GeneChip™ Human Transcriptome Pico Assay 2.0

GeneChip™ Human Transcriptome Pico Assay 2.0 は次世代の発現プロファイリング研究を志向してデザインされており、遺伝子により産生される全ての既知の転写アイソフォームを正確に検出するのに必要な汎用性と正確性を擁し、遺伝子レベルの発現プロファイリングを超える能力を発揮します。

Clariom™ D Transcriptome Human Transcriptome Pico Assay 2.0 コンテントとその網羅範囲の詳細のデータシートを見る。

トランスクリプトームの包括的研究
研究により何万ものヒトゲノムが何十万ものエクソンを含有しており、それにより何十万もの転写アイソフォームに繋がっていることが示されています。これらの転写アイソフォームは、遺伝子から転写され最終的なプロセシングを受けたメッセンジャー RNA 中に、エクソンが含まれるか、あるいは排除されることで生じます。これまで、これらの転写アイソフォームの測定や解析は技術的限界、必要なサンプル量の問題、また解析法・解析ツールがないためほぼ不可能でした。

包括的なトランスクリプトーム解析を行うには多数のデータソースから多様な転写体を統合する必要があります
ほとんどの遺伝子は多数の転写アイソフォームを生成し、それぞれのアイソフォームの相対量の変化を測定することで、疾患や生命プロセスに関する新しい洞察を得ることができます。Clariom™ D Transcriptome Human Transcriptome Pico Assay 2.0 は多くのデータソースを統合し、可能な限り多くの転写アイソフォームを独立して解析することができます。

アッセイの設計と注釈に使うデータソース
RefSeq                                    Vertebrate Genome Annotation (Vega) database
Ensembl                                   MGC Mammalian Gene Collection (v10)
UCSC Known Genes               www.noncode.org
UCSC lincRNA transcripts        lncRNA db
Broad Institute, Human Body Map lincRNAs, and TUCP (transcripts of uncertain coding potential) catalog

2 レーン全体を使用したシーケンシングで得られるデータよりも良質なデータ
追加情報については、以下のドキュメントセクションにある HTA 2.0 フライヤーをご覧ください。HTA 2.0 により非常に正確かつ精密にトランスクリプトームを包括的に俯瞰することができます。

バイオインフォマティクスを駆使してアレイがデザインされており、アセンブリの必要がありません
HTA 2.0 は保存配列がアレイに合成されるのを最小化して、固有の価値ある情報を可能な限り最大化します。 この高解像度のアレイデザインはコーディング転写物とノンコーディング転写物を含む、今までにない > 600 万ものプローブを含有しています。このアレイの 70% のプローブはコーディング転写物のエクソンを含んでおり、アレイの残りの 30% のプローブはエクソン-エクソン間のスプライシングジャンクションとノンコーディング転写物を含んでいます。このこれまでになく幅広いアレイによりすべてのコーディング転写物とノンコーディング転写物に関する知見を得ることができます。

バイオインフォマティクスを駆使してアレイがデザインされており、アセンブリの必要がありません
Clariom™ D Transcriptome Human Transcriptome Pico Assay 2.0 は保存配列がアレイに合成されるのを最小化して、固有の価値ある情報を可能な限り最大化します。 この高解像度のアレイデザインはコーディング転写物とノンコーディング転写物を含む、今までにない > 600 万ものプローブを含有しています。このアレイの 70% のプローブはコーディング転写物のエクソンを含んでおり、アレイの残りの 30% のプローブはエクソン-エクソン間のスプライシングジャンクションとノンコーディング転写物を含んでいます。このこれまでになく幅広いアレイによりすべてのコーディング転写物とノンコーディング転写物に関する知見を得ることができます。

簡単迅速な無料の解析ソリューションClariom™ D Transcriptome Human Transcriptome Pico Assay 2.0 は Expression Console™ Software および TAC Software と初めて統合され、データから次の指針を数分で得ることができる完璧なソリューションを提供します。当社の発現アレイを使っている研究者はこの完全な解析ソリューションを無償で使用できます。さらに、Clariom™ D Transcriptome Human Transcriptome Pico Assay 2.0 データ解析は同様の解析ソリューションと他の発現アレイデータに使われているサービスプロバイダーにサポートされています。

関連リンク
GeneChip™ Hybridization, Wash, and Stain Kit