アネキシンは、ホスファチジルセリン（PS）を優先的に結合するカルシウム依存リン脂質結合タンパク質のファミリーです。正常な生理学的条件下では、PSは主にプラズマ膜の内側のリーフレットに配置されています。アポトーシスが開始されると、PSはリン脂質二重膜全体の非対称分布を失い、細胞外膜のリーフレットに移動し、細胞を食作用の標的としてマーキングします。膜の外面にPSを置くと、蛍光標識アネキシンVによりカルシウム依存法で検出できます。

初期のアポトーシスでは、細胞膜は、ヨウ化プロピジウム（PI）、7-AAD、eFluor 450などのFixable Viability色素などの生存色素を除外します。これらの細胞はアネキシンVで染色されますが、生存色素では染色されないため、初期のアポトーシスで細胞を識別します。しかし、後期アポトーシスでは細胞膜の完全性が失われるため、アネキシンVで細胞内部のPSにもアクセスできます。生存色素は、初期段階のアポトーシスを起こしている細胞（アネキシンV陽性、生存色素陰性）からこれらの後期アポトーシスを起こしている細胞および壊死細胞（アネキシンV、生存色素陽性）を分離するために使用できます。

eBioscience annexin Vアポトーシス検出キットで現在利用できる生存解析用染色色素には、FITC、eFluor 450、allophyocyanin（APC）、フィコエリトリン（PE）、PE-シアン7、ビオチンが挙げられます。