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GeneChip™ Rat Genome 230 2.0 Array
GeneChip™ Rat Genome 230 2.0 Array
Applied Biosystems™

GeneChip™ Rat Genome 230 2.0 Array

GeneChip™ Rat Genome 230 2.0 Array は、ラットをモデル生物とする毒物学、神経生物学、その他のアプリケーションのための強力なツールです詳細を見る
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製品番号（カタログ番号）アレイの数
9005052 arrays
9005066 arrays
90050730 arrays
製品番号（カタログ番号） 900505
価格（JPY）
261,400
2 arrays
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アレイの数:
2 arrays
GeneChip™ Rat Genome 230 2.0 Array は、ラットをモデル生物とする毒物学、神経生物学、その他のアプリケーションのための強力なツールです。

•ラットゲノムからの転写物を単一アレイ上で完全に網羅します
• 31,000超のプローブセットから成り、十分に実証された 28,000 超のラット遺伝子に由来する 30,000 超の転写物および変異を解析できます
• NetAffx™ Analysis Center 経由で最新のバイオインフォマティクスツールが利用でき、生物学的に有意義な結果を得られます
• 公開されているラットゲノムのドラフトおよび主要な公開ラットデータベースを用いて配列情報を改善し、より高品質なデータアウトプットを実現しました

アレイプロファイル
GeneChip Rat Expression Set 230 を代表する全てのプローブセットは GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array に含まれます。GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array のデザインに使われている配列は GenBank™、dbEST、および RefSeq から選別されています。配列クラスターは UniGene database (Build 99、2002 年 6 月) に基づいて構築され、Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center (2002 年 6 月) から無償で得られるラットゲノムのドラフトアセンブリとの比較解析により改良されています。

GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array は、RefSeq データベース配列の代表的なものや、以前 GeneChip Rat Genome U34 Set で使われていた配列や そのEST クラスターをさらに改良したものなどを含んでいます。

それぞれ対応する配列と相補的なオリゴヌクレオチドプローブはアレイ上で合成されます。11 組のオリゴヌクレオチドプローブが GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array でそれぞれの配列の転写レベルの測定に使われます。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
仕様
製品ラインGeneChip
数量2 arrays
タイプRat Genome 230 2.0 Array
アレイTranscriptome Profiling
フォーマットArray Cartridge
アレイの数2 arrays
種Rat
Unit Size2 arrays

よくあるご質問（FAQ）

What reagent kit should I use with my array?

Please refer to the Microarray Reagent Guide for Arrays and Expression Kits to match the correct reagents your array.

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How are transcript IDs assigned for WT arrays if a gene has multiple transcript IDs?

The first assigned mRNA/gene that is listed in the annotation file for a given probe set or transcript cluster is considered the "best" assignment based on data source quality ranking and assignment scoring system. To get a single best mRNA/gene assignment you can simply take the first one in the list in the annotation file.

Sometimes, there might be multiple best hits between transcript clusters (or probe set) and a mRNA/gene, with identical score and data source quality. In that case, the transcript assignments are ranked based on their descriptions (e.g., title from the GenBank record).

For transcript clusters that detect genes that are alternatively spliced, the different spliced forms will be ranked by length with the longest ones listed first.

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Does the GeneChip miRNA 3.1 Array Strip require a different hyb/wash/stain kit than the GeneChip 3' IVT arrays and GeneChip ST array strips?

The hyb/wash/stain kit for the GeneChip miRNA 3.1 Array Strips is different than that for the 3' IVT arrays and GeneChip ST array strips. Additional wash A steps have been added to ensure adequate washing after the array strips have been stained.

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What do the suffixes mean at the end of each probeset in GeneChip 3' IVT arrays?

The probe set names never change, but they can give you an idea of what was known about the sequence at the time of design.
_at: All probes hit one known transcript.
_a: All probes in the set hit alternate transcripts from the same gene.
_s: All probes in the set hit transcripts from different genes.
_x: Some probes hit transcripts from different genes.

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Can I store my GeneChip 3' IVT Array after hybridization?

Yes, but we recommend storing your GeneChip 3' IVT Array after hybridization and prior to the fluidics step, for no longer than 3 hours at 4 degrees C. Please remove the hybridization cocktail and fill with wash A before storing.

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