Das Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0 ist für die schnelle Vorbereitung von Amplicon-Bibliotheken mithilfe von Ion AmpliSeq™ gebrauchsfertigen Panels und individuellen Primer-Pools zur Sequenzierung auf dem Ion Personal Genome Machine™ (PGM™) System konzipiert. Diese neue „LV“-Version des Kits ist für große Reagenzienvolumina konfiguriert, wodurch sie sich hervorragend für die automatisierte Vorbereitung von DNA-Bibliotheken eignet. Außerdem kann sie mit manuellen Protokollen eingesetzt werden. Diese neue Version ersetzt die bisherige „Nicht-LV“-Version (Bestellnr. 4478378).

Hauptmerkmale:

Neues einfaches Protokoll
• Arbeitsablauf mit 96-Well-Platte ermöglicht einfaches Probenmanagement
• Nur 1 Reinigungsschritt erforderlich und damit verkürzter Arbeitsaufwand
• Keine Bibliotheksamplifikation mit qPCR-Quantifizierung

Neuer Ion AmpliSeq™ HiFi Master Mix
• Ermöglicht sauberere Amplifikation und damit höhere Abdeckungshomogenität
• Bis zu 3.072-plex-PCR ermöglicht größere Panel-Designs

Neues Aufschluss-Reagenz
• Sauberer Aufschluss steigert die Effizienz der nachfolgenden Sequenzierung

Skalierbare Multiplex-PCR-Reaktionen
Die Ion AmpliSeq™ 2.0-Technologie ermöglicht skalierbare Multiplex-PCR-Reaktionen von 12- bis 3.072-plex in einem einzigen Well mit nur 10 ng Start-DNA. Ion AmpliSeq™ Panels und Primer-Pools ermöglichen die hohe Multiplex-PCR-Amplifikation von Tausenden genomischer Zielbereiche mit hoher Abdeckungshomogenität und -spezifität, und ohne spezielle Mikrofluidik-PCR-Plattform. Darüber hinaus ermöglichen proprietäre Modifikationen der Primer das Entfernen von Sequenzierprimern während der Bibliotheksvorbereitung und damit eine effiziente Analysebewertung während der Sequenzierung. Mehrere Primer-Pools können verwendet werden, um überlappende Amplifikate zu erstellen, die eine komplette Abdeckung großer Zielsequenzen ermöglichen. Ion AmpliSeq™ individuelle Primer-Pools werden mit der internetgestützten Ion AmpliSeq™ Designer-Software entwickelt, die unter www.ampliseq.com verfügbar ist.

Vorbereitung von Bibliotheken mit Barcode
Das Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0 umfasst Reagenzien zur Erzeugung von Ampliconen mit Ion AmpliSeq™ Primern und hilft bei der Vorbereitung von Bibliotheken aus den resultierenden Ampliconen. Das Kit ermöglicht die Vorbereitung von Bibliotheken mit Strichcode über die Ion Xpress™ Barcode Adapter 1–96 Kits. Bibliotheken mit Barcode können kombiniert und auf einen einzigen Ion-Chip geladen werden, um Laufzeit und Kosten der Sequenzierung zu minimieren und genaue Vergleiche von Probe zu Probe durchzuführen.

Einfaches und flexibles Protokoll
Das Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0 nutzt ein Platten-basiertes Format zur Vereinfachung der Probenhandhabung und -überwachung, der Kompatibilität mit Automatisierungsabläufen und für Labore mit hohem Durchsatz. Die Bibliotheksvorbereitung erfolgt in nur 3,5 Stunden und mit 10 ng DNA pro PCR, mit DNA aus unterschiedlichen Quellen – auch Formalin-fixierte und in Paraffin eingebettete (FFPE) Gewebeproben können als Ausgangsmaterial verwendet werden.

Die resultierenden DNA-Bibliotheken sind bereit für die nachfolgende Vorlagenvorbereitung für die klonale Amplifikation auf Ion Sphere™ Partikeln mit dem automatischen Ion OneTouch™ System. Mit der intuitiven Torrent Suite Software und dem optionalen Ion Reporter gelangen Sie in nur 10 Stunden von der extrahierten DNA zum Erfassen der „Variant Calls“.