Click-iT™ RNA Alexa Fluor™ 488イメージングキットを使用すると、細胞および組織（PNAS（2008）105：15779-84）中のグローバルRNAの転写を時間的および空間的に検出できます。
新たに合成されたRNAや、疾患、環境損傷、薬物治療に起因するRNAレベルの変化を検出する能力は、毒性プロファイリングの重要な側面です。アルキン修飾ヌクレオシド、5-エチニルウリジン（EU）、強力なクリックケミストリーを利用することで、新たに合成されたRNAを、放射活性や抗体を用いずにシンプルな2ステップの手順で検出できます。ステップ1では、アルキンを含むヌクレオシドが細胞や動物に供給され、新生RNAに活発に取り込まれます。タグの分子量が低いため、修飾されたヌクレオシドをRNAに効率的に取り入れることができますが、DNAには取り入れられません。検出には、アジドとアルキンの間の化学選択的ライゲーションまたは「クリック」反応を利用します。この反応では、対応するアジド含有色素によって修飾されたRNAが検出されます。Click-iT™の検出分子は分子量が低いため、複雑なサンプルでも容易に侵入できるほか、RNA相互作用タンパク質を検出する抗体など、他のプローブを用いたマルチプレックス解析の可能性が生まれるため、より深い生物学的洞察がもたらされます。