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依樣本類型排序的 RNA 萃取
無論您是從培養細胞或組織樣本開始，還是處理植物、細菌或哺乳動物細胞，Ambion RNA 萃取試劑與套組都能為您的研究提供最合適的產品。Ambion 品牌包括舊有的 Invitrogen 產品，例如值得信賴的 TRIzol 試劑與 PureLink 純化套組，以及 Cells-to-CT、MagMAX 和 RNAlater 套組與試劑等首要 Ambion 產品。
哪一個血液樣本的 RNA 萃取套組最適合您？
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| 針對液態樣本最佳化 | 移除無核紅血球的專用套組 | 具 96 管柱的濾盤形式，適合 HTP 需求 | 針對穩定血液樣本之純化最佳化的 HTP | HTP 形式，可回收所有大小的 RNA (包括微型 RNA) | 直接使用全血取得高 RNA 產量，無須分離 WBC | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TRIzol LS | PureLink 總 RNA 血液套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | MagMAX 穩定血液試管 RNA 分離套組 | MagMAX mirVana 總 RNA 分離 | RiboPure 血液套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | |||||
| 相容的穩定試劑 | EDTA、肝素、檸檬酸鹽、RNAlater | EDTA、肝素、檸檬酸鹽 | EDTA、肝素、檸檬酸鹽 | Tempus 或 PaxGene 試管 | EDTA 或檸檬酸鹽 | EDTA、肝素、檸檬酸鹽、RNAlater |
| 內含穩定試劑 | ✓ RNAlater | |||||
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 快速、便利的盤形式二氧化矽管柱 | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) |
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 2 小時內即可完成 12 支試管 | <1 小時即可完成 96 個樣本 | 30 分鐘 | |
| 適用於高處理量 | ✓ | ✓ | ✓ |
如需處理血液的詳細資訊，請檢閱我們的技術文章：
補充實驗流程
技術說明文章
- 處理血液樣本的提示與訣竅
- 從血液樣本萃取微型 RNA - 技術說明 13(1)
- 哺乳動物、植物和病毒樣本的高處理量 RNA 回收 - 技術說明 13(1)
- 針對陣列分析和其他實驗改進 RNA 分離 - 技術說明 10(3)
- 改進版小鼠血液樣本基因表現剖析 - 技術說明 13(4)
- 改進版血液樣本基因表現剖析方法 - 技術說明 13(3)
- 改進版使用全血 RNA 樣本之微陣列靈敏度 - 技術說明 12(3)
- 從創新濾器系統捕捉的白血球分離 RNA - 技術說明 12(4)
- 組織、無細胞樣本和血液的低與高處理量 RNA 分離 - 技術說明 13(2)
- 白血球的 miRNA 表現 - 技術說明 11(3)
- 從血液樣本取得最高品質 RNA - 技術說明 16(1)
- 直接從全血純化 RNA - 技術說明 11(4)
- 從數滴小鼠血液定量 miRNA - 技術說明 14(4)
- 研究重點摘要：血液樣本的卓越微陣列分析資料 - 技術說明 14(4)
- 血液 RNA 萃取：為您的基因表現研究選擇最佳系統 - 技術說明 14(2)
- 從小鼠全血取得 RNA 以進行表現剖析 - 技術說明 13(3)
- 血液樣本的穩健高處理量 RNA 分離 - 技術說明 12(3)
- 人類全血樣本的卓越基因表現剖析 - 技術說明 14(3)
- 從全血取得總 RNA 以進行表現剖析 - 技術說明 12(2)
從培養細胞純化 RNA 在傳統上一直都是高度重複、時間密集且勞力密集的程序，經常牽涉到有毒有機化學物質的使用。我們 RNA 專家所開發的產品可讓您使用數種技術形式 (有機萃取、玻璃纖維管柱、磁珠，以及這些形式的搭配使用)，來分離出最大產量、最高純度且最高完整性的 RNA。
您亦可分析培養細胞溶解產物而無須先行分離 RNA。在大幅縮短的時間內，您便可取得相當於使用純化 RNA 所取得的 qPCR 結果，在某些情況下甚至有過之而無不及。Cells-to-CT 和 Single Cell-to-CT 產品線等 Invitrogen 產品提供極佳成效和處理優勢。
哪一個培養細胞的 RNA 分離套組最適合您？
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| 高純度、高完整性 RNA | 適用於 RNA (>200 nt)、快速又便利的管柱形式 | 適用於 96 個樣本 (RNA > 200 nt)、快速又便利的管柱型濾盤形式 | 快速又便利的管柱型有限樣本輸入方法 (RNA >200 nt) | 適用於小片段 RNA 種類、快速又便利的方法 | 細胞至 qRT-PCR 的完整系統，無須 RNA 純化 | |
| TRIzol 試劑 | PureLink RNA 迷你套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | PureLink RNA 微規模套組 | MirVana miRNA 分離套組 | Cells-to-CT 套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 30 分鐘 | <10 分鐘 |
