Clariom™ S Assay, rat
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Applied Biosystems™

Clariom™ S Assay, rat

Clariom S Assays for rat を用いることで、ラットのトランスクリプトームを遺伝子レベルで理解できます。 ラットの Clariom詳細を見る
製品番号(カタログ番号)アレイの数
90293530 arrays
90293410 arrays
製品番号(カタログ番号) 902935
価格(JPY)
833,300
Each
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アレイの数:
30 arrays
Clariom S Assays for rat を用いることで、ラットのトランスクリプトームを遺伝子レベルで理解できます。 ラットの Clariom S アッセイは次世代のトランスクリプトームワイドな遺伝子レベルの発現プロファイリングツールであり、類まれな迅速性・簡便性で即用性のある結果を与えます。業界をリードするマイクロアレイテクノロジーにより、新しい Rat Clariom S Assay デザインは全ての既知遺伝子を幅広く網羅しており、臨床サンプルタイプ、拡張可能なフォーマット、汎用性の高いデータ解析ソフトウェアに対応しています。Clariom S Assays は、機能が既知の発現バイオマーカーをできるだけ迅速、簡便かつ優れた費用対効果で見つけるためのツールです。

解決法を探し、前進しましょう
ここ数年で既知の転写遺伝子の数は大きく伸びましたが、各遺伝子の機能は未だ解明途上です。データベースで見つかる多くの遺伝子および転写物は詳細があまりまたは全く分かっておらず、データの解析や解釈を複雑化し長引かせます。Rat Clariom S Assay は機能がよくわかっている遺伝子に対象を絞っており、これを用いることで遺伝子レベルの発現解析プロファイリングを実行したり、重要な遺伝子や発現経路の変化を迅速に評価できます。Clariom S Assays for rat はより短時間でデータ解析が可能で、迅速に結論を導けます。

簡単、迅速なバイオマーカーの発見法
• 20,000 を超えるウェルに関連付けられた遺伝子の発現を正確に測定することで、必要な情報を迅速に得ることができます。
• スループットニーズに合わせて、1~192 のサンプル数/日を処理するフォーマットの中からお選びください。
•生物学研究者用にデザインされた直観的かつ視覚的な無償のソフトウェアでデータをすぐに解釈することができます。

貴重なサンプルに対して、初めてでも適切に処理できます
• 全 RNA 量わずか 100 pg – わずか 10 細胞からでも信頼性のある発現プロファイルが得られます。
• 血液、細胞、新鮮 / 新鮮凍結サンプルあるいは FFPE 組織を含むさまざまなサンプルタイプ由来の RNA を使用できます。
• グロブリンや rRNA の除去を必要としないアッセイにおいてサンプル鮮度を保ち、データのばらつきを抑えることができます。
•完全自動化されたサンプル調製により時間とコストを節約できます。

Clariom S ソリューションは GeneChip™ 3000 装置を使った単一サンプル (カートリッジアレイ) 処理や GeneTitan™ Microarray System を使ったハイスループットの自動処理 (プレートアレイ) で利用可能なフォーマットで、小スケールおよび大スケールのコホート研究に適用可能な汎用性があります。この完全ソリューションは試薬類と、迅速かつ簡便な Transcriptome Analysis Console (TAC) ソフトウェアを擁し、全体の遺伝子発現パターン、パスウェイ、ネットワーク相互作用を数分で解析・可視化します。

最高クラスの遺伝子レベルの発現を約束します
信頼性の高い遺伝子発現を実現するため、ラット Clariom S Assays は単一遺伝子座の構成的なエクソンから発現された全ての既知の転写アイソフォームに存在しているエクソンのみを検出します。これは他の遺伝子レベルのアレイテクノロジーや shallow RNA Seqとは異なり、転写産物のバリアントに起因する複雑な発現パターンやデータのばらつきによる影響を受けません。Rat Clariom S Assay は既知の各遺伝子の全長において構成的なエクソンのみを検出するので、現在可能な中で最も正確かつ高い信頼性で遺伝子レベルの発現を測定できます。

