Click-iT® EdU のコントロールとして、EdUを投与しなかったサンプルをAlexa Fluor 594 azide で染色した。 サンプルはマウスの心臓組織切片だが、ある特定の細胞集団で非特異的な赤色の染色が見られる。 それらはDAPIの染色と重ならない。何が起こっているか?
この問題は Alexa Fluor® 594 azide の染色ではないと考えられます。 マウス組織には内在的なアルキンはないため、Alexa Fluor® 594 azideが結合するものはありません。 また、この染色が核染色 (DAPI) とも重ならないため、これはEdUの非特異染色とも異なります。 これは、実際には赤血球が見えています。赤血球は赤い自家蛍光をもつ一方で核を有していません。 これは完全に未標識(色素も添加していない)切片でもこれらの染色が存在するかどうか確認することで検証できます。 また、高倍率の観察で赤血球の形状も見られます。
固定・透過処理したサンプルでアポトーシスの確認をしたい。 どの試薬がおすすめか? 蛍光標識 Annexin V は使用できるか?
固定後のサンプルでの Annexin V の使用はお勧めできません。 ホルムアルデヒドによる架橋により、ホスファチジルセリンもマスクされる可能性があるためです。 固定後のサンプルで使用できるアポトーシス検出方法は、anti-Caspase抗体を用いた免疫染色、もしくは、 Click-iT® TUNEL Imaging Kit などの TUNEL法です。
I will be performing a cell proliferation assay using Click-iT EdU kit. At what point can I stop overnight, or do I have to perform all the steps continuously?
One may store the sample after fixation overnight in PBS at 4oC. For longer storage (<1 week) , store in buffer with 1-2% formaldehyde or in formalin to limit microbial growth. If you use sodium azide as a microbial inhibitor, it must be completely removed prior to the Click-iT reaction.
Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Cell Viability, Proliferation, Cryopreservation, and Apoptosis Support Center.
A control for a Click-iT EdU labeling experiment uses no EdU and the Click-iT reaction using Alexa Fluor 594 azide. The mouse heart tissue sections are showing non-specific labeling in red, seen in particular clusters of cells. They don't overlap with DAPI. What is the problem?
The problem is likely not the Alexa Fluor 594 azide. Since there are no alkynes endogenous to mouse tissue, there is nothing for the dye-azide to bind to. Since the background doesn't overlap with nuclei (DAPI signal), this isn't an issue of unintended EdU labeling. This red is autofluorescence from red blood cells; they autofluoresce in the red and don't have nuclei. This can be confirmed by checking a completely unlabeled tissue section (no dye present at all) to see if they are still present and by examining the cells at high magnification and looking for corpuscular shape.
Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Cell Analysis Support Center.
I need to test cells for apoptosis after they have been formaldehyde-fixed and permeabilized. What dye or conjugate do you recommend? Will Annexin V conjugates work?
We do not recommend Annexin V for post-fix labeling, since fixation inactivates the function of the translocase; fixed samples would show mostly uniform labeling with Annexin V. The only options you have for apoptosis assays after fixation are to use an anti-caspase antibody or perform a TUNEL assay, such as with the Click-iT TUNEL Imaging kits.
Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Cell Analysis Support Center.