| 細胞溶解方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 非毒性異硫氰酸胍溶解 | 非毒性異硫氰酸胍溶解 | 非毒性異硫氰酸胍溶解 | 有機萃取然後酒精沉澱 | Cells-to-CT 溶解 |
| 起始材料量 | 最多 1x107 顆細胞 | 5x106 至 1x108 顆細胞 | 5x106 至 1x108 顆細胞 | 最多 5x105 顆細胞 | 102-107 顆培養細胞 | 10-100,000 顆細胞 |
| 應用 | 所有 RNA 表現方法 | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | 微型 RNA 分析 | qRT-PCR |
保存和穩定 RNA
RNAlater 溶液廣泛用於完整動物組織、器官與細胞以及細菌的 RNA 保存。它排除了立即處理樣本以進行 RNA 分離或將其冷凍於液態氮以待後續處理的需要。
技術資源
哪一個 FFPE 樣本的 RNA 萃取套組最適合您？
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| 相同 FFPE 部位之 RNA 與 DNA 的低處理量分離 | 相同 FFPE 部位之 RNA 與 DNA 的可擴增分離 | |
|---|---|---|
| RecoverAll FFPE 總核酸分離套組 | MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 套組 | |
| 製備時間 | 4.5 小時 (16 個樣本的總時間) 2.5 小時人工處理時間 | 4 小時 (96 次製備的總時間) 1 小時人工處理時間 |
| 萃取的最終產物 | 總 RNA、微型 RNA、gDNA | 總 RNA、微型 RNA、gDNA |
| 分離方法 | 管柱純化 | 磁珠純化 |
| 需要脫蠟 | ✓ | ✓ |
| 適用於自動化 (脫蠟後) | ✓ (KF Flex 和 Duo Prime 的指令碼) | |
| 適用的 FFPE 樣本範圍 | 最多 4 x 20 微米切片 (300 mm2 組織) | 最多 2 x 20 微米切片 (300 mm2 組織) |
| 樣本體積 | 約 50µL 純化 DNA 約 50µL 純化 RNA | 約 50µL 純化 DNA 約 50µL 純化 RNA |
| 適用於 Ion AmpliSeq DNA 板 (例如 Cancer Hotspot Panel v2) | ✓ | ✓ |
| 適用於 Ion AmpliSeq RNA 板 (例如 RNA 癌症與 RNA 融合) | ✓ | ✓ |
為何從 FFPE 分離 RNA 這麼有挑戰性？
從 FFPE 檢體回收高品質 RNA 相當具有挑戰性。固定程序會使得核酸與蛋白質之間產生交聯，並會對鹼基進行甲基加成反應來對 RNA 進行共價修飾。因此，分子具備剛性且易受機械剪力影響，而交聯可能會使 RNA 無法作為反轉錄的基質。所以，為了利用 FFPE 組織作為基因表現分析的來源，需要可靠的方法來從交聯的基質萃取 RNA。
要如何提高使用 FFPE 的成功機會？
有許多因素會影響從 FFPE 組織分離之 RNA 的整體品質與產量。下列是處理幾項關鍵因素的建議：
- 上游組織取得與組織檢體製備 - 應盡可能在進行手術切除後的一小時內固定組織。在完成固定程序之前，有可能會發生大規模 RNA 降解。最佳固定時間為 12–24 小時，使用中性緩衝福馬林或多聚甲醛。固定的組織在包埋程序之前應徹底脫水。
- 塊狀樣本存放 - 盡可能存放沒有切面的塊狀樣本，以避免因暴露於大氣中的氧、水，以及光和侵擾 (真菌、昆蟲等) 等其他環境因素而不斷受損。
- 用於 RNA 分離的組織類型、大小和數量 - 建議的組織厚度為 10–20 µm；所使用的切片數量取決於組織類型 (這會影響細胞密度) 以及表面積 (建議大小：50–300 mm2)。過多的起始材料可能會造成濾器阻塞，導致產量不佳。
- 用於包埋組織的石蠟過量 - 應盡可能在純化流程開始前將過多的石蠟去除。對於以二甲苯為基礎的純化方法，兩次於室溫下的二甲苯處理應足以完成脫蠟。如有需要，可進行更徹底的 37–55°C 處理，最多可達 30 分鐘。進行二甲苯脫蠟後，請務必在兩次 100% 乙醇清洗後完全去除 100% 乙醇，且沉澱物必須為乾燥狀態。磁珠方法採用創新化學技術來處理將輸入限制為 20 µm 切片的石蠟。
MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 套組採用 Invitrogen MagMAX 磁性粒子，能對 FFPE 樣本的總 RNA 和 DNA 進行快速、有效率且可自動化的分離。Invitrogen MagMAX FFPE NA 套組提供更快工作流程並使用更少試劑，不會在過程中犧牲品質。這些套組有助於提供媲美同級最佳 RecoverAll 濾器型系統的核酸產量和純度。MagMAX FFPE NA 套組的成效超越採用類似實驗流程的產品，且所取得的 RNA 和 DNA 產量不輸需時更長、更危險且更低處理量的實驗流程。
RecoverAll 總核酸分離套組程序在分離 RNA 時，需要大約 45 分鐘的人工處理時間，並可輕鬆地在不到 1 天之內完成。FFPE 樣本要使用一連串的二甲苯和乙醇清洗來脫蠟。接著，以針對回收 RNA 或 DNA 調整的培養時間，對其進行徹底的蛋白酶剪切。使用快速玻璃濾器方法 (含濾器上核酸酶處理) 純化核酸，然後將其溶析至水中或隨附的低鹽緩衝液中。
技術資源
技術說明文章
- 從 FFPE 樣本萃取核酸
- 精確且靈敏地定量 FFPE 組織的微型 RNA - 技術說明 16(1)：此研究說明如何從福馬林或多聚甲醛固定石蠟包埋 (FFPE) 樣本成功分離和精確測量 miRNA 表現。