Clariom S Assays for rat はトランスクリプトーム全体にわたりバイオマーカーを簡便かつ迅速に同定できるので、必要範囲を網羅し、高い再現性で新たな発見に繋がる洞察を得ることができます。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
仕様
アレイTranscriptome Profiling
アレイフォーマットCartridge
使用対象(アプリケーション)Microarray Analysis
反応数30反応
アレイの数30 arrays
製品ラインApplied Biosystems
製品タイプS Assay
数量30反応
出荷条件Approved for shipment at Room Temperature or on Wet or Dry Ice
Rat
サンプルタイプRNA
Unit SizeEach
組成および保存条件
• Poly-A RNA Control Kit, store at -20°C
• Hybridization Control Kit, store at -20°C
• WT Terminal Labeling Kit, store at -20°C
• WT Amplification Kit, Module 1, store at -20°C
• WT Amplification Kit, Module 2, store at 4°C
• Clariom S 30 Arrays , rat, store at 4°C

よくあるご質問(FAQ)

What reagent kit should I use with my array?

Please refer to the Microarray Reagent Guide for Arrays and Expression Kits to match the correct reagents your array.

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Why is it important to use Tough-Spots® labels when using GeneChip cartridge arrays?

Tough-Spots® labels are small adhesive stickers used to temporarily seal the backs of cartridge arrays during the overnight hybridization step. They are required to prevent loss of volume due to evaporation through the septa. We recommend using Tough-Spots® labels on Rolls from USA Scientific (Item No. 9185-0000)

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What are the respective hybridization volumes based on array format for Affymetrix gene expression arrays?

Proper hybridization volume is critical to obtaining an even signal across a given array. Too little volume can lead to black circles in the middle of the array. Too much volume can leak out of the back of the array. The correct hybridization volume leaves enough room for a small air bubble to circulate around the array surface during the overnight hybridization. Here are the recommended hybridization and fill volumes based on the array format:
Array Format; Hybridization Volume; Fill Volume
- 49 Format (Standard); 200 µL; 250 µL
- 64 Format; 200 µL; 250 µL
- 100 Format (Midi); 130 µL; 160 µL
- 169 Format (Mini); 80 µL; 100 µL
- 400 Format (Micro); 80 µL; 100µL

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Why is strand-specificity important when performing Clariom D and Clariom S assays?

Clariom D arrays have probes that cover all known regions of transcription including probes in overlapping regions from both strands. To obtain strand-specific information from the Clariom D arrays, the WT Pico and WT Plus reagents (which are strand-specific) must be used. This is important because without strand-specific reagent, it would not be possible to decipher the source strand of DNA, which makes it challenging to untangle true gene- and exon- level expression and alternative splicing events.

Strand-specificity is significantly less important for customers interested in gene-level only information (i.e., those using Clariom S) as compared to customers who want to understand the complexities of the whole transcriptome including identifying antisense transcripts and ncRNA (i.e., those using Clariom D). While strand-specificity is less important for gene-level expression only, probes within regions of overlapping transcription from both strands are avoided in the Clariom S array design (unlike Clariom D). This is important because if Clariom S did not preserve strand-specificity, there could be an overestimation of gene-level expression causing false positive or negative results. With Clariom S having a "stranded" design, it does not necessarily need a strand-specific reagent kit.

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What is an Event Score in TAC 4.0 Software?

TAC 4.0 includes two algorithms for identifying alternative splicing events: the TAC 2.0 algorithm and the new EventPointer. Algorithmic determination of alternate splicing remains a challenging problem. TAC 4.0 supports two different approaches that have different sets of strengths and weaknesses. After considerable testing, the new TAC 4.0 “'Event Score” leverages both previous TAC 2.0 event estimation score and Event Pointer p-value and sorts the most likely alternative splicing events to the top. Of course, the TAC 2.0 event score and EventPointer p-values remain individually available.

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