PureLink™ Microbiome DNA Purification Kit
PureLink™ Microbiome DNA Purification Kit
Citations & References (1)
Invitrogen™

PureLink™ Microbiome DNA Purification Kit

PureLink™マイクロバイオームDNA精製キットにより、糞便や土壌などの困難なサンプルを含むさまざまなサンプルから、高品質の微生物DNAと宿主DNAを迅速に単離できます。このキットは、実証済みのPureLinkスピンカラム技術を使用して、ダウンストリームのPCR、シーケンシング、または他のアプリケーションにすぐに使用できる精製DNAを安定して生成できます。効率の高いトリプル溶解アプローチ、阻害剤の迅速な除去詳細を見る
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製品番号（カタログ番号）数量
A2979050 Preps kit
製品番号（カタログ番号） A29790
価格（JPY）
59,500
Each
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数量:
50 Preps kit
PureLink™マイクロバイオームDNA精製キットにより、糞便や土壌などの困難なサンプルを含むさまざまなサンプルから、高品質の微生物DNAと宿主DNAを迅速に単離できます。このキットは、実証済みのPureLinkスピンカラム技術を使用して、ダウンストリームのPCR、シーケンシング、または他のアプリケーションにすぐに使用できる精製DNAを安定して生成できます。効率の高いトリプル溶解アプローチ、阻害剤の迅速な除去、および汎用性を備えているため、微生物叢研究プロジェクトやさまざまなサンプル中の病原性細菌の迅速検出を目的としたプログラムに適した究極のキットです。

PureLinkマイクロバイオームDNA精製キットの特長：

•熱的、化学的および機械的な破壊と特殊ビーズを組み合わせることにより、あらゆる微生物（複雑で厚い細胞壁を持つ丈夫な種を含む）を効率的に溶解
• 新規のクリーンアップバッファーを用いた沈殿による阻害化合物の除去
• 多くの生体サンプルに適した効率的なプロトコル
• qPCRや次世代シーケンシングなどの一般的なダウンストリームアプリケーションに対応できる高純度DNAの回収

1つのキットで、さまざまなサンプル種から微生物DNAと宿主DNAを単離
PureLinkマイクロバイオームDNA精製キットは、さまざまな生体サンプルで使用できるように最適化されているため、特定のサンプルタイプに合わせて個別にキットを注文する必要がほとんどありません。

このキットを使用すると、以下のサンプルから微生物DNAと（必要に応じ）宿主DNAを精製できます。

•便
• 尿
• 唾液
• スワブ（膣、口腔、皮膚、直腸、環境）
• 輸送培地
• 培養培地
• 土壌

ヒト微生物叢の解析
人体には、100兆個もの細菌、古細菌、真菌、原生生物、ウイルスが定着し、これらすべてが私たちの健康状態に不可欠な役割を果たしています。「微生物叢」とは、これらの群集のさまざまな微生物を指します。現在、これらの微生物を同定するもっとも簡単な方法は、その遺伝子を用いる方法です。健康な微生物組成から逸脱すると、炎症性腸疾患、肥満、がん、喘息、糖尿病、アレルギーなど、多くのヒト疾患につながります。

生体サンプル中の凝集微生物DNAを精製することは、微生物叢がヒトの健康にどのように影響するかを理解するための重要なステップです。回収したDNAがサンプル叢の多様な微生物を正確に反映していることがもっとも重要です。PureLinkマイクロバイオームDNAキットで使用する機械的破壊とトリプル溶解アプローチは、便に含まれるグラム陽性菌などのもっとも困難なサンプルから微生物DNAを回収するのに有用なため、存在する微生物の全スペクトルを同定できます。
研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。
仕様
カラムタイプスピンカラム
溶出量50 to 200 μL
最終産物タイプMicrobial and host DNA
使用対象（アプリケーション）次世代シーケンシング、リアルタイムPCR、PCR
高スループット適合性Not High-throughput Compatible (Manual)
数量50 Preps kit
サンプルタイプ細菌、口腔サンプル、細胞、食品および環境サンプル, Saliva, Soil, Stool, Host DNA from Stool, Swabs (Buccal, Vaginal, Skin, Rectal, or Environmental), Cells, Food and Environmental
スケールMini
出荷条件室温
出発物質量Buccal/Vaginal/Skin/Rectal/Environmental Swab: 1 swab
Microbial Culture: ≤5 mL
Saliva: ≤2 mL
Soil: ≤2 g
Stool: ≤2 g
Urine: ≤10 mL
検査時間Up to 55 min. (Including sample homogenization)
収量≤25 μg
Isolation TechnologySilica Spin Column
Unit SizeEach
組成および保存条件
• S1-溶解バッファー、1×40 mL
• S2-溶解エンハンサー、1×5 mL
• S3-クリーンアップバッファー、1×12.5 mL
• S4-結合バッファー、1×45 mL
• S5-洗浄バッファー濃縮液、1×13 mL
• S6-溶出バッファー、1×5 mL
• PureLinkスピンカラム（コレクションチューブ付き）、カラム／チューブ50本
• PureLinkコレクションチューブ、100本
• ビーズチューブ*、50本、特殊ビーズを含む
* 別箱での発送です。

