TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™ Kit
TaqMan&trade; PreAmp Cells-to-C<sub>T</sub>&trade; Kit
Invitrogen™

TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™ Kit

Green features
Ambion™ TaqMan PreAmp Cells-to-CTキットを使用すると、RNA精製を行わずに、限られた数または少数の培養細胞から直接遺伝子発現解析を行うことができます。プロトコルには、逆転写とリアルタイムPCRの間に中間増幅ステップ(前増幅)が含まれており詳細を見る
製品番号(カタログ番号)数量
438729940 reactions
製品番号(カタログ番号) 4387299
価格(JPY)
390,900
Each
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数量:
40 reactions
Ambion™ TaqMan PreAmp Cells-to-CTキットを使用すると、RNA精製を行わずに、限られた数または少数の培養細胞から直接遺伝子発現解析を行うことができます。プロトコルには、逆転写とリアルタイムPCRの間に中間増幅ステップ(前増幅)が含まれており、このステップでは、増幅バイアスを入れずにお客様が選択した100個の遺伝子ターゲットまでcDNAが濃縮されます。

•完全な検証済みのソリューション—最適化されたワークフローには、細胞溶解試薬、DNase、RT試薬、PreAmp試薬、およびTaqMan™遺伝子発現マスターミックスが含まれます
• 高速、簡便、便利—7分でサンプルを調製でき、面倒なRNAの単離が不要です
• 限られたサンプルを拡張—リアルタイムPCRの機会を最大で64倍に増やし、同時に最大100個の遺伝子を研究できます
• 正確な結果—バイアスを入れずに均一に増幅
• 堅牢な性能—10~100,000細胞を直線的に検出。精製RNAに匹敵する結果

完全な検証済みのソリューション

ゲノムDNAを除去しRNAの完全性を維持しながら培養細胞を溶解する独自の方法を特徴とします。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットには、cDNA合成用の逆転写(RT)試薬、最大100個の遺伝子ターゲットを前増幅するTaqMan™ PreAmpマスターミックス、およびリアルタイムPCR解析用のTaqMan™遺伝子発現マスターミックスが含まれています。

シンプルで便利な7分間のサンプル調製

TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットには、シンプルな7分サンプル調製手順(図1)が含まれており、10–100,000個の培養細胞⁄サンプルに使用できます。細胞をPBSで洗浄後、室温で5分間、溶液に溶解します。DNase処理も同時に行われます。溶解は室温にて停止液を用い、2分間のインキュベーションで終了します。

これでライセートは、逆転写や–20℃での保存の準備が整いました。サンプルは培養プレート(96または384ウェル)上で直接処理できるため、サンプル操作回数やサンプルロスあるいは移し替えによるエラーの可能性が最小限に抑えられ、限られたサンプルを拡張して使用できます。加熱、洗浄、遠心分離は必要ありません。このキットは、従来の時間と労力を要するプロセスを大幅に簡略化し、7分に短縮しています。

限られたサンプルを拡張—リアルタイムPCRの機会を最大で64倍に増やせます

Cells-to-CT™テクノロジーと前増幅性能を統合することで、マルチステップワークフローを効率化すると同時に、貴重なサンプルから得られるPCR反応数を大幅に(60倍超)増やし、少量のサンプルインプットからmRNAを検出する感度を高められます。

遺伝子発現解析用の標準的なリアルタイムPCR反応は、ランダムプライマーとオリゴdTを用いてトータルRNAをcDNAへ逆転写することから始まり、次に遺伝子特異的プライマーとプローブを用いてリアルタイムPCRを実施します(図2)。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットを使用すると、逆転写とリアルタイムPCRの間の中間増幅ステップ(前増幅)が実行され、増幅バイアスを入れずにお客様が選択した100個の遺伝子ターゲットまでcDNAを濃縮できます。得られた前増幅反応物は希釈され、キットに含まれるTaqMan™遺伝子発現マスターミックスを使用する次の各TaqMan™遺伝子発現アッセイの開始材料として使用できます。TaqMan™ PreAmpプロセスは、サンプルを64倍まで効率的に拡張し、限られたサンプル材料では不可能であった分析を可能にします。

正確な結果—バイアスを入れずに均一に増幅

信頼性の高い均一な前増幅を行う機能は、限られたサンプルからの遺伝子発現解析に不可欠です。RNAやcDNAを事前増幅する方法は他にもありますが、それらは出発物質を増幅するために非特異的プライミングを使用しているため、一部の転写物に他の転写物よりもバイアスがかかり、不正確に増幅されてしまいます。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™ Kitの一部であるTaqMan™ PreAmpマスターミックスであれば、遺伝子特異的プライマーを使用することにより、cDNAを事前増幅し、バイアスのない増幅が可能です。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットは、100種類の各種のTaqMan遺伝子発現アッセイと比較した場合、精製RNAと同等のバイアスのない事前増幅を実現します。図3に示すとおり、事前増幅反応は、Cells-to-CT™ライセートや精製サンプルからのバイアスが生じません;このアッセイの≥92%では、精製RNA(A)またはCells-to-CT™キットライセート(B)からの事前増幅されたcDNAと増幅されていないcDNAを比較した場合、+⁄- 1.5 ΔΔ CT以内でした。

