预制的TaqMan OpenArray®基因通路芯片

 

  • 行业金标准 —— 芯片预置Taqman Assay,拥有极佳的精确度
  • 高灵敏度 —— 可检测ng级别的样本
  • 检测范围广 —— 能筛选超过几百种与疾病通路相关的基因
  • 简单的流程 —— 只需加入样本和预混液,就可运行检测品

OpenArray芯片技术采用纳升流技术平台,可用于超小体积的液相反应。每张芯片有3072反应孔,预制基因通路芯片将金标准的TaqMan Assay预包埋在每个反应孔中,芯片包含数百种基因的Assay。一次运行,可检测数百个位点,轻松完成复杂的基因通路分析。让您进行高通量的筛选分析的同时,获得高质量的qPCR数据。


TaqMan® OpenArray®人类癌症芯片

包含624种与癌症高度相关的基因。该芯片覆盖了与DNA修复、血管生成、细胞粘连、细胞外基质、细胞周期、细胞凋亡、编码基因和编码转录因子等相关的基因。另外还有24个参考基因,用于数据标准化。一张芯片可根据重复数检测1-4个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类癌症芯片的Assay种类及数量

基因种类 基因数量
参考基因 24
与肿瘤相关的基因 121
细胞周期调控因子 105
生长、增殖、分化因子 180
细胞粘连、运动调控因子 79
与肿瘤发展相关的细胞信号因子 289
肿瘤发生的其他基因 194

TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片

该芯片用于检测药物代谢酶和转运蛋白的编码基因,为药物相互作用研究提供高价值的数据。该芯片包括158个Assay,可检测29个基因。 包括与心血管(CYP2D6, CYP2C19,NAT1, NAT2),镇痛药 (CYP2C9,CYP2D6),风湿病学 (CYP2C9,TPMT),神经病学(CYP2C19, CYP2D6),骨骼肌 (CYP2C19)等相关的基因。一张芯片最多可检测16样本。

TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片的Assay种类及数量

PharmaADME 分类 基因数量 典型的基因
阶段一 12 CYP1A1, CYP1A2, CYP2A6, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E1,CYP3A4, CYP3A5, DPYD
阶段二 6 GSTP1, NAT1, NAT2, UGT1A1, UGT2B7, UGT2B15
转运蛋白 11 ABCB1, ABCC2, ABCG2, SLC15A2, SLC22A1, SLC22A2, SLC22A6, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO2B1, TPMT

TaqMan® OpenArray®人类干细胞芯片

该芯片可检测与人类干细胞及其衍生物相关的标记基因。包括了609个经过验证的基因表达标记物和22个参考基因位点,可精确分析人类胚胎干细胞及其不同的细胞提取物的表征特异性。一张芯片可根据重复数检测1-4个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类干细胞芯片Assay种类及数量

基因种类 基因数量 典型的基因
未分化的细胞中表达的基因 6 NANOG, POU5F1, TDGF1, DNMT3B, GABRB3, and GDF3
维持细胞多能性 3 NANOG, POU5F1, and SOX2
干细胞相关的基因 33 BRIX, CD9, COMMD3, CRABP2, EBAF, FGF4, FGF5, FOXD3, GAL, GBX2, GRB7, IFITM1, IFITM2, IL6ST,IMP2, KIT, LEFTB, LIFR, LIN28, NODAL, NOG, NR5A2, NR6A1, PODXL, PTEN, REST, SEMA3A, SFRP2,TERT, TFCP2L1, UTF1, Xist, and ZFP42
细胞分化的标记物 50 ACTC, AFP, CD34, CDH5, CDX2, CGB, COL1A1, COL2A1, DDX4, DES, EOMES, FLT1, FN1, FOX A2, GATA4,GATA6, GCG, GCM1, GFAP, HBB, HBZ, HLXB9, IAPP, INS, IPF1, ISL1, KRT1, LAMA1, LAMB1, LAMC1,MYF5, MYOD1, NES, NEUROD1, NPPA, OLIG-2, PA X4, PA X6, PECAM1, PTF1A, RUNX2, SERPINA1,SOX17, SST, SYCP3, SYP, T, TAT, TH, and WT1
参考基因 3 ACTB, RAF1, CTNNB1, GAPD, EEF1A1, and 18S

TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片

包括两种格式为32的芯片(32A和32B)和一种64SNP的芯片,32A芯片包括3个Y染色体的SNP位点和29个常染色体的SNP位点。这可以用于生物资源应用中的个体样本鉴定。32A芯片足以准确的鉴定大多数的样本。
如果需要更高密度更全面的标记,可加上32B芯片或选择64格式的芯片。32格式芯片可检测96个样本,64格式芯片可检测48个样本。

TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片的SNP Assay列表

 
 
 
 
 
 