- 更快從 FFPE 組織分離核酸 - 技術說明 16(1)：Applied Biosystems 改進了 Invitrogen Ambion RecoverAll FFPE 組織總核酸分離套組的實驗流程，使得處理時間顯著下降。
- 最佳化 FFPE 樣本基因表現分析 - 技術說明 14(3)：此處呈現的最佳化實驗流程可用於可靠地使用分離自 FFPE 樣本的 RNA 與即時 RT-PCR 來定量 mRNA 表現程度。
- 從福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織回收高產量總核酸 - 技術說明 12(3)：Ambion 的新 RecoverAll 套組讓研究人員得以從 FFPE 樣本分離 DNA 和/或 RNA (包括微型 RNA)。回收的核酸非常適合用於各種下游應用，例如：微陣列分析、qRT-PCR 和突變篩檢。
- 使用從相符之的福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 及新鮮冷凍樣本的 RNA 來進行微型 RNA分析
- 使用 TaqMan 微型 RNA 檢定從相符之 FFPE 及急速冷凍組織取得的 miRNA 定量資料具高度相關性
- 人類 FFPE 樣本的 DNA 基因型鑑定 - 可靠且具再現性：應用備註
- 針對基因表現分析最佳化 FFPE 樣本之 RNA 的萃取和定量
- 實驗流程：製備 FFPE 小片段 RNA 庫以進行 SOLiD 定序
- RecoverAll™ 總核酸分離套組
實驗桌提示
您的資料
- 在 FFPE 病患樣本中識別癌症相關 mRNA 特徵：H. Lee Moffitt 癌症中心與研究機構 (佛羅里達州坦帕市) Yeatman 實驗室研究定義結腸癌、乳癌及其他癌症的基因表現特徵。
- LCM 染色對於即時 RT-PCR 的影響：研究證實，Ambion LCM 染色套組可順利用於福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織，不會影響萃取之 RNA 的產量或品質。
應用備註
產品公告
哪一個植物 RNA 分離套組適合您？
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| 非常適合困難樣本 (松柏類組織與種子) | 快速且易於使用 | 有效回收微型 RNA 和小片段 RNA | 快速且完全自動化 | |
|---|---|---|---|---|
| 植物 RNA 試劑 | PureLink RNA 迷你套組 | mirVana miRNA 分離套組 | MagMAX-96 總 RNA 分離套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | |||
| 分離的 RNA 類型 | 僅限大分子 RNA | 僅限大分子 RNA | 小與大分子 RNA | 僅限大分子 RNA |
| 製備時間 | 60 分鐘 | <20 分鐘 | 30 分鐘 | <45 分鐘 |
| 起始材料量 | 最多 1 g | <250 mg | 0.5 至 250 mg | 最多 10 mg |
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 |
| 適用於高處理量 | ✓ | |||
| 相容產品 | Ambion 植物 RNA 分離輔助工具 去除常見植物汙染物 | Ambion 植物 RNA 分離輔助工具 去除常見植物汙染物 | Ambion 植物 RNA 分離輔助工具 去除常見植物汙染物 |
去除多醣類
植物 RNA 分離的其中一項主要問題就是存在造成問題的生物分子，例如多酚化合物和多醣類。Ambion 植物 RNA 分離輔助工具藉由添加聚乙烯吡咯烷酮 (會結合多酚類和多醣類的高分子量聚合物) 以及萃取前離心步驟來盡可能減少這些汙染物。
保存和穩定 RNA
RNAlater 溶液廣泛用於完整動物組織、器官與細胞以及細菌的 RNA 保存。它盡可能減少了立即處理樣本以進行 RNA 分離或將其冷凍於液態氮以待後續處理的需要。
技術資源
哪一個組織 RNA 萃取套組適合您？
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| 高純度、高完整性 RNA 的黃金標準 | 簡易、可靠且快速的方法 | 適用於 96 個樣本 (RNA > 200 nt)、快速又便利的管柱型濾盤形式 | 快速又便利的管柱型有限樣本輸入方法 (RNA >200 nt) | 適用於小片段 RNA 種類、快速又便利的方法 | 最高純度 TRIzol + 管柱純化，無須進行沉澱 | HTP 形式，可回收所有大小的 RNA (包括微型 RNA) | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TRIzol 試劑 | PureLink RNA 迷你套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | PureLink RNA 微規模套組 | mirVana miRNA 分離套組 | TRIzol Plus RNA 純化系統 | MagMAX mirVana 總 RNA 分離 | |
| 暢銷商品 | ✓ | ||||||
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 快速、便利的濾盤形式二氧化矽管柱 | 快速、便利的微二氧化矽管柱 | 有機萃取結合便利的二氧化矽管柱 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 |
