简化复杂通路的分析和筛选 | Thermo Fisher Scientific

预制的TaqMan OpenArray®基因通路芯片

行业金标准 —— 芯片预置Taqman Assay，拥有极佳的精确度
高灵敏度 —— 可检测ng级别的样本
检测范围广 —— 能筛选超过几百种与疾病通路相关的基因
简单的流程 —— 只需加入样本和预混液，就可运行检测品

OpenArray芯片技术采用纳升流技术平台，可用于超小体积的液相反应。每张芯片有3072反应孔，预制基因通路芯片将金标准的TaqMan Assay预包埋在每个反应孔中，芯片包含数百种基因的Assay。一次运行，可检测数百个位点，轻松完成复杂的基因通路分析。让您进行高通量的筛选分析的同时，获得高质量的qPCR数据。

TaqMan® OpenArray®人类癌症芯片

包含624种与癌症高度相关的基因。该芯片覆盖了与DNA修复、血管生成、细胞粘连、细胞外基质、细胞周期、细胞凋亡、编码基因和编码转录因子等相关的基因。另外还有24个参考基因，用于数据标准化。一张芯片可根据重复数检测1-4个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类癌症芯片的Assay种类及数量

基因种类	基因数量
参考基因	24
与肿瘤相关的基因	121
细胞周期调控因子	105
生长、增殖、分化因子	180
细胞粘连、运动调控因子	79
与肿瘤发展相关的细胞信号因子	289
肿瘤发生的其他基因	194

TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片

该芯片用于检测药物代谢酶和转运蛋白的编码基因，为药物相互作用研究提供高价值的数据。该芯片包括158个Assay，可检测29个基因。包括与心血管(CYP2D6, CYP2C19,NAT1, NAT2),镇痛药 (CYP2C9,CYP2D6),风湿病学 (CYP2C9,TPMT),神经病学(CYP2C19, CYP2D6),骨骼肌 (CYP2C19)等相关的基因。一张芯片最多可检测16样本。

TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片的Assay种类及数量

PharmaADME 分类	基因数量	典型的基因
阶段一	12	CYP1A1, CYP1A2, CYP2A6, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E1,CYP3A4, CYP3A5, DPYD
阶段二	6	GSTP1, NAT1, NAT2, UGT1A1, UGT2B7, UGT2B15
转运蛋白	11	ABCB1, ABCC2, ABCG2, SLC15A2, SLC22A1, SLC22A2, SLC22A6, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO2B1, TPMT

TaqMan® OpenArray®人类干细胞芯片

该芯片可检测与人类干细胞及其衍生物相关的标记基因。包括了609个经过验证的基因表达标记物和22个参考基因位点，可精确分析人类胚胎干细胞及其不同的细胞提取物的表征特异性。一张芯片可根据重复数检测1-4个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类干细胞芯片Assay种类及数量

基因种类	基因数量	典型的基因
未分化的细胞中表达的基因	6	NANOG, POU5F1, TDGF1, DNMT3B, GABRB3, and GDF3
维持细胞多能性	3	NANOG, POU5F1, and SOX2
干细胞相关的基因	33	BRIX, CD9, COMMD3, CRABP2, EBAF, FGF4, FGF5, FOXD3, GAL, GBX2, GRB7, IFITM1, IFITM2, IL6ST,IMP2, KIT, LEFTB, LIFR, LIN28, NODAL, NOG, NR5A2, NR6A1, PODXL, PTEN, REST, SEMA3A, SFRP2,TERT, TFCP2L1, UTF1, Xist, and ZFP42
细胞分化的标记物	50	ACTC, AFP, CD34, CDH5, CDX2, CGB, COL1A1, COL2A1, DDX4, DES, EOMES, FLT1, FN1, FOX A2, GATA4,GATA6, GCG, GCM1, GFAP, HBB, HBZ, HLXB9, IAPP, INS, IPF1, ISL1, KRT1, LAMA1, LAMB1, LAMC1,MYF5, MYOD1, NES, NEUROD1, NPPA, OLIG-2, PA X4, PA X6, PECAM1, PTF1A, RUNX2, SERPINA1,SOX17, SST, SYCP3, SYP, T, TAT, TH, and WT1
参考基因	3	ACTB, RAF1, CTNNB1, GAPD, EEF1A1, and 18S

TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片

包括两种格式为32的芯片(32A和32B)和一种64SNP的芯片，32A芯片包括3个Y染色体的SNP位点和29个常染色体的SNP位点。这可以用于生物资源应用中的个体样本鉴定。32A芯片足以准确的鉴定大多数的样本。
如果需要更高密度更全面的标记，可加上32B芯片或选择64格式的芯片。32格式芯片可检测96个样本，64格式芯片可检测48个样本。

TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片的SNP Assay列表

						HapMap*
SNP ID (rs)	TaqMan® Assay ID	Chr	Mb	Allele 1	Allele 2	Average Freq 1	Average Freq 2	N
32A SNP panel
rs3010325	C___2728408_10	1	59.34	C	T	0.51	0.49	2404
rs2136241	C___1563023_10	1	161.56	C	T	0.47	0.53	2404
rs2259397	C__15935210_10	1	206.14	T	C	0.52	0.48	2402
rs7564899	C__33211212_10	2	11.12	G	A	0.48	0.52	2406
rs4971536	C___3227711_10	2	20.95	C	T	0.49	0.51	2406
rs10194978	C__30044763_10	2	50.38	G	A	0.50	0.50	2402
rs4855056	C__11821218_10	3	183.12	A	G	0.50	0.50	2404
rs6554653	C___1670459_10	5	11.92	C	T	0.51	0.49	2404
rs9396715	C__29619553_10	6	10.02	T	C	0.51	0.49	2406
rs441460	C___1007630_10	6	25.66	G	A	0.52	0.48	2402
rs7773994	C__26546714_10	6	37.68	T	G	0.53	0.47	2398
rs1415762	C___7421900_10	6	125.08	C	T	0.54	0.46	2392
rs6927758	C__27402849_10	6	163.64	C	T	0.49	0.51	2400
rs7796391	C___2953330_10	7	125.90	A	G	0.51	0.49	2402
rs2336695	C__16205730_10	8	1.02	A	G	0.49	0.51	2404
rs1157213	C___8850710_10	8	104.28	T	C	0.50	0.50	2406
rs10869955	C___1801627_10	9	79.48	C	A	0.48	0.52	2402
rs1533486	C___7431888_10	10	1.50	T	G	0.48	0.52	2404
rs4751955	C___1250735_10	10	117.91	A	G	0.47	0.53	2406
rs10771010	C___1902433_10	12	23.66	T	C	0.52	0.48	2392
rs12318959	C__31386842_10	12	28.67	C	T	0.53	0.47	2394
rs3742257	C__26524789_10	13	42.07	T	C	0.47	0.53	2404
rs1377935	C___8924366_10	14	24.91	T	C	0.50	0.50	2406
rs946065	C_____43852_10	14	55.00	C	A	0.48	0.52	2404
rs6598531	C__11522992_10	15	96.95	T	G	0.53	0.47	2402
rs4783229	C__10076371_10	16	81.18	T	C	0.49	0.51	2406
rs1567612	C___7457509_10	18	34.09	G	A	0.51	0.49	2362
rs1567612	C___1122315_10	18	40.74	A	G	0.51	0.49	2406
rs11083515	C__11710129_10	19	44.39	A	G	0.47	0.53	2400
rs768983**	C___1027548_10	Y	6.88
rs3913290**	C___8938211_10	Y	8.66
rs2032598**	C___1083232_10	Y	13.36
32B SNP panel
rs6427699	C__29222350_10	1	161.16	G	A	0.50	0.50	2400
rs891700	C___7539584_10	1	237.95	A	G	0.49	0.51	2404
rs7588807	C___7539584_10	1	237.95	A	G	0.49	0.51	2404
rs7588807	C___3036007_10	3	15.50	T	C	0.52	0.48	2406
rs6791084	C___1525594_10	3	30.10	G	A	0.46	0.54	2406
rs10938367	C____233438_10	4	44.53	G	A	0.51	0.49	2402
rs2561183	C___2934686_10	5	68.77	C	A	0.52	0.48	2406
rs2560588	C___2934686_10	5	68.77	C	A	0.52	0.48	2406
rs245057	C___3221475_10	5	149.32	C	A	0.49	0.51	2392
rs9395021	C__30289524_10	6	44.55	C	T	0.53	0.47	2406
rs1337823	C__30289524_10	6	44.55	C	T	0.53	0.47	2406
rs974110	C___8307036_10	6	66.17	A	G	0.50	0.50	2400
rs2268666	C__15875060_10	6	146.79	C	T	0.45	0.55	2406
rs2189730	C__26760518_10	7	8.84	G	A	0.45	0.55	2404
rs2189730	C__43039996_10	7	18.97	T	C	0.49	0.51	2402
rs4716945	C__29867302_10	7	155.43	A	G	0.49	0.51	2406
rs4521710	C____126001_10	7	157.74	G	A	0.47	0.53	2404
rs11787149	C___1204228_10	8	18.20	C	T	0.50	0.50	2406
rs2970636	C__15964363_10	8	37.00	C	T	0.52	0.48	2404
rs10955074	C___1677881_10	8	87.93	C	T	0.51	0.49	2404
rs7925270	C___8466143_10	11	120.07	C	T	0.51	0.49	2400
rs7925270	C__31697299_10	11	127.22	A	G	0.48	0.52	2400
rs2239177	C___2608181_10	12	11.93	T	C	0.54	0.46	2404
rs7979054	C__29016807_10	12	93.24	A	G	0.49	0.51	2400
rs4148542	C__29558839_10	13	94.48	T	C	0.51	0.49	2406
rs4148542	C__11476140_10	14	86.01	T	C	0.52	0.48	2402
rs2251110	C___8793799_10	15	31.39	G	T	0.53	0.47	2394
rs4984473	C__29415394_10	15	94.33	G	A	0.52	0.48	2406
rs312729	C___2333563_10	17	65.82	G	A	0.53	0.47	2404
rs312729	C___9217468_10	18	42.83	G	T	0.53	0.47	2404
rs607127	C___7910532_10	18	58.74	C	T	0.57	0.43	238
rs1942719	C__11200035_10	18	69.39	C	T	0.51	0.49	2382

