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碘化丙啶(Propidium Iodide)
碘化丙啶(PI)是一種常用的紅色螢光細胞核和染色體對比染劑。由於碘化丙啶對活細胞不具滲透性，因此它也常用於檢測群體中的死細胞。
PI透過插入鹼基之間與DNA結合，很少或幾乎沒有序列選擇偏好。在水溶液中，染劑的最大激發/發射波長為493/636 nm。一旦染劑被結合，其螢光將增強20至30倍，螢光激發最大波長往紅色偏移約30-40 nm，螢光發射最大波長往藍色偏移約15 nm，導致螢光激發最大波長為535 nm，發射最大波長為617 nm。
PI廣泛應用於螢光顯微鏡、共聚焦雷射掃描顯微鏡、流式細胞儀和螢光測定法。
使用Newport Green DCF二乙酸鹽和Propidium Iodide染色的人類胰島細胞。
透過紅色螢光propidium iodide染色辨識死細胞。本圖由里爾大學Brigitte Vandewalle提供，並經J Histochem Cytochem 49, 519 (2001) 許可轉載。
高性能的核酸染劑
核對比染劑提供了高選擇性的細胞核染色，幾乎不會標記細胞質，並有多種顏色供選擇，可以搭配其他標記物進行多重分析。
某些細胞核染劑也可用於細胞週期分析，其餘則可作為死細胞染劑，應用於高內涵成像系統和流式細胞儀。
圖中顯示為經固定、透化和被標記的麂皮纖維母細胞。使用小鼠抗OxPhos Complex V抑制蛋白抗體對線粒體標記，再利用橙色螢Alexa Fluor 555山羊抗小鼠IgG抗體進行可視化。F-actin以綠色螢光Alexa Fluor 488 phalloidin標記，細胞核則以TO-PRO-3碘化物進行染色 (假品紅色)。