HapMap*
 
SNP ID (rs)
TaqMan® Assay ID
Chr
Mb
Allele 1
Allele 2
Average Freq 1
Average Freq 2
N
32A SNP panel
rs3010325 C___2728408_10 1 59.34 C T 0.51 0.49 2404
rs2136241 C___1563023_10 1 161.56 C T 0.47 0.53 2404
rs2259397 C__15935210_10 1 206.14 T C 0.52 0.48 2402
rs7564899 C__33211212_10 2 11.12 G A 0.48 0.52 2406
rs4971536 C___3227711_10 2 20.95 C T 0.49 0.51 2406
rs10194978 C__30044763_10 2 50.38 G A 0.50 0.50 2402
rs4855056 C__11821218_10 3 183.12 A G 0.50 0.50 2404
rs6554653 C___1670459_10 5 11.92 C T 0.51 0.49 2404
rs9396715 C__29619553_10 6 10.02 T C 0.51 0.49 2406
rs441460 C___1007630_10 6 25.66 G A 0.52 0.48 2402
rs7773994 C__26546714_10 6 37.68 T G 0.53 0.47 2398
rs1415762 C___7421900_10 6 125.08 C T 0.54 0.46 2392
rs6927758 C__27402849_10 6 163.64 C T 0.49 0.51 2400
rs7796391 C___2953330_10 7 125.90 A G 0.51 0.49 2402
rs2336695 C__16205730_10 8 1.02 A G 0.49 0.51 2404
rs1157213 C___8850710_10 8 104.28 T C 0.50 0.50 2406
rs10869955 C___1801627_10 9 79.48 C A 0.48 0.52 2402
rs1533486 C___7431888_10 10 1.50 T G 0.48 0.52 2404
rs4751955 C___1250735_10 10 117.91 A G 0.47 0.53 2406
rs10771010 C___1902433_10 12 23.66 T C 0.52 0.48 2392
rs12318959 C__31386842_10 12 28.67 C T 0.53 0.47 2394
rs3742257 C__26524789_10 13 42.07 T C 0.47 0.53 2404
rs1377935 C___8924366_10 14 24.91 T C 0.50 0.50 2406
rs946065 C_____43852_10 14 55.00 C A 0.48 0.52 2404
rs6598531 C__11522992_10 15 96.95 T G 0.53 0.47 2402
rs4783229 C__10076371_10 16 81.18 T C 0.49 0.51 2406
rs1567612 C___7457509_10 18 34.09 G A 0.51 0.49 2362
rs1567612 C___1122315_10 18 40.74 A G 0.51 0.49 2406
rs11083515 C__11710129_10 19 44.39 A G 0.47 0.53 2400
rs768983** C___1027548_10 Y 6.88          
rs3913290** C___8938211_10 Y 8.66          
rs2032598** C___1083232_10 Y 13.36          
32B SNP panel
rs6427699 C__29222350_10 1 161.16 G A 0.50 0.50 2400
rs891700 C___7539584_10 1 237.95 A G 0.49 0.51 2404
rs7588807 C___7539584_10 1 237.95 A G 0.49 0.51 2404
rs7588807 C___3036007_10 3 15.50 T C 0.52 0.48 2406
rs6791084 C___1525594_10 3 30.10 G A 0.46 0.54 2406
rs10938367 C____233438_10 4 44.53 G A 0.51 0.49 2402
rs2561183 C___2934686_10 5 68.77 C A 0.52 0.48 2406
rs2560588 C___2934686_10 5 68.77 C A 0.52 0.48 2406
rs245057 C___3221475_10 5 149.32 C A 0.49 0.51 2392
rs9395021 C__30289524_10 6 44.55 C T 0.53 0.47 2406
rs1337823 C__30289524_10 6 44.55 C T 0.53 0.47 2406
rs974110 C___8307036_10 6 66.17 A G 0.50 0.50 2400
rs2268666 C__15875060_10 6 146.79 C T 0.45 0.55 2406
rs2189730 C__26760518_10 7 8.84 G A 0.45 0.55 2404
rs2189730 C__43039996_10 7 18.97 T C 0.49 0.51 2402
rs4716945 C__29867302_10 7 155.43 A G 0.49 0.51 2406
rs4521710 C____126001_10 7 157.74 G A 0.47 0.53 2404
rs11787149 C___1204228_10 8 18.20 C T 0.50 0.50 2406
rs2970636 C__15964363_10 8 37.00 C T 0.52 0.48 2404
rs10955074 C___1677881_10 8 87.93 C T 0.51 0.49 2404
rs7925270 C___8466143_10 11 120.07 C T 0.51 0.49 2400
rs7925270 C__31697299_10 11 127.22 A G 0.48 0.52 2400
rs2239177 C___2608181_10 12 11.93 T C 0.54 0.46 2404
rs7979054 C__29016807_10 12 93.24 A G 0.49 0.51 2400
rs4148542 C__29558839_10 13 94.48 T C 0.51 0.49 2406
rs4148542 C__11476140_10 14 86.01 T C 0.52 0.48 2402
rs2251110 C___8793799_10 15 31.39 G T 0.53 0.47 2394
rs4984473 C__29415394_10 15 94.33 G A 0.52 0.48 2406
rs312729 C___2333563_10 17 65.82 G A 0.53 0.47 2404
rs312729 C___9217468_10 18 42.83 G T 0.53 0.47 2404
rs607127 C___7910532_10 18 58.74 C T 0.57 0.43 238
rs1942719 C__11200035_10 18 69.39 C T 0.51 0.49 2382

