カオトロープは、水相互作用の構造を阻害する物質であり、さまざまな生物学的目的で疎水性タンパク質やペプチドを可溶化するのに役立ちます。たとえば、AminoLink Plus Supportで固定化する前に、疎水性ペプチドおよびタンパク質を8モルのグアニジン·HClまたは4モルの尿素のいずれかを含むカップリングバッファーに溶解することによってアフィニティーカラムを作成できます。しかし、グアニジンと尿素の分解生成物にはアンモニアが含まれており、これにサポートに対する反応が競合する第一級アミンが含まれているため、尿素とグアニジン溶液は、高品質の試薬を使い、使用する直前に調製する必要があります。 その結果、尿素溶液との相互作用により一部のタンパク質が不可逆的に変化し、結合機能が失われる可能性があります。尿素を大規模に使用する前に、少量の試料を検査し、変性効果がタンパク質の使用目的に悪影響を及ぼすかどうかを判断することが最良です。