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 30 分鐘 | 1 小時 | <1 小時 |
| 起始材料量 | 最多 100 mg | 10 mg 至 100 mg | 10 顆細胞至 10 mg | 最多 10 mg | 最多 250 mg 組織 | 最多 100 mg | 最多 50 mg |
| 適用於高處理量 | ✓ | ✓ | |||||
| 製備規模 | 100 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 |
動物組織的 RNA 產量
RNA 含量在組織、細胞類型、生理狀態等之間的差異相當大。此圖表提供預估各種細胞與組織之 RNA 產量的一般準則。
表 1.各種組織在 1 mg 時的一般總 RNA 產量。
保存和穩定 RNA
RNAlater 溶液廣泛用於完整動物組織、器官與細胞以及細菌的 RNA 保存。它排除了立即處理樣本以進行 RNA 分離或將其冷凍於液態氮以待後續處理的需要。
技術資源
哪一個酵母菌 RNA 萃取套組適合您？
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| 快速且完全自動化 | 快速且易於使用 | 針對強韌酵母菌細胞壁而設計，同時還能維持表現圖譜 | 適用於 96 個樣本 (RNA > 200 nt)、快速又便利的管柱型濾盤形式 | |
|---|---|---|---|---|
| Platinum Taq MagMAX 微陣列總 RNA 分離套組 | PureLink RNA 迷你套組 | RiboPure-酵母菌套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | |||
| 包含細胞溶解專用珠粒 | 否 | 否 | 氧化鋯珠粒 | 否 |
| 分離方法 | 取得最高純度的可擴增彈性形式；包含有機萃取和磁珠 | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 | 快速、便利的 96 孔濾盤形式二氧化矽管柱 |
| 製備時間 | <1 小時 | 20 分鐘 | 90 分鐘 (包含去氧核醣核酸酶處理) | 20 分鐘 |
| 起始材料量 | 最多 5 x 106 顆細胞 | 最多 5 x 108 顆細胞 | 最多 3 x 108 顆細胞 | 1.8 mL 新鮮對數期酵母菌細胞 (OD660=0.6–0.8) |
| 適用於高處理量 | ✓ | |||
| 套組大小 | 96 次製備 | 50 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 |
技術資源
不同於真核細胞，酵母菌和許多細菌菌株都受到難以破壞的細胞壁保護。作為第一步，必須先進行有效的細胞溶解 (一般透過機械式破壞或酵素前處理) 才能進行任何 RNA 分離程序。
Ambion RNA 專家所開發的一系列產品將協助您從細菌和酵母菌分離出高產量、完整的純 RNA。
哪一個細菌 RNA 萃取套組最適合您？
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| 無溶解程序 | 快速又輕鬆，20 分鐘 | 快速、便利的濾盤形式二氧化矽管柱式 | HTP，45 分鐘 | 非常適合難以溶解的革蘭氏陽性菌 | |
|---|---|---|---|---|---|
| TRIzol Max 細菌 RNA 分離套組 (含 TRIzol & Max 細菌增強試劑) | PureLink RNA 迷你套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | MagMAX 總核酸分離套組 | RiboPure 細菌套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | ||||
| 包含細胞溶解專用珠粒 | 否 | 否 | 否 | 氧化鋯珠粒 | 氧化鋯珠粒 |
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 快速、便利的 96 孔濾盤形式二氧化矽管柱 | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) |
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 45 分鐘 | 1 小時 |
| 起始材料量 | 最多 1 x 108 顆細胞 | 最多 1 x 109 顆細胞 | 最多 1 x 109 顆細胞 | 最多 0.3 g 固態樣本或 175 µl 液態樣本 | 最多 109 顆細胞 |
| 適用於高處理量 | ✓ | ✓ | |||
| 套組大小 | 100 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 | 100 次製備 | 50 次製備 |
技術資源
越來越多生物 (動物、昆蟲、植物、真菌、細菌) 與環境 (水、空氣、食物) 樣本的病毒分析採用需要受試樣本之病毒 RNA 或 DNA 的分子試驗策略。純化病毒 RNA 為取得良好回收率與偵測靈敏度帶來獨特的挑戰。Ambion RNA 專家已開發出經過最佳化的 RNA 純化產品，可處理各式各樣的樣本類型來提供最高病毒 RNA 產量、最高純度和最高完整性，並有數種形式可供選擇。
「PureLink 病毒 RNA/DNA 迷你套組的高濃縮病毒 RNA 提供了適用工具，可對病毒基因體進行更靈敏且更精細的下游分析」
杜克大學杜克人類疫苗機構 Feng Gao 醫師實驗室的 Dongning Wang 博士
產品規格
