BS3-d0 (bis(sulfosuccinimidyl) suberate-d0)

Thermo Scientific Pierce BS3-d0/d4試薬は、BS3アミン反応性クロスリンカーの重（重水素化）および軽質量種の対応セットを形成し、質量分析によるクロスリンクペプチドの同定を容易にします。

BS3-d0/d4試薬は一般的なBS3クロスリンカー（製品番号21580）の質量類似体です。d-zero種（BS3-d0）は通常の水素原子を有し、d-four種（BS3-d4）は4つの重水素原子を含んでいるため、正確に4つの水素質量単位ほど重くなっています。この2種を混合して、相互作用するタンパク質のクロスリンクに使用すると、クロスリンクされた分子の明確な同定を可能にする特徴的な質量パターンを得られます。

BS3-d0/d4試薬の特長：

•重水素標識BS3とその標準的な水素のみの類似体—質量分析によるクロスリンクタンパク質構造：機能分析用に特別に製造
• クロスリンクフラグメントを容易に同定—ペプチド質量が4単位異なるため、タンパク質相互作用構造内の特定の遺伝子座にあるクロスリンクを明確に識別可能
• アプリケーション別の指示—初めてのユーザーをアプリケーションを通じてガイド
• メソッドに必要なタンパク質量はマイクログラム単位—多量のタンパク質、特殊溶媒、または結晶形成が必要なNMRまたはＸ線結晶学ベースの方法に代わる優れた方法

化学構造中の重水素原子の数のみが異なる2つの同一クロスリンカーの等モル混合物を加えることは、質量分析により低含量の単一クロスリンクペプチドを同定するための強力な方法です。クロスリンクタンパク質とBS2G-d0/d4試薬の相互作用は、クロスリンクしたタンパク質またはタンパク質複合体を酵素分解後、得られたクロスリンクペプチドが4つの質量単位ほど異なるMSパターンを生成します。反応生成物をさらに分析すると、低分解能の3次元構造情報を得られます。

BS3-d0/d4およびBS2G-d0/BS2G-d4試薬は、特定のスペーサーアーム長を有するホモ二官能性、アミン反応性、非切断性の水溶性クロスリンカーです。これらの試薬は、タンパク質構造機能研究において空間的関係性を推定するための分子定規として機能します。軽および重水素化類似体はともに、pH 7～9で1級アミン（—NH2）と効率的に反応し、安定したアミド結合を形成します。タンパク質は通常、リジン（K）残基の側鎖と各ポリペプチドのN末端に複数の1級アミンを有しており、これらは、各試薬中に存在する2つのスルホ-NHSエステル反応基の標的として利用できます。これらの試薬はナトリウム塩として提供され、10 mMの濃度まで水に溶解します。

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