TaqMan® OpenArray® MicroRNA芯片

分为人和啮齿动物的两种芯片。
啮齿动物microRNA芯片用于鉴定验证啮齿动物(大鼠和小鼠)的microRN A(microRNA位点信息来自于miRBase v.15.),包含754种microRNA Assay。人microRNA芯片用于鉴定人的microRNA(microRNA位点信息来自于miRBase v.14.)包含754种microRNA Assay。可对人或啮齿动物的进行全面的microRNA表达谱分析。
一张OpenArray® microRNA芯片可检测3个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类炎症芯片

分为人和小鼠的两种芯片,人炎症芯片包含586种炎症基因特异性的Assay,可研究鉴别主要的炎症反应通路。另外还有21种参考基因的Assay。小鼠炎症芯片包括632种炎症基因特异性的Assay,另外还有16种参考基因的Assay。
每张芯片可检测1-4个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类激酶芯片

人激酶芯片可检测772激酶及激酶相关的基因位点。另外包括56种参考基因的Assay。每张芯片可检测1-3个样本。

TaqMan® OpenArray® 人类信号转导芯片

人信号转导芯片可用于检测主要信号通路的重要基因。检测广泛的覆盖了信号转导通路,包括配体、受体、激酶、转录因子。信号转导通路相关的基因,如JAK-STAT, NFκB, Akt, GPCR, cAMP, MAP都包括在内。
芯片包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay,每张芯片可检测1-4个样本。

货号

芯片 (用于QuantStudio™ 12K Flex系统) 描述 货号
TaqMan® OpenArray® 人类癌症芯片 识别主要癌症通路相关的差异表达基因
包含624种癌症特异性的Assay和24种参考Assay
4475391
TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片 药物代谢酶标记物验证
包含158种药物酶特异性的Assay
4475395
TaqMan® OpenArray® 人类干细胞芯片 基因表达标记物鉴别人胚胎干细胞 (hESC)
包含609种干细胞相关基因特异性的Assay和22种参考Assay
4475390
TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片 高通量追踪和样本识别确认
包含64种基因分型标记物特异性的Assay
4475386 (32A)
4475387 (32B)
4475394 (64)
TaqMan® OpenArray® MicroRNA芯片 (人或啮齿动物) 识别特性明确且研究充分的miRNA
每块芯片包含754种Assay
4470187 (人)
4470188 (啮齿动物)
TaqMan® OpenArray® 炎症芯片 (人或小鼠) 基因表达标记物鉴别主要的炎症反应通路
人炎症芯片包含586种人炎症基因特异性的Assay和21中参考Assay
鼠炎症芯片包含632种人炎症基因特异性的Assay和16参考Assay
4475389 (人)
4475393 (小鼠)
TaqMan® OpenArray® 人类激酶芯片 识别细胞通路调控相关的基因分型
包含772种激酶和激酶相关基因特异性的Assay和56个参考Assay
4475388
TaqMan® OpenArray® 人类信号转导芯片 识别主要信号通路相关的重要基因
包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay
4475392

货号

芯片 (用于OpenArray® 实时荧光定量PCR系统) 描述 货号
TaqMan® OpenArray® 人类癌症芯片 识别主要癌症通路相关的差异表达基因
包含624种癌症特异性的Assay和24种参考Assay
4475371
TaqMan® OpenArray® 药物基因组学 (PGx) 芯片 药物代谢酶标记物验证
包含158种药物酶特异性的Assay
4475375
TaqMan® OpenArray® 人类干细胞芯片 基因表达标记物鉴别人胚胎干细胞 (hESC)
包含609种干细胞相关基因特异性的Assay和22种参考Assay
4475370
TaqMan® OpenArray® 基因分型遗传标记物芯片 高通量追踪和样本识别确认
包含64种基因分型标记物特异性的Assay
4475366 (32A)
4475367 (32B)
4475374 (64)
TaqMan® OpenArray® MicroRNA芯片 (人或啮齿动物) 识别特性明确且研究充分的miRNA
每块芯片包含754种Assay
4461104 (人)
4461105 (啮齿动物)
TaqMan® OpenArray® 炎症芯片 (人或小鼠) 基因表达标记物鉴别主要的炎症反应通路
人炎症芯片包含586种人炎症基因特异性的Assay和21中参考Assay
鼠炎症芯片包含632种人炎症基因特异性的Assay和16参考Assay
4475369 (人)
4475373 (小鼠)
TaqMan® OpenArray® 人类激酶芯片 识别细胞通路调控相关的基因分型
包含772种激酶和激酶相关基因特异性的Assay和56个参考Assay
4475368
TaqMan® OpenArray® 人类信号转导芯片 识别主要信号通路相关的重要基因
包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay
4475372