| 最適合的下游應用 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 產品 | 形式 | 即時 RT-PCR | 微陣列分析 | 定序 | 北方墨點法 | 選殖 |
總 RNA | ||||||
| PureLink 病毒 RNA⁄DNA 迷你套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ✓ | |||
| RNAqueous 套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| MagMAX AI⁄ND 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子 | ✓ | ✓ | |||
| MagMAX-96 AI⁄ND 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ✓ | |||
DNA/RNA | ||||||
| PureLink Pro 96 病毒 RNA⁄DNA 純化套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽過濾器，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ||||
| MagMAX 總核酸分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ✓ | |||
| MagMAX-96 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ✓ | |||
| Dynabeads SILANE 病毒核酸 | 離液鹽式溶解，磁珠，適用於自動化 | |||||
| iPrep PureLink 病毒套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，適用於自動化 | ✓ | ||||
| MagMAX 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子 | ✓ | ||||
| MagMAX-96 病毒 RNA 分離套組 (5 x 96 rxn) | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ||||
微型 RNA | ||||||
| mirVana miRNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ||||
| mirVana miRNA 分離套組 (無酚 - 必須另購) | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ||||
| TRIzol LS 試劑 | 於 TRIzol 試劑中溶解，單步驟試劑 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
mRNA | ||||||
| Dynabeads mRNA DIRECT 套組 | 離液鹽式溶解，磁珠 | ✓ | ✓ | |||
| Dynabeads mRNA DIRECT 微套組 | 離液鹽式溶解，磁珠 | ✓ | ✓ | |||
哪一個血液樣本的 RNA 萃取套組最適合您？
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| 針對液態樣本最佳化 | 移除無核紅血球的專用套組 | 具 96 管柱的濾盤形式，適合 HTP 需求 | 針對穩定血液樣本之純化最佳化的 HTP | HTP 形式，可回收所有大小的 RNA (包括微型 RNA) | 直接使用全血取得高 RNA 產量，無須分離 WBC | |
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| TRIzol LS | PureLink 總 RNA 血液套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | MagMAX 穩定血液試管 RNA 分離套組 | MagMAX mirVana 總 RNA 分離 | RiboPure 血液套組 | |
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| 相容的穩定試劑 | EDTA、肝素、檸檬酸鹽、RNAlater | EDTA、肝素、檸檬酸鹽 | EDTA、肝素、檸檬酸鹽 | Tempus 或 PaxGene 試管 | EDTA 或檸檬酸鹽 | EDTA、肝素、檸檬酸鹽、RNAlater |
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| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 快速、便利的盤形式二氧化矽管柱 | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) |
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 2 小時內即可完成 12 支試管 | <1 小時即可完成 96 個樣本 | 30 分鐘 | |
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補充實驗流程
技術說明文章
- 處理血液樣本的提示與訣竅
- 從血液樣本萃取微型 RNA - 技術說明 13(1)
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- 針對陣列分析和其他實驗改進 RNA 分離 - 技術說明 10(3)
