Amiraソフトウエア | 用途 | 生物学的画像解析

ライフサイエンス全般にわたる高度な生物学的画像解析

さまざまな科学分野におけるThermo Scientific Amiraソフトウエアの多様なアプリケーションをご覧ください。細胞生物学や解剖生物学から神経科学、製薬およびバイオテクノロジー、構造生物学、植物生物学、生物工学にいたるまで、Amiraソフトウエアは可視化、分析、データ統合のための強力なツールを提供します。 Amiraソフトウエアが、各分野の特定のニーズを満たすようカスタマイズされた高度な機能を提供することで、これらの分野の研究開発をどのように強化するかをご覧ください。

細胞生物学

Amiraソフトウエアは、複雑なイメージングデータの解析を簡素化し、2D画像の枠を超えた知見を提供します。細胞や核を3Dで自動的に分離して測定し、細胞の特性を検出し、ノイズを低減して、高解像度モデルでのコントラストを高めます。柔軟なレジストレーション　ツールによりマルチモーダルイメージングをサポートし、Xplore5D拡張機能を介してサイズやメモリの制限なく大規模なマルチチャネルや時系列データを処理します。また、フィラメントを自動的に検出して追跡し、ネットワークの再構築、および長さや厚さなどのパラメーターの定量化を行います。相関研究は、さまざまなライフサイエンスアプリケーションで有効性が実証されている、モダリティ間レジストレーション法によって可能になります。

極低温条件下で撮影されたクラミドモナスの全体像。 AIディープ　ラーニングによるセグメンテーションにより、さまざまなオルガネラが特定されました。

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解剖生物学

Amiraソフトウエアは生物医学および製薬研究の科学者に柔軟で統一されたフレームワークを提供し、複数のイメージングモダリティの　シームレスなレジストレーションと相関解析を、単一の時点または縦断的研究間で可能にします。論文やハイスループット分析で広く使用されており、組織研究、脳研究、歯科研究、その他の用途に最適です。研究コミュニティガイドラインに準拠した骨解析をサポートし、材料の変形やひずみを研究するための高度なデジタルボリューム相関を提供します。Amiraソフトウエアは、従来のソリューションおよびAI統合ソリューションを使用した大規模データセットの可視化、セグメンテーション、解析に優れており、前臨床および臨床研究のイメージングに有用です。

海綿骨マウス脛骨 - 東北大学大学院歯学研究科、中村圭祐氏提供

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神経科学

Amiraソフトウエアは神経科学者にとって重要なツールであり、さまざまなスケールおよびモダリティで複雑な神経データを分析するための包括的なソリューションを提供します。ライトシートまたは共焦点顕微鏡からの大規模なマルチチャネルデータセットをサイズやメモリの制限なく処理し、AIによるセグメンテーション、フィラメント検出、ネットワーク再構成を備えているため、手動の労力を削減して生産性を向上できます。

Amiraソフトウエアは、脳アトラス作成、神経細胞接続性トレーシング、堅牢な画像位置合わせなど、CTおよびMRI/DTIデータ用の高度なツールを提供します。

強化された可視化オプションはグレースケール画像やテンソル場をサポートし、確立されたアルゴリズムを使用して脳の接続性に関する理解を深めます。

Amiraソフトウエアで可視化した脳MRI画像。

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製薬およびバイオテクノロジー

Amiraソフトウエアは、製薬およびバイオテクノロジー業界が、研究開発スケジュールの短縮、複雑なデータセット、自動化の必要性といった課題に取り組むのを支援します。さまざまなイメージングモダリティから得られる複雑なライフサイエンスデータを可視化、セグメンテーション、理解するためのツールを提供します。

Amiraソフトウエアは、高度な画像解析、自動セグメンテーションのためのディープラーニングモデル、およびハイコンテント
スクリーニングプラットフォームとの互換性を備えており、創薬、ターゲット同定、前臨床研究に役立ちます。サーモフィッシャーサイエンティフィックは、ソフトウエアの有効性を高め、創薬プロセスを加速させ、生物学的システムへの理解を深めるためのサポートおよびカスタマイズサービスを提供しています。

Amiraソフトウエアで可視化したプレドニシロン錠

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構造生物学

Amiraソフトウエアは、高度な画像解析、自動セグメンテーションのためのディープラーニングモデル、およびハイコンテント
スクリーニングプラットフォームとの互換性を備えており、創薬、ターゲット同定、前臨床研究に役立ちます。サーモフィッ
シャーサイエンティフィックは、ソフトウエアの有効性を高め、創薬プロセスを加速させ、生物学的システムへの理解を深めるためのサポートおよびカスタマイズサービスを提供しています。

アクチンフィラメント。 Marion Jasnin博士、Department of Molecular Structural Biology, Max Planck Institute for Biochemistry、Martinsried、ドイツ。データの原著論文：Jasnin et al. 2019. Structure. DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2019.05.009

Plant biology

Amiraソフトウエアは、高い精度と効率的なデータ統合により、植物生物学研究者が複雑な植物構造を細胞および細胞内レベルで可視化および解析するのに役立ちます。根、茎、葉、細胞構造などの植物組織分析のための自動化ワークフローを提供します。

パワフルなセグメンテーションツールと統合されたAIソリュー
ションにより、Amiraソフトウエアはデータ処理の精度とスピードを向上させ、従来の方法を上回ります。また、マルチモーダル
イメージングデータを統合して、異なるデータタイプのシームレスな相関を実現します。これは、成長パターンの追跡、環境刺激に対する細胞反応の研究、植物-微生物相互作用の理解に不可欠です。

Amiraソフトウエアによる3Dチラコイドおよびピレノイド。

生体工学、生体材料

Amiraソフトウエアは、皮質骨および海綿骨のセグメンテーションに特化したワークフローなど、半自動および全自動のワークフ
ローを提供することで、生体工学者が直面する骨のセグメンテーションという労力を要する課題に対処しています。20年近くにわたり開発されてきたこの堅牢なフレームワークは、研究者のニーズに合わせて継続的に改善されています。

Amiraソフトウエアはデジタルボリューム相関法（DVC）にも対応しており、研究者は生体組織やインプラント内の3D体積変位およびひずみデータを非接触で測定することができます。この能力は、骨の力学的特性を研究し、ひずみ伝達および破壊メカニズムを理解するために不可欠です。