RNA测序

阐明基因表达的改变是理解细胞对内部遗传病变、外部刺激和不断变化的环境条件的反应的基础。 因此,RNA表达模式是人类疾病预测和分类的生物标志物的独特来源。 尽管迄今为止对蛋白质编码RNA(所谓 poly-A + RNA)非常关注,但非编码RNA序列的重要性已得到良好证实。 新一代RNA测序是RNA研究中高度引人注目的平台,具有以下主要优点:

  • RNA分子的“数字化计数”,适用于高度定量和精确的测量
  • 动态范围能够充分捕捉相关的生物学变化
  • 未知RNA的发现(新型转录本、剪接变异和基因融合)
  • 在单次检测中捕获所有RNA类型(poly-A +、长非编码RNA、小分子RNA和基因融合)
  • 将关注点从完整的全转录组分析转移为少数预选 RNA 序列的机会,以便在实验成本和分析简易性与发现潜力之间进行平衡
特色测序产品

采用Ion Torrent NGS技术进行的RNA测序

从靶向基因表达分析到全转录组测序,Ion Torrent™ 产品将简单的样品制备与直观的数据分析相结合,最终实现完整的RNA测序方案

RNA测序对立

靶向RNA测序

从预先设计的基因检测板中选择或设计您自己的检测板——用于追踪转录组分析或关注通路和疾病特异性基因内容的完美解决方案

靶向转录组测序
靶向测序方法着重于 >20,000 种已知基因,这是对于全转录组测序非常了不起的折衷方案,因为分析被极大地简化了

  小RNA测序
将最先进的 Invitrogen™ RNA 技术与全转录组测序方法相结合,专注于细胞的小分子RNA含量

全转录组测序
此方法也被称为 RNAseq,具有最大的发现潜力,但是也会带来最大的生物信息学挑战

链特异性、无偏好的全转录组分析使得能够鉴定和定量分析已知和新型转录本。 将 Ion S5™系统与 Invitrogen RNA纯化和Ion Torrent文库构建试剂盒相结合,可以在全转录组测序时为您提供从简单样品制备到直观数据分析的可靠测序工作流程。

全转录组测序是重要的发现工具,但对于传统基因表达研究而言可能过于复杂。 Ion AmpliSeq™ 转录组人基因表达试剂盒与微阵列技术相比,具有更大的定量线性动态范围,在利用新一代测序 (NGS) 提高速度和灵敏度的同时,保持简单的样品制备和数据分析。 只需加入10 ng RNA并采用与福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 兼容的样品制备方式、测序和数据分析工作流程,即可靶向检测 >20,000个RefSeq转录本,实现简单的基因水平表达分析。

Ion PGM和Ion S5系统可在链特异性、无偏好的研究中为所有已知及新发现的小分子RNA转录本提供测序分析,如 microRNA (miRNA)、短干扰RNA (siRNA) 以及与piwi蛋白相作用的RNA (piRNA)。

靶向RNA测序是用于追踪转录组研究的高性价比解决方案,或者其可用于快速关注通路或疾病相关内容。 使用极少量的总RNA(低至500 pg的未固定RNA或从FFPE样品分离5 ng RNA),可以在简单的基于 NGS 的工作流程中检测少数、几百甚至数千个RNA 靶标的表达,能够监测信使RNA (mRNA),非编码 RNA (ncRNA),小分子RNA和基因融合。