Le kit bibliothèque Ion AmpliSeq™ 2.0 est conçu pour préparer rapidement des bibliothèques d’amplicons en utilisant les panels et les groupes d’amorces sur mesure prêts à l’emploi Ion AmpliSeq™ pour un séquençage sur le système Ion Personal Genome Machine™ (PGM™). Cette nouvelle version “LV” du kit est configurée pour des volumes de réactifs importants, ce qui la rend idéale pour les protocoles automatiques de préparation de bibliothèques d’ADN. Le kit peut également être utilisé avec des protocoles manuels. Cette nouvelle version remplace la précédente version “non-LV” (No de catalogue 4478378).

Caractéristiques Principales :

Nouveau protocole simple
• Le flux de travaux basé sur une plaque de 96 puits permet la gestion facile des échantillons
• Une seule étape de nettoyage requise, ce qui réduit le temps de manipulation
• Pas d’amplification de bibliothèque avec l’évaluation quantitative qPCR

Nouveau mélange maître Ion AmpliSeq™ HiFi
• Permet une amplification plus propre pour une meilleure uniformité de couverture
• Une PCR allant jusqu’à 3 072 plex permet des conceptions de panneaux plus grands

Nouveau réactif de digestion
• Un produit digéré plus propre permet un séquençage plus efficace en aval

Des réactions PCR multiplex évolutives
La technologie Ion AmpliSeq™ 2.0 permet d’effectuer des réactions de PCR multiplex évolutives de 12 à 3 072 plex dans un puits unique en n’utilisant que 10 ng d’ADN de départ. Les panels et les groupes d’amorces Ion AmpliSeq™ permettent l’amplification PCR multiplexée de milliers de régions génomiques cibles, avec une uniformité et une spécificité de couverture supérieure, sans avoir besoin de recourir à une plateforme de PCR microfluidique spécialisée. De plus, les amorces contiennent des modifications exclusives qui permettent l’élimination de séquences d’amorce lors de la préparation de bibliothèques, pour une évaluation efficace des cibles lors du séquençage. Plusieurs groupes d’amorces peuvent être utilisés pour créer des amplicons se chevauchant qui permettent une couverture complète de grandes cibles Les groupes d’amorces sur mesure Ion AmpliSeq™ sont conçus par l’intermédiaire du logiciel en ligne Ion AmpliSeq™ Designer, disponible sur www.ampliseq.com.

Préparation de bibliothèques à code-barres
Le kit bibliothèque Ion AmpliSeq™ 2.0 comprend des réactifs pour la génération d’amplicons avec des amorces Ion AmpliSeq™ et la préparation de bibliothèques à partir des amplicons obtenus. Ce kit permet de préparer des bibliothèques à code-barres à l’aide des kits d’adaptateurs de code-barres Ion Xpress™ 1 à 96. Les bibliothèques à code-barres peuvent être combinées et chargées dans une seule puce Ion pour minimiser le temps et le coût d’exécution du séquençage et permettre des comparaisons précises entre échantillons.

Protocole facile et flexible
Le kit bibliothèque Ion AmpliSeq™ 2.0 utilise un format basé sur une plaque pour faciliter la manipulation et le suivi des échantillons et pour assurer la compatibilité avec les laboratoires automatisés et à haut débit. La préparation de bibliothèques est terminée en seulement 3,5 heures à l’aide de 10 ng d’ADN par PCR. Par ailleurs, de l’ADN provenant de diverses sources, notamment du tissu fixé avec de la formaline et enrobé de paraffine (FFPE), peut être utilisé comme produit de départ.

Les bibliothèques d’ADN qui en résultent sont prêtes pour la préparation d’un modèle en aval pour l’amplification clonale sur les particules Ion Sphere™ à l’aide du système automatisé Ion OneTouch™. Le logiciel Torrent Suite intuitif et le logiciel Ion Reporter en option vous permettent de passer d’ADN extrait à des classifications de variantes en à peine 10 heures.