Custom TaqMan™ Copy Number Assay
Custom TaqMan™ Copy Number Assay
Applied Biosystems™

Custom TaqMan™ Copy Number Assay

Green features
ゴールドスタンダードの TaqMan MGB プローブケミストリを用いる Applied Biosystems TaqMan Copy Number Assays詳細を見る
製品番号(カタログ番号)数量
4400296L (2900 reactions), made to order
4400294S (360 reactions), made to order
4400295M (750 reactions), made to order
製品番号(カタログ番号) 4400296
価格(JPY)
272,700
Each
注文する
数量:
L (2900 reactions), made to order
ゴールドスタンダードの TaqMan MGB プローブケミストリを用いる Applied Biosystems TaqMan Copy Number Assays は、Applied Biosystems リアルタイム PCR 機器とソフトウェアを使用してゲノム DNA ターゲットのコピー数を測定します。TaqMan Copy Number Assays は、TaqMan Copy Number Reference Assay とともにデュプレックス qPCR に使用します。コピー数アッセイによりターゲット配列が検出され、リファレンスアッセイにより二倍体ゲノムにおいて 2 コピーで存在することが知られている配列が検出されます。その後、Applied Biosystems CopyCaller ソフトウェアを用いて、相対定量法により結果を解析します。

Custom TaqMan Copy Number Assays は、設計済みアッセイにない目的ターゲットのアッセイを行うためのオプションです。GeneAssist Copy Number Assay Tool を使用して、マスク済みのアッセイ設計用カスタムターゲット配列やアッセイ試薬用プライマー/プローブ ペア配列を追加料金なしで提出することが可能です。Custom TaqMan Copy Number Assays の設計プロセスには、事前のバイオインフォマティクス配列解析や in silico QC は含まれませんが、デュプレックス PCR におけるヒト/マウスリファレンスアッセイ適合性の確認は含まれます。

特長:
フレキシブル—GeneAssist Copy Number Assay Tool を用いて、生物種を限定せずにあらゆる目的ターゲット用のアッセイを作製
高い特異性—ゴールドスタンダードの TaqMan ケミストリにマイナーグルーブバインダー(MGB)プローブを組み合わせることで、より短いプローブでのアッセイ特異性が向上
優れた再現性—最適化されたアルゴリズムを用いて開発された堅牢なアッセイデザインにより高い精度、再現性と信頼性のある結果を実現
解釈が容易—CopyCaller ソフトウェアから算出されるコピー数と推定コピー数を信頼値および Z-スコア Quality Metrics とともに提供  
迅速かつシンプル—セットアップから一次解析まで 3–4 時間

納期
ご注文から 2 ~ 3 週間程度でお届けします。

TaqMan Assays は、40,000 以上の文献と 350 以上の特許に裏付けられた実績があります。

TaqMan Copy Number Reference Assaysは、別売されています。

推奨されるマスターミックス(別売):TaqMan Genotyping Master Mix

研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。
仕様
フィデリティ(vs. Taq)60 X
フォーマットTube
グリーン機能Sustainable packaging
反応数2900 reactions
製品ラインTaqMan
製品タイプCustom TaqMan™ Copy Number Assay
数量L (2900 reactions), made to order
出荷条件Room Temperature
容量967 μL
濃度60X
検出法Primer-probe
PCR法qPCR
反応速度高速
Unit SizeEach
組成および保存条件
1 tube containing a 20X (S and M sizes) or 60X (L size) mix of pre-formulated assay (1 probe and 2 primers).

Store at -15 to -25°C.

よくあるご質問(FAQ)

Can I use TaqMan Gene Expression Assays for a gene copy number study?

TaqMan Gene Expression Assays with “_s1” as assay ID suffix are the assays whose primers and probes are designed within a single exon, and therefore, will detect genomic DNA. However, the application of these assays in gene copy number studies has not been validated. Other gene expression assays will not detect gDNA, let alone the region of variance.

What type of samples should be run with TaqMan Copy Number Assays?

These assays target regions of variance that are found in genomic DNA.

Do I need to do a validation test before I use the ΔΔCt method to determine the copy number of the target gene?

If you are using our copy number assays and reference assays, this is not necessary.

Where can I get reference samples for TaqMan Copy Number Assays?

We recommend that you check the DGV (database of genomic variants) database for your CNV of interest. Not all regions of variance have control samples available, but if there are controls for your CNV, the DGV will list some Coriell sample ids. You can then order these control samples from Coriell.

What TaqMan Copy Number Assays are available now?

We have predesigned TaqMan Copy number assays for human and mouse, and we also have the Geneassist Copy number assay workflow builder tool that you may use to submit sequences for custom designed assays. Copy number variation experiments require a reference assay run in duplex with the target assay. We offer RNase P and TERT reference assays for human, and we offer Tfrc and TERT reference assays for mouse. The copy number assays are FAM-MGB labeled and the copy number reference assays are VIC-TAMRA labeled.