ハイスループットの抗体コンストラクト生成用の標準化DNAフラグメント

Invitrogen GeneArt HTP Strings DNA Fragmentsは、ハイスループットクローニングワークフローに容易に統合できるように設計されています。 これらのDNAフラグメントは、クローニング効率を高め、抗体スクリーニング用の発現コンストラクトの生成を合理化するように標準化されています。

オンラインオーダー

500個を超えるDNAフラグメントのご注文は、もっとも効率的に処理するために、オーダーフォームをダウンロードし、GeneArtサポートチームにご送信ください。

効率的なクローニングのための高品質DNA

スクリーニングの労力を低減するには、ハイスループットクローニングパイプラインでエラー率の低いDNAフラグメントを使用することが重要です。 GeneArt HTP Strings Fragmentsのエラー率は市場でもっとも低いレベルであるため、正確なクローンを最初から選択できる可能性を高めます。

この利点を実証するため、49の重鎖または軽鎖可変領域と6つの非抗体を含む55個のHTP Strings DNA Fragmentsのテストセットを次世代シーケンシングで評価したところ、平均95.1%の正確率を達成しました。 NGSの結果を確認し、産物に対する目的のクローニングアプリケーションの適合性を実証するため、(重鎖および軽鎖の可変領域をコードする)80個のHTP Strings DNA Fragmentsを適切なベクターにクローニングしました。 各サンプルの2つのクローンについて、正確性をPCRおよびシーケンシングにより判定しました。 合計で156/160クローン(97.5%)が正確でした。 さらに、テストしたすべてのサンプルについて、少なくとも1つの正しいクローンが同定されました(100%)。

適合分子の分布

図1は、160のクローンのうち156が正確な配列を示している、適合分子の分布の棒グラフです。

図1. 55個のHTP Strings DNAフラグメントのテストセットをNGSでシーケンスし、それぞれについて完全に正確な配列の割合を評価しました。 LSL(下限仕様限界)は、2つのクローンをスクリーニングする場合に、1つ以上の正確なクローンを同定するために必要な適合分子の割合です。

クローニングの性能

図2は、HTP DNAフラグメントのクローニング性能を示した棒グラフです

図2. 80個のHTP DNAフラグメント(48個のLC可変領域、32個のHC可変領域)のテストセットを、Golden Gateクローニングを使用して抗体の定常領域を含むpcDNA3.4にクローニングしました。 2つのクローンのコロニーPCRによる配列検証。

ダウンストリームでの発現を強化するためのシーケンス最適化

研究開発のワークフロー全体で効率を高めるために、タンパク質の発現を最大化する戦略を設計段階で検討する必要があります。 種に合ったコドンの使用やその他のシーケンス要因は、最終のタンパク質収量に大きな影響を与える可能性があります。 Invitrogen GeneArt GeneOptimizerアルゴリズムはシーケンスの最適化を可能にするため、ダウンストリームの結果の向上に役立ち、HTP Strings DNA Fragmentsを設計してオンラインで注文する際に適用できます。

GeneArt GeneOptimizerアルゴリズムの詳細はこちら

HTP DNAフラグメントの柔軟な納品フォーマット

お客様のニーズに合った、すぐに使用できる納品フォーマットを選択することで、液体処理ステップの削減に役立ちます。 複数の標準的な96ウェル保存プレート、または96 SBSフォーマットのThermo Scientific Matrixチューブなどの2Dバーコード付きチューブオプションから選択できます。

  • 特定のクローニング戦略に合わせてカスタム二本鎖DNAフラグメントを定義できます
  • プレートレイアウトをカスタマイズ可能です
  • フラグメントは水またはTEバッファー中で納品されます

ご要望に応じて、その他の納品フォーマットをご利用になれます。

長さ範囲200~450 bp
収量400 ng
標準化濃度:10 ng/µL
バッファーオプション
  • 低TE:10 mM Tris-HCl(pH 8.0)、0.1 mM EDTA(最高レベルのDNA安定性を得るために推奨)
  • ヌクレアーゼフリー水
納品フォーマット凍結
シーケンス検証次世代シーケンシング
サポートされているクローニングメソッドGolden Gate( scarless )、制限酵素
アダプターフラグメントの各末端に38 bpのユニバーサルリンカーが含まれているため、末端クローニング部位の外側にスタッファーシーケンスを追加する必要はありません。
最小ご注文サイズ192シーケンス
製造にかかる時間5~6営業日

抗体エンジニアリングに関する追加サービス

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

Stylesheet for Classic Wide Template adjustments