室温で保管してください。

よくあるご質問（FAQ）

I am using the PureLink Microbiome DNA Purification Kit (Cat. No. A29790). When should I remove the swab?

The swab should be removed after incubation, prior to bead beating.

Does the elution buffer in the PureLink Microbiome DNA Purification Kit (Cat. No. A29790) contain EDTA?

Yes, the elution buffer in the PureLink Microbiome DNA Purification Kit contains EDTA. An alternative that does not contain EDTA is Tris Buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0-9.0). Eluting in water is possible, but the low pH of water could lead to reduced stability and less accurate OD readings.

When using the PureLink Microbiome DNA Purification Kit with soil samples, I am getting less than 400 µL supernatant after lysis. Can you provide me with any suggestions?

For some samples, including soil and stool samples, it can be difficult to withdraw 400 µL supernatant while avoiding debris. If less than 250 µL of supernatant is transferred, add S1-Lysis buffer to bring the volume to 400 µL, before adding S3-Cleanup Buffer.

I am getting low yield using PureLink Microbiome DNA Purification Kit. How can I improve the yield?

Low yield could be caused by inefficient lysis and/or low levels of DNA in the sample. Please try heating samples at 95 degrees C for 5-10 minutes instead of 65 degrees C for 10 minutes after adding S2-Lysis Enhancer. Bead beat for a longer time or at a higher power setting. You can also try to perform the experiment with more starting material, but do not exceed what we specify in the protocol. However for some challenging samples, too much starting material can also result in low yield. In this case, please try less starting material and/or increase the volume of S1-Lysis Buffer.

There are inhibitors in the isolated DNA from environmental samples using PureLink Microbiome DNA Purification Kit. Is there a way to rescue it and obtain good PCR results?

There are several options to rescue your DNA obtain good PCR results including diluting your DNA sample, using specific enzymes, and/or using an additive. The methods are described below:

- Dilute your DNA sample 10-100 times prior to PCR which will dilute out the contaminants while the PCR signal in many cases will remain strong.
- Use “tough” enzymes that were specifically designed and optimized to be effective in harsh environments, and work in the presence of high levels of inhibitors, for instance, TaqPath qPCR Master Mix, CG Reagent.
- Use a BSA additive for the PCR reaction. In most cases, if used at appropriate concentration, BSA can rescue your sample.

You can also try repeating the purification with less starting material or increased volume of S1-Lysis buffer. Additionally, after the addition of the S3- Cleanup buffer, you can try incubating the sample for 10 minutes on ice before centrifugation.

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引用および参考文献 (1)

引用および参考文献
Abstract
Evaluation of a Highly Efficient DNA Extraction Method for Bacillus anthracis Endospores.
Authors:Knüpfer M,Braun P,Baumann K,Rehn A,Antwerpen M,Grass G,Wölfel AR
Journal:Microorganisms
PubMed ID:32443768
A variety of methods have been established in order to optimize the accessibility of DNA originating from Bacillus anthracis cells and endospores to facilitate highly sensitive molecular diagnostics. However, most endospore lysis techniques have not been evaluated in respect to their quantitative proficiencies. Here, we started by systematically assessing the ... More