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          • › C_167716362_10
          See other APOL3 GT Assays ›
          SNP ID:
          rs144755172
          Gene
          APOL3
          Gene Name
          apolipoprotein L3
          Set Membership:
          -
          Chromosome Location:
          Chr.22: 36141384 - 36141384 on Build GRCh38
          Polymorphism:
          A/G, Transition substitution
          Context Sequence [VIC/FAM]:

          TGCAAGGAAGATGCCTGAAGTGGTC[A/G]CACTCAGGATCCGGGCTCCTCTGCT

          Assay ID C_167716362_10
          Size
          Availability Made To Order
          Catalog # 4351379
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          Assay Details



          Species:

          Human

          dbSNP Submissions:

          NA

          Phenotype:

          MIM: 607253

          Literature Links:

          APOL3 PubMed Links

          Allele Nomenclature:

          Minor Allele Frequency:

          1000Genome Applied Biosystems® HapMap
          Global - Not Available Caucasian - Not Available CEPH (CEU) - Not Available
          EAS - Not Available African American - Not Available YRI (Yoruba) - Not Available
          SAS - Not Available Chinese - Not Available CHB (Han Chinese) - Not Available
          AFR - Not Available Japanese - Not Available JPT (Japanese) - Not Available
          EUR - Not Available
          AMR - Not Available
          APOL3 - apolipoprotein L3
          Transcript Accession SNP Location SNP Type Observed Codons Observed Amino Acid Protein ID
          NM_014349.2 1996 Missense Mutation GAG,GGG E,G 271 NP_055164.1
          NM_030644.1 1996 Missense Mutation GAG,GGG E,G 271 NP_085147.1
          NM_145639.1 1996 Missense Mutation GAG,GGG E,G 271 NP_663614.1
          NM_145640.2 1996 Missense Mutation GAG,GGG E,G 342 NP_663615.1
          NM_145641.2 1996 Missense Mutation GAG,GGG E,G 142 NP_663616.1
          NM_145642.2 1996 Missense Mutation GAG,GGG E,G 142 NP_663617.1
          XM_006724324.1 1996 Missense Mutation XP_006724387.1
          XM_006724325.2 1996 Missense Mutation XP_006724388.1
          XM_017028946.1 1996 Missense Mutation XP_016884435.1
          XM_017028947.1 1996 Missense Mutation XP_016884436.1
          XM_017028948.1 1996 Missense Mutation XP_016884437.1
          XM_017028949.1 1996 Missense Mutation XP_016884438.1
          XM_017028950.1 1996 Missense Mutation XP_016884439.1
          XM_017028951.1 1996 Missense Mutation XP_016884440.1
          XM_017028952.1 1996 Missense Mutation XP_016884441.1

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          More Information


          Panther Classification:

          Molecular Function -

          apolipoprotein

          Gene Ontology Categories:

          Function(s) Process(es)

          lipid transport
          inflammatory response
          signal transduction
          lipoprotein metabolic process
          positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
          signal transducer activity
          lipid transporter activity
          lipid binding

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