GeneChip™ Rat Gene 2.0 ST Array
GeneChip™ Rat Gene 2.0 ST Array
Applied Biosystems™

GeneChip™ Rat Gene 2.0 ST Array

包括的デザイン当社はラットがヒトの疾患研究に用いられる重要なモデル生物であると考えています。実験をトランスクリプトームの解析と連携させるために、当社はゲノムワイドな発現プロファイルを与える最新のゲノムコンテントを基盤にアレイをデザインしています。GeneChip™ Rat Gene 2.0 ST Array には他のマイクロアレイでは得られない唯一の特性があります詳細を見る
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製品番号（カタログ番号）アレイの数
9021246 arrays
9025012 arrays
90212530 arrays
製品番号（カタログ番号） 902124
価格（JPY）
265,000
Each
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アレイの数:
6 arrays
包括的デザイン
当社はラットがヒトの疾患研究に用いられる重要なモデル生物であると考えています。実験をトランスクリプトームの解析と連携させるために、当社はゲノムワイドな発現プロファイルを与える最新のゲノムコンテントを基盤にアレイをデザインしています。

GeneChip™ Rat Gene 2.0 ST Array には他のマイクロアレイでは得られない唯一の特性があります。遺伝子の 3' 末端のはじめのエクソンに対してデザインされたプローブを用いる従来のアレイとは異なり、このアレイの何十万にもおよぶプローブはアレイのすべての転写物の全てのエクソンに対してデザインされています。

この高い転写物網羅性 (遺伝子あたりの中央値 22 プローブ) によりゲノムワイドな転写物発現の変化を検出することができます。これらのアレイは多くの従来型の 3' でバイアスされたマイクロアレイソリューションよりも高い解析能力と正確性を誇ります。全転写物解析法により遺伝子中の多くの転写物アイソフォームを検出することができ、スプライシングバリアント、非ポリアデニル化転写物、代替ポリアデニル部位を持つ転写物、さらには切断を受けた転写物など、3' でバイアスされた発現デザインを用いた場合では見逃されうるものも含みます。

主な利点
• 全転写物を解析することで、3’ でバイアスされた発現デザインでは見逃す可能性のある転写物アイソフォームを検出できます。
• トランスクリプトームを包括的に網羅しており、新たな興味深い生命現象を探ることができます:
   - タンパク質をコードする >27,000 種の転写物
   - Entrez Gene に含まれる >24,000 種の遺伝子
• エクソンのカバー領域を最大化するように設計されたプローブを用いて、選択的スプライシングイベントや転写変異を測定します
• 再現性: シグナル相関係数 ≥ 0.99

コンテントプロファイル
GeneChip Rat Gene 1.0 ST Array 以来、ラットのゲノムの構造的および機能的理解は非常に深まってきています。この興味深い RNA 転写物系の発現変動を測定するツールをこの研究領域に提供するため、当社は GeneChip Rat Gene 2.0 ST Array を開発しました。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
仕様
製品ラインGeneChip
数量6 arrays
タイプRat Gene 2.0 ST Array
アレイTranscriptome Profiling
フォーマットArray Cartridge
アレイの数6 arrays
種Rat
Unit SizeEach

よくあるご質問（FAQ）

What is contained in the tab-delimited format of the GeneChip probe sequence download file?

The tab-delimited probe sequence file contains the following information:
-Probe Set Name
-Probe X: The X coordinate of the probe sequence on the GeneChip probe array.
-Probe Y: The Y coordinate of the probe sequence on the GeneChip probe array.
-Probe Interrogation Position: The base position on the consensus/exemplar sequence where the central base of the probe aligns, which is the 13th base of a 25mer probe.
-Probe Sequence: The 25-base perfect match sequence.
-Target Strandedness: The sense/antisense orientation of the target sequence that can hybridize with the probe sequence.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Microarray Analysis Support Center.

What is the NetAffx Analysis Center?

The NetAffx Analysis Center used to contain information and files regarding array content, probe sets, and functional annotations. However, the NetAffx Analysis Center has been retired. Much of the content provided by the NetAffx Analysis Center can now be accessed on the arrays’ thermofisher.com product pages or by contacting Technical Support (techsupport@thermofisher.com).

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Are pseudogene databases included in the design of expression arrays?

Pseudogene databases were not included in the design of expression arrays.

How long can I store labeled cDNA when working with expression microarrays?

Labeled material can be stored for 2 weeks at -20 degrees C.

What is an Event Score in TAC 4.0 Software?

TAC 4.0 includes two algorithms for identifying alternative splicing events: the TAC 2.0 algorithm and the new EventPointer. Algorithmic determination of alternate splicing remains a challenging problem. TAC 4.0 supports two different approaches that have different sets of strengths and weaknesses. After considerable testing, the new TAC 4.0 “'Event Score” leverages both previous TAC 2.0 event estimation score and Event Pointer p-value and sorts the most likely alternative splicing events to the top. Of course, the TAC 2.0 event score and EventPointer p-values remain individually available.

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