LightShift™ Chemiluminescent RNA EMSA Kit
LightShift™ Chemiluminescent RNA EMSA Kit
Thermo Scientific™

LightShift™ Chemiluminescent RNA EMSA Kit

Thermo Scientific LightShift化学発光RNA EMSAキットを使用すると、電気泳動移動度シフトアッセイ(EMSA)によるRNA-タンパク質相互作用の研究を、放射性同位体を用いずに行うことができます。LightShift化学発光RNA EMSAキットの特長:•高感度詳細を見る
製品番号(カタログ番号)数量
20158100 reactions
製品番号(カタログ番号) 20158
価格(JPY)
81,900
온라인 행사
Ends: 26-Dec-2025
136,600
割引額 54,700 (40%)
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数量:
100 reactions
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Thermo Scientific LightShift化学発光RNA EMSAキットを使用すると、電気泳動移動度シフトアッセイ(EMSA)によるRNA-タンパク質相互作用の研究を、放射性同位体を用いずに行うことができます。

LightShift化学発光RNA EMSAキットの特長:

高感度 — 化学発光検出の感度は放射性検出に匹敵
迅速 — 1~5分間露光した後でX線フィルムを現像。それに対して、放射性検出システムでは16時間の露光が必要
柔軟 — さまざまな方法でビオチン化されたRNAプローブに対応
使いやすい — 結合反応やRNAプローブ検出に最適化された試薬がキット一式に含まれる
非放射性 — 放射性RNAプローブの廃棄について心配せずに済む

このRNA EMSAキットは、ビオチン化RNAプローブと化学発光基質システムを使用して、従来の32P同位体を用いた方法と同等の感度でRNA-タンパク質複合体を迅速かつ安全に検出します。キット一式には、タンパク質-RNA結合条件のセットアップと最適化に必要なすべての試薬、タンパク質-RNA相互作用のポジティブコントロール、核酸相互作用の化学発光検出用試薬が含まれています。

LightShift化学発光RNA EMSAキットについて
LightShift化学発光RNA EMSAキットは、一般的なDNAゲルシフトアッセイと同様にゲル電気泳動の移動パターンの変化によってタンパク質-RNA相互作用を検出するin vitro手法です。RNA EMSAでは、標識RNAプローブをタンパク質サンプルとインキュベートして結合を開始します。複合体が形成されたら、非変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってサンプルを分離します。RNA-タンパク質複合体は遊離RNAプローブよりもゆっくりと移動するため、その移動距離の差をRNAゲルシフトアッセイで可視化できます。RNA-タンパク質相互作用の特異性は、特異的相互作用のシグナルを減少させる余分な非標識RNAとの結合競合によって検証されています。一般的に、変異RNAまたは非関連RNAのプローブは特異的相互作用に関して競合するとは考えられず、EMSAで検出された場合に特定のバンドシフトの強度を低下させることはありません。LightShift化学発光RNA EMSAキット一式には、RNA-タンパク質複合体形成のポジティブコントロールなど、RNAゲルシフトアッセイのセットアップと最適化に必要なすべての試薬が含まれています。

ビオチン化RNAプローブ、ストレプトアビジン-HRP、および化学発光検出法を使用するLightShift化学発光RNA EMSAキットは、放射性RNAプローブを使用する場合と比較して、感度は同等ですが、検出速度はより高速です。標識RNAプローブを生成するには、ビオチン化ヌクレオチドを使用してランオフin vitro転写反応を行うか、Thermo Scientific Pierce RNA 3'末端ビオチン化キットを使用してRNA鎖の3'末端にビオチンタグを酵素的にライゲーションします。また、市販の標識RNAプローブを購入してもかまいません。LightShift化学発光RNA EMSAキットは、これら3通りの方法のいずれかでビオチン化されたRNAプローブに有効ですが、ランオフin vitro転写で合成したRNAプローブについては、合成中のビオチン化ヌクレオチドの内部取り込みによってRNAの二次構造が影響を受ける可能性があります。そのため、一部の相互作用については、適切なタンパク質-RNA相互作用を発生させるために、カスタム合成されたRNAプローブまたは3'末端ビオチン化プローブが必要になる場合があります。