TaqMan® OpenArray® MicroRNA芯片

分为人和啮齿动物的两种芯片。
啮齿动物microRNA芯片用于鉴定验证啮齿动物（大鼠和小鼠）的microRN A（microRNA位点信息来自于miRBase v.15.），包含754种microRNA Assay。人microRNA芯片用于鉴定人的microRNA（microRNA位点信息来自于miRBase v.14.）包含754种microRNA Assay。可对人或啮齿动物的进行全面的microRNA表达谱分析。
一张OpenArray® microRNA芯片可检测3个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类炎症芯片

分为人和小鼠的两种芯片，人炎症芯片包含586种炎症基因特异性的Assay，可研究鉴别主要的炎症反应通路。另外还有21种参考基因的Assay。小鼠炎症芯片包括632种炎症基因特异性的Assay，另外还有16种参考基因的Assay。
每张芯片可检测1-4个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类激酶芯片

人激酶芯片可检测772激酶及激酶相关的基因位点。另外包括56种参考基因的Assay。每张芯片可检测1-3个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类信号转导芯片

人信号转导芯片可用于检测主要信号通路的重要基因。检测广泛的覆盖了信号转导通路，包括配体、受体、激酶、转录因子。信号转导通路相关的基因，如JAK-STAT, NFκB, Akt, GPCR, cAMP, MAP都包括在内。
芯片包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay，每张芯片可检测1-4个样本。

货号

芯片 (用于QuantStudio™ 12K Flex系统)	描述	货号
TaqMan® OpenArray® 人类癌症芯片	识别主要癌症通路相关的差异表达基因包含624种癌症特异性的Assay和24种参考Assay	4475391
TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片	药物代谢酶标记物验证包含158种药物酶特异性的Assay	4475395
TaqMan® OpenArray® 人类干细胞芯片	基因表达标记物鉴别人胚胎干细胞 (hESC) 包含609种干细胞相关基因特异性的Assay和22种参考Assay	4475390
TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片	高通量追踪和样本识别确认包含64种基因分型标记物特异性的Assay	4475386 (32A) 4475387 (32B) 4475394 (64)
TaqMan® OpenArray® MicroRNA芯片 (人或啮齿动物)	识别特性明确且研究充分的miRNA 每块芯片包含754种Assay	4470187 (人) 4470188 (啮齿动物)
TaqMan® OpenArray® 炎症芯片 (人或小鼠)	基因表达标记物鉴别主要的炎症反应通路人炎症芯片包含586种人炎症基因特异性的Assay和21中参考Assay 鼠炎症芯片包含632种人炎症基因特异性的Assay和16参考Assay	4475389 (人) 4475393 (小鼠)
TaqMan® OpenArray® 人类激酶芯片	识别细胞通路调控相关的基因分型包含772种激酶和激酶相关基因特异性的Assay和56个参考Assay	4475388
TaqMan® OpenArray® 人类信号转导芯片	识别主要信号通路相关的重要基因包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay	4475392

货号

芯片 (用于OpenArray® 实时荧光定量PCR系统)	描述	货号
TaqMan® OpenArray® 人类癌症芯片	识别主要癌症通路相关的差异表达基因包含624种癌症特异性的Assay和24种参考Assay	4475371
TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片	药物代谢酶标记物验证包含158种药物酶特异性的Assay	4475375
TaqMan® OpenArray® 人类干细胞芯片	基因表达标记物鉴别人胚胎干细胞 (hESC) 包含609种干细胞相关基因特异性的Assay和22种参考Assay	4475370
TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片	高通量追踪和样本识别确认包含64种基因分型标记物特异性的Assay	4475366 (32A) 4475367 (32B) 4475374 (64)
TaqMan® OpenArray® MicroRNA芯片 (人或啮齿动物)	识别特性明确且研究充分的miRNA 每块芯片包含754种Assay	4461104 (人) 4461105 (啮齿动物)
TaqMan® OpenArray® 炎症芯片 (人或小鼠)	基因表达标记物鉴别主要的炎症反应通路人炎症芯片包含586种人炎症基因特异性的Assay和21中参考Assay 鼠炎症芯片包含632种人炎症基因特异性的Assay和16参考Assay	4475369 (人) 4475373 (小鼠)
TaqMan® OpenArray® 人类激酶芯片	识别细胞通路调控相关的基因分型包含772种激酶和激酶相关基因特异性的Assay和56个参考Assay	4475368
TaqMan® OpenArray® 人类信号转导芯片	识别主要信号通路相关的重要基因包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay	4475372