- 改進版小鼠血液樣本基因表現剖析 - 技術說明 13(4)
- 改進版血液樣本基因表現剖析方法 - 技術說明 13(3)
- 改進版使用全血 RNA 樣本之微陣列靈敏度 - 技術說明 12(3)
- 從創新濾器系統捕捉的白血球分離 RNA - 技術說明 12(4)
- 組織、無細胞樣本和血液的低與高處理量 RNA 分離 - 技術說明 13(2)
- 白血球的 miRNA 表現 - 技術說明 11(3)
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從培養細胞純化 RNA 在傳統上一直都是高度重複、時間密集且勞力密集的程序，經常牽涉到有毒有機化學物質的使用。我們 RNA 專家所開發的產品可讓您使用數種技術形式 (有機萃取、玻璃纖維管柱、磁珠，以及這些形式的搭配使用)，來分離出最大產量、最高純度且最高完整性的 RNA。
您亦可分析培養細胞溶解產物而無須先行分離 RNA。在大幅縮短的時間內，您便可取得相當於使用純化 RNA 所取得的 qPCR 結果，在某些情況下甚至有過之而無不及。Cells-to-CT 和 Single Cell-to-CT 產品線等 Invitrogen 產品提供極佳成效和處理優勢。
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| TRIzol 試劑 | PureLink RNA 迷你套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | PureLink RNA 微規模套組 | MirVana miRNA 分離套組 | Cells-to-CT 套組 | |
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| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 30 分鐘 | <10 分鐘 |
| 細胞溶解方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 非毒性異硫氰酸胍溶解 | 非毒性異硫氰酸胍溶解 | 非毒性異硫氰酸胍溶解 | 有機萃取然後酒精沉澱 | Cells-to-CT 溶解 |
| 起始材料量 | 最多 1x107 顆細胞 | 5x106 至 1x108 顆細胞 | 5x106 至 1x108 顆細胞 | 最多 5x105 顆細胞 | 102-107 顆培養細胞 | 10-100,000 顆細胞 |
| 應用 | 所有 RNA 表現方法 | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | 微型 RNA 分析 | qRT-PCR |
保存和穩定 RNA
RNAlater 溶液廣泛用於完整動物組織、器官與細胞以及細菌的 RNA 保存。它排除了立即處理樣本以進行 RNA 分離或將其冷凍於液態氮以待後續處理的需要。
技術資源
哪一個 FFPE 樣本的 RNA 萃取套組最適合您？
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| 相同 FFPE 部位之 RNA 與 DNA 的低處理量分離 | 相同 FFPE 部位之 RNA 與 DNA 的可擴增分離 | |
|---|---|---|
| RecoverAll FFPE 總核酸分離套組 | MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 套組 | |
| 製備時間 | 4.5 小時 (16 個樣本的總時間) 2.5 小時人工處理時間 | 4 小時 (96 次製備的總時間) 1 小時人工處理時間 |
| 萃取的最終產物 | 總 RNA、微型 RNA、gDNA | 總 RNA、微型 RNA、gDNA |
| 分離方法 | 管柱純化 | 磁珠純化 |
| 需要脫蠟 | ✓ | ✓ |
| 適用於自動化 (脫蠟後) | ✓ (KF Flex 和 Duo Prime 的指令碼) | |
| 適用的 FFPE 樣本範圍 | 最多 4 x 20 微米切片 (300 mm2 組織) | 最多 2 x 20 微米切片 (300 mm2 組織) |
| 樣本體積 | 約 50µL 純化 DNA 約 50µL 純化 RNA | 約 50µL 純化 DNA 約 50µL 純化 RNA |
| 適用於 Ion AmpliSeq DNA 板 (例如 Cancer Hotspot Panel v2) | ✓ | ✓ |
| 適用於 Ion AmpliSeq RNA 板 (例如 RNA 癌症與 RNA 融合) | ✓ | ✓ |
為何從 FFPE 分離 RNA 這麼有挑戰性？
從 FFPE 檢體回收高品質 RNA 相當具有挑戰性。固定程序會使得核酸與蛋白質之間產生交聯，並會對鹼基進行甲基加成反應來對 RNA 進行共價修飾。因此，分子具備剛性且易受機械剪力影響，而交聯可能會使 RNA 無法作為反轉錄的基質。所以，為了利用 FFPE 組織作為基因表現分析的來源，需要可靠的方法來從交聯的基質萃取 RNA。
要如何提高使用 FFPE 的成功機會？
有許多因素會影響從 FFPE 組織分離之 RNA 的整體品質與產量。下列是處理幾項關鍵因素的建議：
- 上游組織取得與組織檢體製備 - 應盡可能在進行手術切除後的一小時內固定組織。在完成固定程序之前，有可能會發生大規模 RNA 降解。最佳固定時間為 12–24 小時，使用中性緩衝福馬林或多聚甲醛。固定的組織在包埋程序之前應徹底脫水。
- 塊狀樣本存放 - 盡可能存放沒有切面的塊狀樣本，以避免因暴露於大氣中的氧、水，以及光和侵擾 (真菌、昆蟲等) 等其他環境因素而不斷受損。
