Oncomine™ Myeloid Research Assay—Chef Ready
Oncomine™ Myeloid Research Assay—Chef Ready
Ion Torrent™

Oncomine™ Myeloid Research Assay—Chef Ready

Ion Torrent Oncomine Myeloid Research Assay は、3 プールの AmpliSeq詳細を見る
テクニカルサポートオーダーサポート
製品番号（カタログ番号）数量
A3694132 reactions
製品番号（カタログ番号） A36941
価格（JPY）
2,064,000
Each
お問い合わせください ›
数量:
32 reactions
Ion Torrent Oncomine Myeloid Research Assay は、3 プールの AmpliSeq オリゴヌクレオチドプライマーセットと、Ion Torrent プラットフォームによる次世代シーケンシング（NGS）用アンプリコンライブラリ調製のための関連試薬から構成されています。本アッセイは、骨髄性疾患に関連するDNA変異や融合遺伝子を、1 ランの NGS 解析で高感度かつ網羅的に検出できるようにデザインされています。このパネルは、主要な骨髄性疾患である、急性骨髄性白血病（AML）、骨髄異形成症候群（MDS）、骨髄増殖性腫瘍（MPN）、慢性骨髄性白血病（CML）、慢性骨髄単球性白血病（CMML）、若年性骨髄単球性白血病（JMML）において鍵となる 40 種類の関連遺伝子と多様なドライバー融合遺伝子 29 種類で構成され、上記ターゲットのほとんどをカバーしています。

このアッセイバージョンは、Ion Torrent Chef 自動ライブラリ調製用です。マニュアルでのライブラリ調製は、製品番号 A32840を参照してください。

特長：
• 1 ランの NGS 解析で、変異および融合遺伝子を 2 つの DNA プールと 1 つの RNA プールで網羅的に解析できる、シンプルなワークフロー
• CEBPA や FLT3-ITDs のような難しいターゲットでも優れたカバレージで解析可能
• Ion 318 Chip により 4 サンプル、または Ion 530 Chip により 12 サンプルまで同時解析可能
• 血液または骨髄由来の 10 ng／プールのインプット DNA または RNA で解析可能
• アレル頻度 5％ の体細胞変異を検出可能
• 簡便迅速なワークフローにより約 3.5 時間で目的ライブラリを調製
• Ion PGM およびIon S5システムにおいて、マニュアルおよび自動ライブラリ調製法の両方で使用可能
• 変異のアノテーションに Oncomine Knowledgebase Reporter を使用可能

Oncomine Myeloid Research Assay は、骨髄がんの研究をサポートできる、網羅的なターゲット NGS アッセイです。本アッセイは、血液または骨髄サンプル由来の 10 ng／プールのインプット DNA または RNA から複数のターゲット遺伝子を容易に解析できるキットです。このマルチプレックス NGS アッセイには、Ion AmpliSeq 技術を駆使することで、一度に複数のサンプルから結果を得ることができます。Ion PGM または Ion S5 システム用にデザインされ、数週間ではなく、数日で結果を得ることができます。本アッセイは、SNV、InDel、そしてFLT3 遺伝子内部タンデム重複（ITD）の検出のための最適な変異解析パラメーターを用いた、Torrent Suite および Ion Reporter 解析ソフトウェアによるバイオインフォマティクスワークフローに連結されています。変異解析は Oncomine Knowledgebase Reporter によってアノテーションでき、サンプルごとに報告されます。サンプルは迅速簡便に処理でき、変異は高い信頼性で検出、同定されます。

仕様
使用対象 (装置)Ion PGM™ System
ライブラリTargeted Sequencing Library
反応数32
製品ラインOncomine
数量32 reactions
サンプルタイプDNA
出荷条件Dry Ice
ワークフローステップDNA Extraction
Sequencing TypeゲノムおよびDNAシーケンシング
Unit SizeEach
組成および保存条件
Store in freezer (-5 to -30°C).

よくあるご質問（FAQ）

What extraction kit is compatible with the Oncomine Myeloid Research Assay (Cat. Nos. A36940, A36941)?

We have validated the use of the MagMAX Total Nucleic Acid Isolation Kit (Cat. No. AM1840), which is compatible with whole blood and bone marrow samples. We recommend using your preferred commercially available kit to sequentially isolate high quality gDNA and RNA from research samples for use in library preparation.

What are the sample input requirements for the Oncomine Myeloid Research Assay - Chef-Ready (Cat. No. A36941?

10 ng of gDNA per pool at a minimum concentration of ≥0.833 ng/µL for Chef library preparation 10 ng of RNA at a minimum concentration ≥1.25 ng/µL for Chef library preparation

What sample types can I use with the Oncomine Myeloid Research Assay (Cat. Nos. A36940, A36941)?

Blood and bone marrow samples are compatible with the Oncomine Myeloid Research Assay. This kit is not intended for use with FFPE samples.

Which templating and sequencing kits are compatible with the Oncomine Myeloid Research Assay (Cat. Nos. A36940, A36941)?

The kit has been validated on the Ion GeneStudio S5 Series Systems and Ion PGM System.

With the Ion GeneStudio S5 Series Systems, we recommend using:
-Ion 510 & Ion 520 & Ion 530 Kit - Chef (Cat. No. A34019)
-Ion 530 Chip Kit (Cat. No. A27764).

With the Ion PGM System, we recommend using:
-Ion PGM Hi‑Q View OT2 Kit (Cat. No. A29900)
-Ion PGM Hi‑Q View Chef 400 Kit (Cat. No. A30798)
-Ion PGM Hi‑Q View Sequencing Kit (Cat. No. A30044)
-Ion 318 Chip v2 BC (Cat. No. 4488150)
Note: Ion 540 Chip is NOT compatible with the Oncomine Myeloid Research Assay as 400 base pair (850 Flows) sequencing is required.

How many samples can I multiplex with the Oncomine Myeloid Research Assay (Cat. Nos. A36940, A36941)?

The assay can be run on both the Ion PGM System and Ion S5/S5XL systems.
-PGM Plexy = 4 samples per Ion 318 Chip
-S5 Manual Library Prep Plexy = 12 samples per Ion 530 Chip
-S5 Chef Library Prep Plexy = 8 samples per Ion 530 Chip

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