堅牢な性能—精製RNAに相当する結果
TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットの性能は、100種類のTaqMan™アッセイを用いて評価され、Cells-to-CT™ライセートまたは精製RNAを用い、事前増幅を行う場合と行わない場合で評価されています。図4に示すとおり、TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットライセートで得られたCT値は、事前増幅前(A)または後(B)後に精製RNAから得られた場合と同程度にあり、ほとんどの場合、当キットにおいて良好な結果が示されています。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットライセートの優れた性能は、加熱、転写、またはマトリックスへの吸着による損失を生じることなく、開始時サンプル中のRNAが保存されることから得られます。

10~100,000の細胞による直線性の検出

RNAプロファイリングのワークフローの各ステップは、少数または多数の細胞から機能を発揮できるよう頑強性が求められます。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットは、溶解反応あたり10~100,000の細胞に基づいて、細胞インプットの5 logにわたって効率的に直線性が生成されるよう最適化されています(図5)。さらに、TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットでは、感度を最大化するために、RT反応液量の最大45%をサンプルライセートで構成することが可能です。TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットは、RT反応で使用される大量のライセート、最適化されたRT反応条件、リアルタイムPCR前のサンプル事前増幅などから最大の感度をもたらします。

実証済みの性能

TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットのコンポーネントは、いずれも一貫した信頼性の高い性能が得られるように最適化されています。これにより、個々のサンプル調製、RT、事前増幅、およびリアルタイムPCR用のキットを組み合わせる際の勘に頼る作業はなくなります。品質保証を強化するため、TaqMan™ PreAmp Cells-to-CT™キットはTaqMan™遺伝子発現アッセイを用いて検証されています。
研究用にのみ使用できます。診断用には使用いただけません。
仕様
使用対象 (装置)7000 System, 7300 System, 7500 System, 7900HT System, Applied Biosystems StepOnePlus™ Fast Real-Time PCR System, StepOne™, 標準モード, StepOnePlus™, 標準モード, QuantStudio 6および7 Proシステム, QuantStudio 7 Flexシステム, QuantStudio 3および5システム, QuantStudio 12k Flexシステム, QuantStudio 6 Flexシステム
フォーマットキット
グリーン機能使用するリソースが少ないことから廃棄物が少なく、危険性も低減
反応数反応40回分
受動的参照色素ROX(プレミックス)
ポリメラーゼAmpliTaq Gold DNAポリメラーゼ
製品ラインAmbion、Cells-to-CT、TaqMan
製品タイプPreamp Cells-to-Cキット
純度または品質グレード高(超高純度)
数量40 reactions
逆転写酵素M-MLV
サンプルタイプ細胞
出荷条件ドライアイス
対応可能対象40反応
検出法プライマープローブ検出
使用対象(アプリケーション)Pre-amplification
GC-Rich PCR Performance
PCR法2ステップRT-qPCR
反応速度スタンダード
Unit SizeEach
組成および保存条件
40サンプル調製rxn、40 Dnase rxn、40逆転写
rxn、および100の20 µL PCR rxn

よくあるご質問(FAQ)

I'm seeing PCR products in the minus-RT control after performing my Cells-to-CT experiment. What does this mean?

If PCR products are seen in the minus-RT control reaction, but not in the no-template control, it indicates that genomic DNA remains in the sample and that genomic DNA was amplified in real-time PCR. Please follow the suggestions below:

- Ensure the DNase I is mixed thoroughly into the Lysis Solution.
- Use fewer cells per lysis reaction.
- Lyse cells using Lysis Solution that is at room temperature, and make sure that the lysis reaction occurs at room temperature.
You can also try increasing the incubation time of the lysis reaction to 8 minutes and/or using Lysis Solution that has been warmed up to 25 degrees C for cell lysis.

I'm getting PCR products in the no-template PCR control when performing a Cells-to-CT experiment. What could cause this?

PCR products in the no-template PCR control indicate that the sample is contaminated with DNA. More stringent steps need to be taken to control contamination.

I'm getting no PCR product or unexpected PCR products after performing a Cells-to-CT experiment. What could be the cause of this?

Please review the following possibilities and suggestions:

- A problem with adding or mixing the Stop Solution: ensure that the Stop Solution was added directly to the lysate, as components of the Lysis Solution may inhibit RT-PCR if not fully inactivated.
- The RNA was degraded: keep cells in PBS on ice before starting the cell lysis procedure.
- RNase in the sample was not completely inactivated: Too many cells could have been used or too much PBS left on the cells, diluting the lysis solution.
- The lysates sat too long before going to room temperature: Do not allow lysates to sit longer than 20 minutes at room temperature once the Stop Solution has been added.
- The sample does not contain the target RNA: Verify that the procedure is working by using the XenoRNA Control in the sample. Also check that your PCR primers can amplify your target under the PCR conditions you are using.

I ran out of stop solution for my Cells-to-CT experiment. Can I purchase it separately?

Yes, it is available in 1 mL aliquots (Cat. No. 4402960).

I have genomic DNA contamination in my Cells-to-CT reaction. How do I get rid of it?

1. Ensure that all medium is removed from the wells.
2. Wash with an equal volume of room temperature 1X PBS after the medium is removed.
3. Ensure that the reaction happens at room temperature (the lysis reaction may not reach room temperature if the plate is on ice, if the plate was quickly moved to the bench, or if a cold lysis solution was added).
4. Warm lysis solution to room temperature before adding to cells.
5. Allow the lysis reaction to proceed for 8 minutes at 25 degrees C.