甲基化分析
由于DNA扩增中不会保留 CpG DNA甲基化,因此甲基化研究要求在DNA测序之前处理DNA时保留或选择甲基化状态。 用于甲基化分析的DNA制备技术包括:通过亲和富集选择甲基化的DNA,使用甲基化敏感的酶进行酶处理,或者使用亚硫酸氢盐对DNA进行化学处理。
  染色质免疫共沉淀测序 (ChIP-Seq)
DNA粘附蛋白会影响基因表达以及DNA的包装和可接近性。 要研究这些相互作用,可采用染色质免疫沉淀 (ChIP) 将蛋白质–DNA复合物分离,然后对相关 DNA测序,最终确定其特征。 此方法叫做ChIP测序。
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