TaqMan™ SNP Genotyping Assay, human
TaqMan™ SNP Genotyping Assay, human
Applied Biosystems™

TaqMan™ SNP Genotyping Assay, human

Green features
Applied Biosystems TaqMan SNP Genotyping Assays は、TaqMan 5´-ヌクレアーゼケミストリを使用して、精製ゲノム詳細を見る
製品番号(カタログ番号)数量
4351374L (2400 reactions), made to order
4351376M (1000 reactions), made to order
4351379S (300 reactions), made to order
製品番号(カタログ番号) 4351374
価格(JPY)
273,900
Each
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数量:
L (2400 reactions), made to order
Applied Biosystems TaqMan SNP Genotyping Assays は、TaqMan 5´-ヌクレアーゼケミストリを使用して、精製ゲノム DNA サンプルにおける特定の遺伝子多型の増幅と検出を行います。各アッセイは、非蛍光クエンチャー(NFQ)が付加したアレル特異的な TaqMan マイナーグルーブバインダー(MGB)プローブ 2 本と配列特異的なプライマー 2 本から構成され、個人の一塩基多型(SNP)のジェノタイピングを可能とします。VIC 色素で標識されたプローブが Allele 1 配列を検出し、FAM 色素で標識されたプローブが Allele 2 配列を検出します。

当社の設計済み TaqMan SNP Genotyping Human Assays は、1000 ゲノムの高頻度 SNP、HapMap SNP、およびコード SNP を含む数百万種類のヒトアッセイのゲノムワイドなコレクションです。

特長:
実証済み—ゴールドスタンダードの TaqMan ケミストリおよび確固としたアッセイデザインにより高い精度、再現性と信頼性のある結果を取得
簡単—便利なシングルチューブフォーマットとシンプルなワークフローにより最適化不要で信頼できる結果を簡単に取得
関連コンテンツの検索が簡単—設計済みヒトアッセイの幅広いコレクションが目的の研究に関連するコンテンツへの直接アクセスを提供
テスト済みすべてのヒト SNP ジェノタイピングアッセイについて、アレル識別を確実にするための機能テストを実施

納期
ご注文から 2 ~ 3 週間程度でお届けします。

TaqMan SNP Genotyping Assays に必要なのは、3 つの反応成分 - 精製ゲノム DNA(1 ~ 20 ng、アッセイ溶液、および TaqMan Genotyping Master Mix(または他の適合するマスターミックス)(別売)- のみです。

すべてのアッセイは、10 年以上にわたり蓄積された製造およびアッセイ性能データから推測されるデザインルールを活用して最適化された当社のバイオインフォマティクスパイプラインを使用してデザインされています。TaqMan Assays は、40,000 以上の文献と 350 以上の特許に裏付けられた実績があります。

すべての設計済み TaqMan Assays は、TaqMan Assays qPCR Guaranteeによって保証されます。*

推奨されるマスターミックス(別売):TaqMan Genotyping Master Mix

*保証の利用条件についてはこちらをご覧ください。 www.thermofisher.com/taqmanguarantee.

研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。
仕様
3'プライマー修飾None
5'プライマー修飾None
概要VIC™ - MGB probe detects Allele 1, FAM - MGB probe detects Allele 2
使用対象 (装置)7500 System, 7500 Fast System, 7900HT System, StepOne™, StepOnePlus™, ViiA™ 7 System, QuantStudio™ Absolute Q Digital PCR System, QuantStudio™ 3, QuantStudio™ 5, QuantStudio™ 6 Flex, QuantStudio™ 7 Flex, QuantStudio 6 Pro, QuantStudio 7 Pro, QuantStudio™ 12k Flex ProFlex PCR System*, VeritiPro*, SimpliAmp*, MiniAmp*, Automated Thermal Cycler** If a thermal cycler is used for PCR amplification, the optional pre-read and the post-read must be performed separately on a real-time PCR system in order to detect and record fluorescent signals.
グリーン機能Sustainable packaging
内部プローブの変更VIC™ (5'), FAM (5'), MGB (Minor Groove Binder) (3')
反応数2400 reactions
製品ラインTaqMan
精製方法Solid Phase Extraction (SPE)
純度または品質グレードRNase-Free, DNase-Free
数量L (2400 reactions), made to order
サンプルタイプHuman
出荷条件Room Temperature
Human
ターゲットOver 4.5 million genome-wide human assays are available
濃度80X
使用対象(アプリケーション)Genotyping
形状Frozen
標識または色素FAM, VIC
Unit SizeEach
組成および保存条件
1 tube containing a 40X (S and M sizes) or 80X (L size) mix of pre-formulated assay (2 probes and 2 primers).

Store at -15 to -25°C.

よくあるご質問(FAQ)

TaqMan® もしくは Custom TaqMan® Gene ExpressionとSNP Genotyping Assaysの保存はどのようにすればよいのでしょうか?

納品後、アッセイは-15℃から-20℃で保存してください。凍結融解は最少になるようにしてください(最大でも10回以下にすることを推奨しています)。またTaqMan®もしくはCustom TaqMan® Gene Expression と SNP Genotyping Assaysは、直接的な光への露出は避けてください。過剰な光への露出は蛍光プローブに影響を及ぼします。必要がれば、TEバッファーもしくはDNase free waterでアッセイミックスを稀釈してください。納品されたミックスからワーキングストックソリューションを作成することを推奨しています。

全てのTaqMan® SNP assaysは"Functionally Tested"、もしくは"Validated and Functionally Tested"で提供されていますか?

