T7遺伝子6エクソヌクレアーゼは、DNAの約50%が酸可溶性になるまで、オリゴヌクレオチドとモノヌクレオチドを遊離することにより、5’ホスホチルまたは5’水酸基ヌクレオチドの両方から、5'→3'方向で二重DNAを非処理で加水分解します。また、5'末端の二本鎖DNAとRNA:DNAハイブリッドのRNAにおけるギャップとニックで、ヌクレオチドを5'→3'方向に分解します。
T7遺伝子6エクソヌクレアーゼは、5'末端の5'モノヌクレオチドを遊離した二重DNAの段階的加水分解を触媒する点で、ラムダエキソヌクレアーゼに似ています。しかし、ラムダエキソヌクレアーゼとは異なり、この酵素は処理能力が低く、5’水酸基と5’ホスホチルの両方の末端を除去します。
また、RNA:DNAハイブリッドのRNAとDNAを5'→3'方向に分解しますが、二本鎖または一本鎖RNAのいずれも分解できません。
この酵素は、シーケンシングまたはSNP解析用の一本鎖DNAテンプレートの生成に使用されています。
特性
分子量:32 kDa
最適pH:7.5
最適温度:37℃
不活性化:75℃で10分間、または50 µLの反応量に0.5 M EDTAを2 µL添加。
不活性化
75℃で10分間加熱、または50 µLの反応量に0.5 M EDTAを2 µL添加。
純度
SDS-PAGEで測定して95%を超える純度。エンドヌクレアーゼおよびリボヌクレアーゼの汚染試験済み。
保存バッファー
50 mM KPO4(pH 6.5)、1 mM EDTA、1 mM DTT、50%グリセロール。
アッセイ条件
反応混合液(50 µL)には、50 mMトリス-HCI(pH 8.1)、5 mM MgCl2、20 mM KCI、5 mM 2-メルカプトエタノール、二本鎖DNA、酵素が含まれます。インキュベーションは、37℃、15分間です。
ユニット定義
1ユニットは、標準的なアッセイ条件下で、37℃、15分間で1 nmolの酸可溶性ヌクレオチドを放出するために必要な酵素量です。
濃度
50ユニット/µL
由来
T7遺伝子6エキソヌクレアーゼの過剰産生クローンを含む大腸菌株
機能試験
37℃、30分間で75ユニットの酵素による0.5 pmolのλ DNAの一本鎖半分子への変換。アガロースゲル電気泳動による検証。
アプリケーション:
1.5'末端からの二本鎖DNAの制御された段階的消化
2.シーケンシングまたはSNP解析用のssDNAテンプレートの生成
研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。