サンガーデータ解析

サンガーシーケンシングおよびフラグメント解析の結果の表示や分析ができる様々なApplied Biosystems™ソフトウェアを提供しています。弊社が提供している以下の無料ツールと市販のソフトウェアをご覧ください。

ソフトウェアに関するサポートをお求めの場合、
Capillary Electrophoresis Software Support Centerをご覧下さい。

Data Collectionソフトウェア

ソフトウェア名 詳細 対応オペレーティングシステム

Applied Biosystems™ Data Collection Software

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最新バージョンにアップグレード

Data Collectionソフトウェアは、装置のコントロール、およびサンプルのデータ収集、精度管理、ベースコーリング、サイズコーリングのための統合ソフトウェアです。装置の操作は、このソフトウェアで行います。

Windows™ 7

サンガーシーケンシングソフトウェア

閲覧ソフトウェア
ソフトウェア名 詳細 対応オペレーティングシステム

Applied Biosystems™ Sequence Scanner Software  v2.0

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Sequence Scanner Softwareは、Applied Biosystems™ジェネティックアナライザで生成され、Sequencing Analysis Softwareで解析されたデータを表示、編集、印刷、およびエクスポートするがことができます。

Windows 7

Applied Biosystems™ Quality Check Module

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Quality Check(QC)Moduleは、シーケンスデータのクオリティを評価します。みやすい分析レポートを生成し、サンガーシーケンスデータのクオリティレポートが得られます。Trace Detailsページからは、必要に応じてシーケンス波形を評価、編集もできます。Flag Settingsページでは、クオリティ評価の閾値の調整ができます。 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス
一次解析ツール
ソフトウェア名 詳細 対応オペレーティングシステム

Applied Biosystems™ Sequencing Analysis Software v6.0

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Sequencing Analysis Softwareは、ベースコーラー・アルゴリズムを用いて、単一および混合塩基のベースコーリングを行います。このソフトウェアは、Applied Biosystems DNAアナライザおよびジェネティックアナライザから生成されたサンプルファイルの解析、表示、編集、保存および印刷ができます。

Windows 7
二次解析ツール
ソフトウェア名 詳細 対応オペレーティングシステム

Applied Biosystems™ Minor Variant Finder Software

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Minor Variant Finder Softwareはサンガーシーケンシングで5%の体細胞変異の検出を可能にします。向上した検出感度により、サンガーシーケンシングは、比較的少ないサンプル数の低頻度変異を迅速、低コスト、正確に検出できるようになります。

Windows 7 SP1, 32-bit or 64-bit or Windows 10 Pro, 64-bit

Applied Biosystems™ SeqScape™ Software v3.0

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SeqScape Softwareは、突然変異の検出と分析、 SNPの発見と検証、病原体のサブタイピング、対立遺伝子の同定、および、シーケンス確認が可能なリシーケンシング解析のソフトウェアです。既知グループのシーケンスと比較するためのライブラリ検索機能、また、臨床研究ラボで重要となり得る21 CFR Part 11 コンプライアンス(セキュリティ、監査および電子署名機能)を支援する機能を提供します。 Windows 7

Applied Biosystems™ Variant Reporter™ Software v2.0

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Variant Reporter Softwareは、変異の検出と分析、 SNPの発見と検証、および、シーケンス確認といったリファレンスベース、または、非リファレンスベースの解析を行うソフトウェアです。ロバストなアルゴリズムにより、Applied Biosystemsジェネティックアナライザを用いて生成されたデータのSNPs、変異、挿入、欠失、および、ヘテロ接合性の挿入/欠失をコールします。 Windows 7

Applied Biosystems™ Variant Analysis (VA) Module

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Variant Analysis (VA) Moduleは、サンガーシーケンシングデータの迅速な分析を行います。VA Module はゲノムデータベースからリファレンスシーケンスを自動でダウンロードし、ゲノム座標情報を元に変異の検出やSNPsのゲノムアノテーションのレポートを行うことができます。重複したフォワード/リバース鎖のシーケンシングデータにより、VA ModuleはSNPコールを非常に高い感度で行います。また、VA Moduleは変異ファイルを標準的な.vcfフォーマットでレポートおよびエクスポートします。ユーザーがソフトウェアのメンテナンスを行う必要はありません。 無料でThermo Fisher Cloudからアクセス

