MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit

Das MagMAX™ FFPE DNA/RNA-Ultra-Kit wurde für die sequenzielle Isolierung von DNA und RNA aus derselben Formaldehyd- oder Paraformaldehyd-fixierten, paraffineingebetteten (FFPE) Gewebeprobe entwickelt. Die DNA und RNA werden in separaten Eluaten gewonnen. Beide sind mit einer Vielzahl von Anwendungen kompatibel, darunter Echtzeit-PCR und Sequenzierung der nächsten Generation. Die Isolierung von RNA und DNA aus derselben FFPE-Probe macht dieses Kit zur idealen Methode für die Probenvorbereitung für ONCOMINE™ Comprehensive und ONCOMINE™ Focus Assays.

Zu den Merkmalen des MagMAX FFPE DNA/RNA-Ultra-Kits gehören:
• Flexibles Design, das sowohl die manuelle als auch die automatisierte Isolierung von RNA und DNA ermöglicht
• Minimaler Bedarf eines 5 µM-Abschnitts oder -Curls
• Verarbeitung von 40 µM-FFPE-Abschnitten oder -Curls; mehr als 40 µM große Abschnitte können mit einem alternativen Protokoll verarbeitet werden
• Kompatibel mit gezielten RNA- und DNA-Sequenzierungs-Panels
• Enthält Dynabeads™ MyOne™ Silan für eine konsistente Isolierung von RNA, microRNA sowie DNA
• Alternative Protokolle für die Isolierung nur von RNA oder DNA

Die Entschlüsselung der Informationen in FFPE-Proben ist für die Krebsforschung unerlässlich. Bei herkömmlichen Methoden zur Nukleinsäureisolierung müssen Sie entscheiden, welche Nukleinsäure aus einer bestimmten Probe gewonnen werden soll, wobei die andere Nukleinsäure verloren geht (und alle Informationen, die Sie durch ihre Analyse hätten gewinnen können). Alternativ werden DNA und RNA gleichzeitig gereinigt oder die Probe halbiert, sodass jede gereinigt werden kann.

Mehr Informationen bei geringerer Probenzugabe
Das MagMAX FFPE DNA/RNA-Ultra-Kit-Protokoll ist die Lösung für dieses Problem. Es isoliert zuerst die DNA aus der FFPE-Probe und dann die RNA aus dem DNA-freien Überstand. Die Nukleinsäuren werden als separate Eluate aufbereitet und sind daraufhin für die nachfolgende Analyse bereit. Dies ermöglicht eine umfassendere Analyse wertvoller Proben, einschließlich der Untersuchung wichtiger Biomarker wie Hotspot-Mutationen, CNVs, Genfusionen und Indels.

Vorteile der MagMAX Magnet-Bead-basierten Reinigung
Das magnetische Bead-basierte Aufreinigungsformat des Kits ermöglicht die einfache Skalierung der Anzahl der Proben, die entweder manuell mit einem Magnetständer oder mit einem Magnetpartikelprozessor wie dem KingFisher™ Duo Prime oder dem KingFisher™ Flex Prozessor verarbeitet werden.

Magnetbeads bieten im Vergleich zu anderen Technologien zur Isolierung von Nukleinsäuren viele Vorteile. Beads binden RNA und DNA effizienter als Glasfaserfilter, wodurch höhere und gleichmäßigere Erträge möglich sind. Da keine Filter und Vakuum-Sammelleitungen verwendet werden, besteht außerdem nicht die Gefahr, dass diese Elemente während des Extraktionsprozesses durch nicht digeriertes Gewebe verstopft werden. Dieses Verstopfungsproblem ist besonders bei faserigen FFPE-Gewebeproben problematisch, die während der Proteinase-K-Behandlung nicht vollständig aufgespaltet werden.

Optimierte Bead-Oberflächenchemie
Das Dynabeads MyOne Silan, das im MagMAX FFPE DNA/RNA-Ultra-Kit enthalten ist, verfügt über eine optimierte Silika-ähnliche Oberflächenchemie mit einer hohen spezifischen Oberfläche, die eine effiziente Kinetik und hohe Empfindlichkeit bei der Nukleinsäure-Erfassung ermöglicht. Diese Aspekte machen Dynabeads MyOne Silan ideal für die Rückgewinnung von RNA- und DNA-Targets, die in FFPE-Proben vorhanden sind. Nach der Aufnahme werden beide Nukleinsäuren separat in Volumina von 50 µl eluiert, um sie für Downstream-Prozesse vorzubereiten.