Proteome Discovererソフトウエア

Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ソフトウエアを使用すると、複雑な生体サンプル中のペプチドやタンパク質の同定と定量を行うことができます。Proteome Discovererソフトウエアは、タンパク質やペプチドの同定からPTM分析、アイソバリック質量標識、SILACおよびラベルフリーの定量まで、幅広いプロテオミクスワークフローを簡素化します。このソフトウエアは、複数のデータベース検索アルゴリズムと解離法をサポートしています。MSAIDによるインテリジェントなINFERYS™ RescoringおよびCHIMERYS™知的検索アルゴリズムは、検索を発見へとつなげ、ペプチドの一意的な同定数を大幅に増加させます。

Proteome Discovererソフトウエアは、複数の解離法、定量技術、およびデータベース検索アルゴリズムをサポートしており、包括的なタンパク質同定、特性評価、および定量が可能です。

 

包括的

• ビルトインまたはカスタマイズ可能な柔軟なワークフローで、タンパク質研究におけるデータ処理を効率化
• インテリジェントなINFERYS RescoringおよびCHIMERYSアルゴリズムが、より多くの発見を実現
• 複数の解離法（HCD、CID、ETD、UVPD）をサポートしているため、PTMのカバー範囲が広がり、より信頼性の高い同定が可能
• アイソバリック質量標識（TMT、iTRAQ）、同位体標識（SILAC）、およびラベルフリー定量をサポート
• 偽発見率（FDR）により、ペプチドおよびタンパク質の同定を検証
• トップダウン（ProsightPD）や構造生物学および架橋質量分析（XL-MS）のための複数のノードに対応

生産的かつ拡張可能

• データ解析を自動化し、構築済みのワークフローやカスタマイズ可能なワークフローを通じてMSnデータ解析を簡素化
• 研究管理機能が含まれているため、サンプルに関する生物学的情報に定量情報をマッピング可能
• 結果を利用することでデータ収集の品質向上を実現（装置メソッドに直接インポートする包含／除外リストのエクスポートなど）
• 同定されたタンパク質にGO分類、PTM部位、および公共データベースから取得した参考文献を自動的に注釈として付加することにより、生物学的コンテキストを明示
• HUPO Proteomics Standards Initiative（PSI）によって策定されたデータ標準をサポートすることで、データの比較、交換、検証を容易化
• データ処理のため他社のノードをサポートし、大量のデータセットの処理を実現
• 人工知能で強化された高速かつ堅牢なアルゴリズムによるピーク選択とペプチド定量が、より多くの情報を提供
• 信頼性の高い統計を取得し、定量結果を視覚的に検証