LightShift化学発光RNA EMSAキットのポジティブコントロールについて
LightShift化学発光RNA EMSAキットに含まれるポジティブコントロールは、鉄反応性エレメント(IRE)RNAプローブです。IRE結合反応は、他の実験サンプルと並行してセットアップされ、検出されます。鉄飢餓状態では、鉄反応性タンパク質(IRP)は細胞中に存在するIRE RNAに結合したままになり、フェリチン(鉄貯蔵タンパク質)とトランスフェリン鉄受容体の翻訳が効果的に抑制されます。鉄が豊富な条件下では、IRE結合活性が失われ、フェリチンおよびトランスフェリンが翻訳されます。この方式はいたるところに存在し、安定したバンドシフトを実現します。ポジティブコントロール反応に200倍モル過剰の非標識IRE RNAをインキュベートすると、特異的IREバンドシフトシグナルは約70%減少するものの、同程度の倍量の非関連RNAプローブでは、IREバンドシフトはほとんど減少しません。これらのコントロールは、各RNAゲルシフト実験に用いることで、タンパク質-RNA複合体の適切なセットアップ、電気泳動、転写、および検出について検証することができます。

関連製品
LightShift™ Chemiluminescent RNA EMSA Kit用tRNA
研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。
仕様
アッセイEMSAアッセイ
使用対象 (装置)myECL™イメージャー、X線フィルム
反応数100 reactions
製品ラインLightShift
製品タイプLightShift化学発光RNA EMSAキット
数量100 reactions
標的特異性非標的特異的
技術強化された化学発光、メンブレンブロット、ゲルシフト
検出法化学発光
フォーマットキット
サンプルタイプタンパク質
Unit SizeEach
組成および保存条件
対応範囲:1,000 cm2のメンブレン(10個のミニゲルブロット)を使用した100回の結合反応および検出• 125 nMビオチン化IRE RNAコントロール、35 µL(-20℃で保管)
• 10 µM非標識IRE RNAコントロール、25 µL(-20℃で保管)
• 2 mg/mL細胞質肝臓抽出物、50 µL(-20℃で保管)
• 10 mg/mL tRNA、100 µL(-20℃で保管)
• 10倍REMSA結合バッファー、1 mL(-20℃で保管)
• 50%グリセロール、500 µL(-20℃で保管)
• 2M KCl、500 µL(-20℃で保管)
• 1M MgCl2、500 µL(-20℃で保管)
• DTT、凍結乾燥(-20℃で保管)
• ヌクレアーゼフリー水、1.5 mL(-20℃で保管)
• 5倍REMSAローディングバッファー、1 mL(-20℃で保管)
• 安定化ストレプトアビジン-HRP、1.5 mL(4℃で保管)
• ルミノール/エンハンサー溶液、80 mL(4℃で保管)
• 安定過酸化物溶液、80 mL(4℃で保管)
• 核酸検出ブロッキングバッファー、500 mL(4℃で保管)
• 4倍洗浄バッファー、500 mL(4℃で保管)
• 基質平衡バッファー、500 mL(4℃で保管)

よくあるご質問(FAQ)

What is an electrophoretic mobility shift assay (EMSA)?

EMSAs (also called gel shifts, band shifts, gel retardation assays, or mobility assays) have been used extensively for studying protein-DNA interactions. Because protein-DNA complexes migrate more slowly through a native polyacrylamide or agarose gel than DNA alone, individual protein-DNA complexes can be visualized as discrete bands within the gel using chemiluminescence or radioisotopic detection.

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How do I identify if my protein has bound to my EMSA probe?

You can identify the presence of a specific protein in a shifted band using a supershift assay. An antibody that is specific for the protein of interest is added to the binding reaction. Binding of the antibody to the protein causing the gel shift will often result in decrease in the mobility of the shifted complex, although other effects are possible (such as the disappearance of the shifted band). The order of addition of the components for a supershift is often critical; generally the antibody should be added last. We suggest this order:
- Water, buffer, any additives
- Poly dI-dC
- Nuclear extract (allows for non-specific proteins to bind to the poly dI-dC competitor)
- Biotinylated-DNA duplex
- Antibody (we use about 1 µg)
Incubate for 20 min.

