Clariom™ D Assay, human
Clariom™ D Assay, human
Applied Biosystems™

Clariom™ D Assay, human

次世代のトランスクリプトームレベルの発現プロファイリングツールであるヒトサンプル用Clariom Dアッセイを使用すると、トランスクリプトーム内からの深く広範にわたるバイオマーカー探索を加速できます。Clariom Dアッセイは、トランスクリプトームを非常に詳細に確認することができるので、最小限の時間で研究に必要な結果を取得できます。Clariom Dアッセイを使用すると、トランスレーショナル研究の科学者は詳細を見る
製品番号(カタログ番号)アレイの数
90292330アレイ
90292210アレイ
製品番号(カタログ番号) 902923
価格(JPY)
1,727,000
Each
お問い合わせください ›
アレイの数:
30アレイ
次世代のトランスクリプトームレベルの発現プロファイリングツールであるヒトサンプル用Clariom Dアッセイを使用すると、トランスクリプトーム内からの深く広範にわたるバイオマーカー探索を加速できます。Clariom Dアッセイは、トランスクリプトームを非常に詳細に確認することができるので、最小限の時間で研究に必要な結果を取得できます。Clariom Dアッセイを使用すると、トランスレーショナル研究の科学者は、堅牢なバイオマーカーシグネチャを迅速かつ簡単に生成できます。業界をリードするマイクロアレイ技術に基づく、新規のClariom Dアッセイデザインは、もっとも複雑なトランスクリプトームワイドの遺伝子およびエクソンレベルの発現プロファイルを提供できるよう設計されています。3日間にわたる1度の実験で、コーディングRNAおよび長鎖ノンコーディング(lnc)RNAの選択的スプライシングイベントを検出する機能も含まれています。

新規の有益なバイオマーカーを発見する可能性を拡大
既知の転写された遺伝子の数は近年急速に拡大しており、転写産物バリアントやlncRNAなどの実用的なバイオマーカーのためのより多くのソースが提供されています。 これらは、臨床的有用性や疾患メカニズムの理解を深めるために使用できます。このようなバイオマーカーは、時間がかかり、複雑でコストのかかるシーケンシングやターゲット発現のアプローチでは見逃してしまう可能性があり、再現性のないシグネチャをもたらし、時間とコストを無駄にします。

Clariom Dアッセイは、既知のコーディングおよびノンコーディングスプライス変異を含む転写ゲノムの包括的カバレッジ、臨床サンプルタイプとの適合性、 および柔軟なデータ解析ソフトウェアを備えており、複雑な発現バイオマーカー探索研究を実施し、堅牢で臨床的に関連のある、実用的な結果を得ることができます。

必要なデータをすべて取得
•最大数の公共データベースから取得した540,000を超える転写産物から複雑な疾患のシグネチャを迅速に同定できます。これは、ヒトトランスクリプトームの最も包括的なカバレッジで、バイオマーカーを確実に見逃しません。
•コーディングRNAおよびlncRNAアイソフォームを生成する遺伝子、エクソン、および選択的スプライシングイベントを確実に検出します。
•一般的なシーケンシングのアプローチによって検出されない、レアな低発現の転写産物を検出します。
•直観的で高度に視覚的な無料の分析ソフトウェアを使用して、データから洞察までを数分で実施できます。
貴重なサンプルがある場合、最初から適切な結果を取得可能

•血液、細胞、新鮮/新鮮凍結組織など、さまざまなサンプルタイプの RNA に対応します。
•グロビンやrRNAの除去ステップを必要としないアッセイにより、サンプルの完全性を維持し、データのばらつきを低減します。

Clariom Dソリューションは、GeneChip™ 3000装置システムで使用する単一サンプル(カートリッジアレイ)フォーマットで提供され、遺伝子、エクソン、パスウェイ、および選択的スプライシングイベントのグローバルな発現パターンを解析および視覚化するための試薬ならびに迅速で簡単な ranscriptome Analysis Console(TAC)ソフトウェアを含みます。

要求されるカバレッジ、必要な再現性、発見に関わる洞察を得ることができます。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
仕様
製品ラインApplied Biosystems
数量30 reactions
出荷条件室温または氷/ドライアイスでの出荷
タイプD Assay
アレイトランスクリプトームプロファイリング
フォーマットArray Cartridge
アレイの数30アレイ
ヒト
Unit SizeEach
組成および保存条件
•Poly-A RNA Control, -20℃で保存
• Hybridization Control Kit, -20℃で保存
• WT Terminal Labeling Kit, -20℃で保存
• WT Amplification Kit, Module, - 20℃で保存
• WT Amplification Kit, Module, -20℃で保存
• Clariom D Arrays, human, 4℃で保存

よくあるご質問(FAQ)

What reagent kit should I use with my array?

Please refer to the Microarray Reagent Guide for Arrays and Expression Kits to match the correct reagents your array.

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Why is it important to use Tough-Spots® labels when using GeneChip cartridge arrays?

Tough-Spots® labels are small adhesive stickers used to temporarily seal the backs of cartridge arrays during the overnight hybridization step. They are required to prevent loss of volume due to evaporation through the septa. We recommend using Tough-Spots® labels on Rolls from USA Scientific (Item No. 9185-0000)

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What are the respective hybridization volumes based on array format for Affymetrix gene expression arrays?

Proper hybridization volume is critical to obtaining an even signal across a given array. Too little volume can lead to black circles in the middle of the array. Too much volume can leak out of the back of the array. The correct hybridization volume leaves enough room for a small air bubble to circulate around the array surface during the overnight hybridization. Here are the recommended hybridization and fill volumes based on the array format:
Array Format; Hybridization Volume; Fill Volume
- 49 Format (Standard); 200 µL; 250 µL
- 64 Format; 200 µL; 250 µL
- 100 Format (Midi); 130 µL; 160 µL
- 169 Format (Mini); 80 µL; 100 µL
- 400 Format (Micro); 80 µL; 100µL

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Why is strand-specificity important when performing Clariom D and Clariom S assays?

Clariom D arrays have probes that cover all known regions of transcription including probes in overlapping regions from both strands. To obtain strand-specific information from the Clariom D arrays, the WT Pico and WT Plus reagents (which are strand-specific) must be used. This is important because without strand-specific reagent, it would not be possible to decipher the source strand of DNA, which makes it challenging to untangle true gene- and exon- level expression and alternative splicing events.

Strand-specificity is significantly less important for customers interested in gene-level only information (i.e., those using Clariom S) as compared to customers who want to understand the complexities of the whole transcriptome including identifying antisense transcripts and ncRNA (i.e., those using Clariom D). While strand-specificity is less important for gene-level expression only, probes within regions of overlapping transcription from both strands are avoided in the Clariom S array design (unlike Clariom D). This is important because if Clariom S did not preserve strand-specificity, there could be an overestimation of gene-level expression causing false positive or negative results. With Clariom S having a "stranded" design, it does not necessarily need a strand-specific reagent kit.

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What is an Event Score in TAC 4.0 Software?

TAC 4.0 includes two algorithms for identifying alternative splicing events: the TAC 2.0 algorithm and the new EventPointer. Algorithmic determination of alternate splicing remains a challenging problem. TAC 4.0 supports two different approaches that have different sets of strengths and weaknesses. After considerable testing, the new TAC 4.0 “'Event Score” leverages both previous TAC 2.0 event estimation score and Event Pointer p-value and sorts the most likely alternative splicing events to the top. Of course, the TAC 2.0 event score and EventPointer p-values remain individually available.

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