はい。それぞれのTaqMan® SNP Genotyping Assayは幾つかの人種集団サンプルを用いてテストされています。Validatedアッセイは厳しい性能基準を満たすために各集団45個体のサンプルでテストされており、HapMap、JSNP、NCBIなどの様々なソースからのマイナーアレル頻度情報も付加されています。一方、Functionally Tested アッセイは複数人種集団からなる、10〜20個体のサンプルでテストされておりますが、サンプル数が少ないためにマイナーアレルが検出されていない場合があります。これは、Custom TaqMan®SNP Genotyping Assaysのヒト用アッセイにも適用されますが、ヒト以外用のアッセイについては適用されません。

How do I set up a reference panel in the TaqMan Genotyper Software?

A reference panel is helpful in large studies to mark your reference samples. Please follow the directions here on how to set up a reference panel.

How do I enter the polymorphism sequence information (i.e., A, C, G, T) for my assays, and where is this info displayed in the TaqMan Genotyper Software?

The polymorphism sequence info can be entered into the software through Setup >Assays. You can import an assay information file (AIF) that contains this info for your assays (AIFs are shipped with assay orders), or manually enter this info for each assay using the edit assay feature. The polymorphism sequence info will be displayed in the assays table under allele1 base and allele2 base, in the results table in the calls column, in the cluster plot display in the x-axis and y-axis titles, and in the export files as genotypes. If no sequence information is entered for an assay, the default display for genotype calls will use the dye names, such as VIC/VIC, VIC/FAM or FAM/FAM dyes.

What is the bookmarking feature in the TaqMan Genotyper Software, and how would I use it?

Bookmarking is a unique feature in TaqMan Genotyper Software that allows you to tag a data point or well while reviewing results in a Study. For example, in reviewing a cluster plot for an assay, a data point is observed to be somewhat between clusters. You can set a bookmark for this data point to denote this well for further investigation. The bookmark persists between the Results workspace and Quality Control workspace, so you can easily identify the data point in a cluster plot, experiment plate view, or on the samples tab. Bookmarks are cleared upon exit from a Study or exit from the application.

引用および参考文献 (1421)

引用および参考文献
Abstract
Determination, mechanism and monitoring of knockdown resistance in permethrin-resistant human head lice, Pediculus humanus capitis
Authors:Clark, JM
Journal:JOURNAL OF ASIA-PACIFIC ENTOMOLOGY
PubMed ID:
Permethrin resistance has been reported worldwide and clinical failures to commercial pediculicides containing permethrin have likewise occurred. Permethrin resistance in head lice populations from the U.S. is widespread but is not yet uniform and the level of resistance is relatively low (∼4-8 fold). Permethrin-resistant lice are cross-resistant to pyrethrins, PBO-synergized ... More
Geographical mapping of a multifocal thyroid tumour using genetic alteration analysis & miRNA profiling
Authors:Aherne, ST; Smyth, PC; Flavin, RJ; Russell, SM; Denning, KM; Li, JH; Guenther, SM; O'Leary, JJ; Sheils, OM
Journal:Molecular Cancer
PubMed ID:
Background: Papillary thyroid carcinoma (PTC) frequently presents as multiple tumour-foci within a single thyroid gland or pluriform, with synchronous tumours comprising different histological variants, raising questions regarding its clonality. Among the genetic aberrations described in PTC, the BRAF V600E mutation and ret/PTC activation occur most commonly. Several studies have investigated ... More
Risk haplotype analysis for bovine paratuberculosis
Authors:Pinedo, PJ; Wang, CG; Li, Y; Rae, DO; Wu, RL
Journal:MAMMALIAN GENOME
PubMed ID:
Paratuberculosis (Johne's disease), caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, is an important disease for bovines, although its genetic basis is poorly understood. In this study, three candidate genes were typed to study the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and paratuberculosis susceptibility (measured in a 1 or 0 form) at ... More
Risk haplotype analysis for bovine paratuberculosis
Authors:Pinedo, PJ; Wang, CG; Li, Y; Rae, DO; Wu, RL
Journal:JOURNAL OF NEURAL TRANSMISSION
PubMed ID:
Paratuberculosis (Johne's disease), caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, is an important disease for bovines, although its genetic basis is poorly understood. In this study, three candidate genes were typed to study the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and paratuberculosis susceptibility (measured in a 1 or 0 form) at ... More
Association of Polymorphisms in Genes of the Homologous Recombination DNA Repair Pathway and Thyroid Cancer Risk
Authors:Bastos, HN; Antao, MR; Silva, SN; Azevedo, AP; Manita, I; Teixeira, V; Pina, JE; Gil, OM; Ferreira, TC; Limbert, E; Rueff, J; Gaspar, JF
Journal:THYROID
PubMed ID:
Background: Ionizing radiation exposure has been pointed out as a risk factor for thyroid cancer. The double-strand breaks induced by this carcinogen are usually repaired by homologous recombination repair pathway, a pathway that includes several polymorphic genes. Since there is a scarcity of data about the involvement of these gene ... More