of the majority of the reads in my next-generation sequencing data analysis?

The GGCCAAGGCG sequence is part of the RNA library adapter sequence. This sequence can be automatically trimmed by the software by selecting the “RNA_Barcode_None” option under the Barcodes menu. The run can be reanalyzed with the correct barcode settings to trim the adapter sequence. In the future, the “RNA_Barcode_None” option should be selected in the run plan or selected on the instrument prior to starting the sequencing run.

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