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I do not see a shifted band on my EMSA gel. What should I do?

We recommend running run a cold probe competition lane (cold probe + label probe ++ nuclear extract) to see which band becomes fainter when compared to the label probe (label probe + nuclear extract) lane. With the cold probe competition lane, you can better distinguish which is the shifted band of interest.

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Which substrate do you recommend using with the LightShift Chemiluminiscent EMSA Kit and LightShift Chemiluminiscent RNA EMSA Kit?

We recommend using the Chemiluminescent Nucleic Acid Detection Module Kit, Cat. No. 89880 as it has been optimized with the control probes in these kits. Results with other HRP-compatible substrates may vary depending on the quality or characteristic of the chemiluminescent substrate used.

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Can I use alkaline transfer with EMSA?

Alkaline transfer contains NaOH and is typically used for northern and Southern blots. We do not recommend alkaline transfer for EMSA. We recommend the use of 0.5X TBE buffer for transfer of EMSA binding reactions. TBE transfer is near-neutral pH condition.

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引用および参考文献 (12)

引用および参考文献
Abstract
Association between polymorphism in the promoter region of lncRNA GAS5 and the risk of colorectal cancer.
Authors:Wang Y, Wu S, Yang X, Li X, Chen R
Journal:Biosci Rep
PubMed ID:30902880
'The growth arrest special 5 (GAS5), as a research hotspot of long noncoding RNAs (lncRNAs), has been reported to be associated with colorectal cancer (CRC). However, the association between polymorphisms in GAS5 and the risk of CRC was not clear. In the present study, a case-control study in 1078 CRC ... More
Ribosome Provisioning Activates a Bistable Switch Coupled to Fast Exit from Stationary Phase.
Authors:Remigi P, Ferguson GC, McConnell E, De Monte S, Rogers DW, Rainey PB
Journal:Mol Biol Evol
PubMed ID:30835283
'Observations of bacteria at the single-cell level have revealed many instances of phenotypic heterogeneity within otherwise clonal populations, but the selective causes, molecular bases, and broader ecological relevance remain poorly understood. In an earlier experiment in which the bacterium Pseudomonas fluorescens SBW25 was propagated under a selective regime that mimicked ... More
Disordered Regions of Mixed Lineage Leukemia 4 (MLL4) Protein Are Capable of RNA Binding.
Authors:Szabó B, Murvai N, Abukhairan R, Schád É, Kardos J, Szeder B, Buday L, Tantos Á
Journal:Int J Mol Sci
PubMed ID:30400675
'Long non-coding RNAs (lncRNAs) are emerging as important regulators of cellular processes and are extensively involved in the development of different cancers; including leukemias. As one of the accepted methods of lncRNA function is affecting chromatin structure; lncRNA binding has been shown for different chromatin modifiers. Histone lysine methyltransferases (HKMTs) ... More
CircRNA circRNA_102171 promotes papillary thyroid cancer progression through modulating CTNNBIP1-dependent activation of ß-catenin pathway.
Authors:Bi W, Huang J, Nie C, Liu B, He G, Han J, Pang R, Ding Z, Xu J, Zhang J
Journal:J Exp Clin Cancer Res
PubMed ID:30424816
'As a type of recently discovered noncoding RNA, circular RNAs (circRNAs) exert pivot biological functions in diverse cancers. However, the role of circRNA_102171 in papillary thyroid cancer (PTC) has not been investigated. Our study was focused on the functional investigation toward circRNA_102171 in PTC progression. And we also aimed to ... More
Enterovirus 71 antagonizes the inhibition of the host intrinsic antiviral factor A3G.
Authors:Li Z, Ning S, Su X, Liu X, Wang H, Liu Y, Zheng W, Zheng B, Yu XF, Zhang W
Journal:Nucleic Acids Res
PubMed ID:30247716
Although the host restriction factor APOBEC3G (A3G) has broad spectrum antiviral activity, whether A3G inhibits enterovirus 71 (EV71) has been unclear until now. In this study, we demonstrated for the first time that A3G could inhibit EV71 virus replication. Silencing A3G in H9 cells enhanced EV71 replication, and EV71 replication ... More