Les kits de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Invitrogen Collibri sont conçus pour le séquençage de nouvelle génération (NGS) sur les systèmes Illumina. Le kit prend en charge les applications de séquençage de transcriptome entier (humain, souris, rat) et le séquençage de l’ARNm (compatible avec toutes les espèces).

Kit de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Collibri :
• Comprend tous les composants nécessaires dans un kit unique* pour une utilisation rapide
• ARN total converti en bibliothèque prête au séquençage en moins de 4,5 heures
• >98 % de spécificité de brin, détection efficace de l’ARN non codant et haute sensibilité de l’expression génétique différentielle
• Fournit un retour visuel en cours pour un traitement plus facile
• Convient à l’automatisation conventionnelle pour augmenter le débit

Le kit de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Invitrogen Collibri pour les systèmes Illumina est conçu pour la construction robuste de bibliothèques d’ADNc pour le séquençage d’ARN spécifique au brin sur les systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) Illumina. Le kit regroupe les caractéristiques supérieures de la transcriptase inverse SuperScript IV, des particules magnétiques Dynabeads et de l’ADN polymérase Platinum SuperFi, permettant aux utilisateurs d’obtenir des bibliothèques prêtes à l’emploi pour le séquençage de haute qualité. Ce kit de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Collibri prend en charge la préparation rapide de la bibliothèque en moins de 4,5 heures pour les bibliothèques d’ARNm ou de transcriptome entier avec 1 à 25 ng d’entrée d’échantillons d’ARN enrichi en ARNm ou appauvri en ribo. Le multiplexage des bibliothèques peut être effectué à l’aide de 96 amorces à double indexation unique ou à indexation unique, permettant un séquençage à lecture simple ou à extrémité appariée. Le kit convient aux échantillons d’ARN de qualité différente, y compris les échantillons FFPE.

Signaux visuels d’intégrité du processus
Pour un maximum de commodité, des signaux visuels de l’intégrité des processus sont inclus dans tout le flux de travail de préparation pour bibliothèque. Surveillez l’évolution de la génération de bibliothèque à l’aide des retours d’information visuelle des colorants dans les réactifs critiques. Le mélange de réaction change de couleur en réponse à l’ajout de composants critiques à chaque étape afin de s’assurer que la préparation de la bibliothèque a les plus grandes chances de succès. Les colorants inertes n’interfèrent pas avec les réactions enzymatiques et ne compromettent pas les résultats de séquençage.

Fonctionnement
Les adaptateurs compatibles avec Illumina pleine longueur sont introduits par amplification par PCR à l’aide de l’ADN polymérase Platinum SuperFi pour construire des bibliothèques à double indexation unique ou à simple indexation compatibles avec le séquençage à lecture simple ou à extrémité appariée. Le kit contient 24 ou 96 amorces PCR à code-barres (i7) indexées individuellement pré-mélangées avec un amorceur i5 universel ou des amorces PCR à double indexation uniques qui permettent le multiplexage de 96 bibliothèques maximum. Les étapes de nettoyage optimisées éliminent efficacement les amorces résiduelles et les dimères d’adaptateur / d’amorce tout en préservant les rendements élevés de la bibliothèque.

Un produit associé, le kit de quantification de la bibliothèque Collibri, est recommandé pour la quantification de bibliothèques basées sur la qPCR avant de procéder au séquençage.

Applications
Le kit de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Collibri est recommandé pour :
• Études d’expression génétique
• Analyse d’épissage alternatif
• Détection et découverte d’ARN non codant
• Identification de sites de polyadénylation alternatifs
• Détection de fusion génétique
• Détection d’isoformes de transcription

* Le kit consiste en des modules contenant des adaptateurs indexés, de modification enzymatique, de nettoyage/sélection de taille. Un module supplémentaire d’appauvrissement en ribo de l’ARNr humain/souris/rat peut également être inclus.