RiboMinus™ Bacteria 2.0 Transcriptome Isolation Kit

さまざまな種から16S、23S、および5S rRNAを高効率で除去します
RiboMinus Bacteria 2.0トランスクリプトーム単離キットは自動化対応のキット一式で、細菌および古細菌のリボソームRNA（rRNA）を、インタクトなトータルRNA（100 ng～5 μg）から2時間未満で効率的かつ選択的に除去できます。

RiboMinus細菌2.0キットの主な特長：
• 効率的 — 同梱のRiboMinus Pan-Prokaryoteプローブミックスは、16Sおよび23S rRNAリードにマッピングされたリード数の10%未満を一貫して示しています
• 幅広いターゲット — 76を超える代表的な細菌種および古細菌種（一般的な門および亜門）の16S、23S、および5S rRNAターゲットを標的とする、150を超えるプローブデザインを用いた設計
• 便利 — Dynabeads MyOneストレプトアビジンC1磁気ビーズと、ビーズクリーンアップモジュールおよびプロトコルが、Kingfisher装置用に含まれています
• 柔軟 — 100 ng～5 µgのトータルRNAの質量入力に対応し、5.0～10.0のRIN値を持つ幅広いトータルRNAサンプルに対応します
• 高い検出感度 — 以前のバージョンと比べ、タンパク質コード転写産物にマッピングされるシーケンシングリードの数が増加します
• メタトランスクリプトミクスに最適 — メタゲノムサンプル中の多くの微生物種のrRNAを除去します

細菌および古細菌のパノラマからrRNAを標的とします
RiboMinus細菌2.0キットはハイブリダイゼーションキャプチャ技術に基づき、新しいRiboMinus Pan-Prokaryoteプローブミックスを含んでいます。このため、残余リボソームリードが4倍減少し、以前の細菌プローブミックスよりも大幅に改善されます。この新しいプローブミックスは、150を超える3’-ビオチン標識ssDNAオリゴヌクレオチドデザインで構成されています。これらのデザインは、76種のpan-prokaryote（以下の表を参照）にわたって、高度に保存されたrRNA領域を使用して作成され、いくつかの種でテストされています（以下の適合性リストを参照）。

Dynabeads MyOneストレプトアビジンC1クリーンアップキット入り
プローブミックスが標的のrRNA転写産物に選択的にハイブリダイゼーションすると、プローブ-rRNA複合体の除去は、Dynabeads MyOneストレプトアビジンC1磁気ビーズへの捕捉により完了し、rRNAが除去されたRNAが残ります。RiboMinus細菌2.0キットには、rRNA除去RNAを濃縮するための磁気ビーズベースのクリーンアップモジュールが含まれているため、KingFisher装置での取り扱い、拡張、および自動化が容易になります。結果として得られるrRNA除去RNA（RiboMinus RNA）は、RNA-Seqまたは他の下流アプリケーションによる全トランスクリプトーム解析に適しています。

互換性
RiboMinus Pan-Prokaryoteプローブミックスは、以下の試験対象種と互換性があることが示されています。
Acinetobacter baumannii
Bacteroides thetaotaomicron
Bifidobacterium long um subsp. infantis
Campylobacter jejuni
Clostridioides difficile
大腸菌
Fusobacterium nucleatum
ヘリコバクター・ピロリ
Janthinobacterium sp.
Moorella thermoacetica
Pseudomonas putida
Rickettsia rickettsia
ネズミチフス菌
緑膿菌
サルモネラ菌
黄色ブドウ球菌
Thermoanaerobacter kivui
コレラ菌
Vibrio fisheri

RiboMinus Pan-Prokaryoteプローブミックスは、配列相同性に基づき、以下の種と互換性があることが示されています。
コリネバクテリウム
エンテロコッカスフェカリス
グルコノバクター
ミクソコッカスキサンタス
Streptomyces coelicoflavus