- 用於 RNA 分離的組織類型、大小和數量 - 建議的組織厚度為 10–20 µm；所使用的切片數量取決於組織類型 (這會影響細胞密度) 以及表面積 (建議大小：50–300 mm2)。過多的起始材料可能會造成濾器阻塞，導致產量不佳。
- 用於包埋組織的石蠟過量 - 應盡可能在純化流程開始前將過多的石蠟去除。對於以二甲苯為基礎的純化方法，兩次於室溫下的二甲苯處理應足以完成脫蠟。如有需要，可進行更徹底的 37–55°C 處理，最多可達 30 分鐘。進行二甲苯脫蠟後，請務必在兩次 100% 乙醇清洗後完全去除 100% 乙醇，且沉澱物必須為乾燥狀態。磁珠方法採用創新化學技術來處理將輸入限制為 20 µm 切片的石蠟。
MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 套組採用 Invitrogen MagMAX 磁性粒子，能對 FFPE 樣本的總 RNA 和 DNA 進行快速、有效率且可自動化的分離。Invitrogen MagMAX FFPE NA 套組提供更快工作流程並使用更少試劑，不會在過程中犧牲品質。這些套組有助於提供媲美同級最佳 RecoverAll 濾器型系統的核酸產量和純度。MagMAX FFPE NA 套組的成效超越採用類似實驗流程的產品，且所取得的 RNA 和 DNA 產量不輸需時更長、更危險且更低處理量的實驗流程。
RecoverAll 總核酸分離套組程序在分離 RNA 時，需要大約 45 分鐘的人工處理時間，並可輕鬆地在不到 1 天之內完成。FFPE 樣本要使用一連串的二甲苯和乙醇清洗來脫蠟。接著，以針對回收 RNA 或 DNA 調整的培養時間，對其進行徹底的蛋白酶剪切。使用快速玻璃濾器方法 (含濾器上核酸酶處理) 純化核酸，然後將其溶析至水中或隨附的低鹽緩衝液中。
技術資源
技術說明文章
- 從 FFPE 樣本萃取核酸
- 精確且靈敏地定量 FFPE 組織的微型 RNA - 技術說明 16(1)：此研究說明如何從福馬林或多聚甲醛固定石蠟包埋 (FFPE) 樣本成功分離和精確測量 miRNA 表現。
- 更快從 FFPE 組織分離核酸 - 技術說明 16(1)：Applied Biosystems 改進了 Invitrogen Ambion RecoverAll FFPE 組織總核酸分離套組的實驗流程，使得處理時間顯著下降。
- 最佳化 FFPE 樣本基因表現分析 - 技術說明 14(3)：此處呈現的最佳化實驗流程可用於可靠地使用分離自 FFPE 樣本的 RNA 與即時 RT-PCR 來定量 mRNA 表現程度。
- 從福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織回收高產量總核酸 - 技術說明 12(3)：Ambion 的新 RecoverAll 套組讓研究人員得以從 FFPE 樣本分離 DNA 和/或 RNA (包括微型 RNA)。回收的核酸非常適合用於各種下游應用，例如：微陣列分析、qRT-PCR 和突變篩檢。
- 使用從相符之的福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 及新鮮冷凍樣本的 RNA 來進行微型 RNA分析
- 使用 TaqMan 微型 RNA 檢定從相符之 FFPE 及急速冷凍組織取得的 miRNA 定量資料具高度相關性
- 人類 FFPE 樣本的 DNA 基因型鑑定 - 可靠且具再現性：應用備註
- 針對基因表現分析最佳化 FFPE 樣本之 RNA 的萃取和定量
- 實驗流程：製備 FFPE 小片段 RNA 庫以進行 SOLiD 定序
- RecoverAll™ 總核酸分離套組
實驗桌提示
您的資料
- 在 FFPE 病患樣本中識別癌症相關 mRNA 特徵：H. Lee Moffitt 癌症中心與研究機構 (佛羅里達州坦帕市) Yeatman 實驗室研究定義結腸癌、乳癌及其他癌症的基因表現特徵。
- LCM 染色對於即時 RT-PCR 的影響：研究證實，Ambion LCM 染色套組可順利用於福馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織，不會影響萃取之 RNA 的產量或品質。
應用備註
產品公告
哪一個植物 RNA 分離套組適合您？
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| 非常適合困難樣本 (松柏類組織與種子) | 快速且易於使用 | 有效回收微型 RNA 和小片段 RNA | 快速且完全自動化 | |
|---|---|---|---|---|
| 植物 RNA 試劑 | PureLink RNA 迷你套組 | mirVana miRNA 分離套組 | MagMAX-96 總 RNA 分離套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | |||
| 分離的 RNA 類型 | 僅限大分子 RNA | 僅限大分子 RNA | 小與大分子 RNA | 僅限大分子 RNA |
| 製備時間 | 60 分鐘 | <20 分鐘 | 30 分鐘 | <45 分鐘 |
| 起始材料量 | 最多 1 g | <250 mg | 0.5 至 250 mg | 最多 10 mg |
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 |
| 適用於高處理量 | ✓ | |||
| 相容產品 | Ambion 植物 RNA 分離輔助工具 去除常見植物汙染物 | Ambion 植物 RNA 分離輔助工具 去除常見植物汙染物 | Ambion 植物 RNA 分離輔助工具 去除常見植物汙染物 |
去除多醣類
植物 RNA 分離的其中一項主要問題就是存在造成問題的生物分子，例如多酚化合物和多醣類。Ambion 植物 RNA 分離輔助工具藉由添加聚乙烯吡咯烷酮 (會結合多酚類和多醣類的高分子量聚合物) 以及萃取前離心步驟來盡可能減少這些汙染物。
