Pinpoint™ ソフトウェア

Thermo Scientific™ Pinpoint™ ソフトウェアを使用すると、プロテオーム探索実験から推定バイオマーカーの検証や一般的な定量プロテオミクスへの移行が容易になります。 Pinpoint ソフトウェアは、標的定量メソッドの開発や改良を簡単にします。 このソフトウェアは、以前の探索実験のデータを使用してタンパク質特異的 (proteotypic) ペプチドを予測し、最良の SRM トランジションを決定します。 また、最良の反応を示すペプチドのみが最終的なインテリジェント SRM (iSRM) メソッドに保持されるように、予備データを評価するためのツールも備えています。

SRM アッセイ開発の容易化

• 探索実験の結果から選択された標的タンパク質およびペプチドのパネルをインポートして処理
• ユーザーが作成した MS/MS スペクトルライブラリおよび公共の (Peptide Atlas など) MS/MS スペクトルライブラリの検索、または仮説主導実験での標的ペプチドの in-silico 予測を自動化
• SRM トランジションに最適な衝突エネルギーを正確に自動決定することにより、もっとも豊富に存在するプリカーサーイオンとプロダクトイオンを自動的に選択
• 柔軟なメソッド設計により、高分解能によるプリカーサーイオンの選択、測定時間の設定、フル MS/MS スキャン (QED) を SRM アッセイに統合可能
• 実験データとライブラリのスペクトルを照合して確率スコアリングによる相関分析を行い、標的ペプチドを高い信頼性で検証
• 探索結果と相対および絶対定量結果を統合してカスタマイズ可能なレポートを作成
• メソッドの改良に役立てるため、結果を簡単にエクスポート可能