Applied Biosystems™ Next Generation Confirmation (NGC) Module

サインイン

Next-Generation Confirmation(NGC)Moduleによりユーザーは、Thermo Fisher Cloud上で、標準的なNGS変異ファイルの結果とサンガーケーシングの結果を比較することができます。
結果を正確に解釈するには、NGSの結果をロバストなサンガーシーケンスで検証する必要があります。NGC ModuleはAB1ファイルの迅速な分析を行い、ゲノム座標情報を元に変異をレポートします。結果は、自動でゲノムデータベースから既知SNPがアノテーションされます。
無料でThermo Fisher Cloudからアクセス

Applied Biosystems™ MicroSEQ™ ID Microbial Identification Software

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MicroSEQ ID Microbial Identification Softwareは、細菌や真菌の同定のためのツールです。このソフトウェアは、MicroSEQケミストリーキットおよびApplied Biosystemsジェネティックアナライザを用いて生成されたデータを解析します。 Windows 7

Applied Biosystems™ MicrobeBridge™ Software

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MicrobeBridge Softwareは合理化されたデスクトップソフトウェアであり、Applied Biosystems ジェネティックアナライザで生成されたDNA配列をCenters for Disease Control and Prevention (CDC)のMicrobeNetデータベース™と比較し、16S rRNA遺伝子配列解析で細菌の同定を行います。ローカルでのデータベースのセットアップが不要なため、コンピュータリソースの開発が容易です。 Windows 7
フラグメント解析ソフトウェア
サイジングソフトウェア
ソフトウェア名 詳細 対応オペレーティングシステム

Applied Biosystems™ Peak Scanner™ Software

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Peak Scanner SoftwareはDNAサイジングソフトウェアで、ソフトウェアを 無料でダウンロード できます。

このソフトウェアを用いてDNAフラグメント解析を行います。サイズに応じてDNAフラグメントを分離し、そのプロファイルを表示し、フラグメントのサイズを正確に計算します。このソフトウェアにより、Applied Biosystemsジェネティックアナライザを用いて生成されたフラグメント解析データを表示、編集、分析、印刷およびエクスポートできます。

Windows 7

Applied Biosystems™ GeneMapper™ Software 5

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GeneMapper Softwareは、フレキシブルなジェノタイピングソフトウェアパッケージで、全てのApplied Biosystems ジェネティックアナライザのデータに対し、DNAサイズおよびアレルコールをレポートします。 このソフトウェアは、複数のアプリケーションの解析に対応しており、Amplified Fragment Length Polymorphism(AFLP ™)、ヘテロ接合性欠失(LOH) 、マイクロサテライト、およびSNPジェノタイピング解析を含みます。また、セキュリティと監査機能もあり、21 CFR 11の要件を満たせるようユーザーを支援します。 Windows 7
プライマーデザインツール
ソフトウェア名 詳細 対応オペレーティングシステム

Applied Biosystems™ Primer Designer™ Tool

ツールにアクセスする(日本国内は未対応)

無料のオンラインPrimer Designer Toolを使用すると、ヒトのエキソームおよびヒトのミトコンドリアゲノムのシーケンス用にプレデザインされた最大65万対のプライマーペアのデータベースから、ニーズに合ったPCR およびサンガーシーケンシング用のプライマーペアを検索することができます。

ウェブツール

Applied Biosystems™ Methyl Primer Express™ Software v1.0

ソフトウェアのダウンロード

Methyl Primer Express Software v1.0を用いて、メチレーションマッピング実験用の高クオリティなPCRプライマーを設計することができます。目的の領域をカットしてペーストするだけです。このツールはCpGアイランドを探して、in silicoでDNAのバイサルファイト変換をシミュレート します。