保存和穩定 RNA
RNAlater 溶液廣泛用於完整動物組織、器官與細胞以及細菌的 RNA 保存。它盡可能減少了立即處理樣本以進行 RNA 分離或將其冷凍於液態氮以待後續處理的需要。
技術資源
哪一個組織 RNA 萃取套組適合您？
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| 高純度、高完整性 RNA 的黃金標準 | 簡易、可靠且快速的方法 | 適用於 96 個樣本 (RNA > 200 nt)、快速又便利的管柱型濾盤形式 | 快速又便利的管柱型有限樣本輸入方法 (RNA >200 nt) | 適用於小片段 RNA 種類、快速又便利的方法 | 最高純度 TRIzol + 管柱純化，無須進行沉澱 | HTP 形式，可回收所有大小的 RNA (包括微型 RNA) | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TRIzol 試劑 | PureLink RNA 迷你套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | PureLink RNA 微規模套組 | mirVana miRNA 分離套組 | TRIzol Plus RNA 純化系統 | MagMAX mirVana 總 RNA 分離 | |
| 暢銷商品 | ✓ | ||||||
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 快速、便利的濾盤形式二氧化矽管柱 | 快速、便利的微二氧化矽管柱 | 有機萃取結合便利的二氧化矽管柱 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 |
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 30 分鐘 | 1 小時 | <1 小時 |
| 起始材料量 | 最多 100 mg | 10 mg 至 100 mg | 10 顆細胞至 10 mg | 最多 10 mg | 最多 250 mg 組織 | 最多 100 mg | 最多 50 mg |
| 適用於高處理量 | ✓ | ✓ | |||||
| 製備規模 | 100 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 |
動物組織的 RNA 產量
RNA 含量在組織、細胞類型、生理狀態等之間的差異相當大。此圖表提供預估各種細胞與組織之 RNA 產量的一般準則。
表 1.各種組織在 1 mg 時的一般總 RNA 產量。
保存和穩定 RNA
RNAlater 溶液廣泛用於完整動物組織、器官與細胞以及細菌的 RNA 保存。它排除了立即處理樣本以進行 RNA 分離或將其冷凍於液態氮以待後續處理的需要。
技術資源
哪一個酵母菌 RNA 萃取套組適合您？
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| 快速且完全自動化 | 快速且易於使用 | 針對強韌酵母菌細胞壁而設計，同時還能維持表現圖譜 | 適用於 96 個樣本 (RNA > 200 nt)、快速又便利的管柱型濾盤形式 | |
|---|---|---|---|---|
| Platinum Taq MagMAX 微陣列總 RNA 分離套組 | PureLink RNA 迷你套組 | RiboPure-酵母菌套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | |||
| 包含細胞溶解專用珠粒 | 否 | 否 | 氧化鋯珠粒 | 否 |
| 分離方法 | 取得最高純度的可擴增彈性形式；包含有機萃取和磁珠 | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 | 快速、便利的 96 孔濾盤形式二氧化矽管柱 |
| 製備時間 | <1 小時 | 20 分鐘 | 90 分鐘 (包含去氧核醣核酸酶處理) | 20 分鐘 |
| 起始材料量 | 最多 5 x 106 顆細胞 | 最多 5 x 108 顆細胞 | 最多 3 x 108 顆細胞 | 1.8 mL 新鮮對數期酵母菌細胞 (OD660=0.6–0.8) |
| 適用於高處理量 | ✓ | |||
| 套組大小 | 96 次製備 | 50 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 |
技術資源
不同於真核細胞，酵母菌和許多細菌菌株都受到難以破壞的細胞壁保護。作為第一步，必須先進行有效的細胞溶解 (一般透過機械式破壞或酵素前處理) 才能進行任何 RNA 分離程序。
Ambion RNA 專家所開發的一系列產品將協助您從細菌和酵母菌分離出高產量、完整的純 RNA。
哪一個細菌 RNA 萃取套組最適合您？
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| 無溶解程序 | 快速又輕鬆，20 分鐘 | 快速、便利的濾盤形式二氧化矽管柱式 | HTP，45 分鐘 | 非常適合難以溶解的革蘭氏陽性菌 | |
|---|---|---|---|---|---|
| TRIzol Max 細菌 RNA 分離套組 (含 TRIzol & Max 細菌增強試劑) | PureLink RNA 迷你套組 | PureLink Pro 96 總 RNA 純化套組 | MagMAX 總核酸分離套組 | RiboPure 細菌套組 | |
| 暢銷商品 | ✓ | ||||
| 包含細胞溶解專用珠粒 | 否 | 否 | 否 | 氧化鋯珠粒 | 氧化鋯珠粒 |
| 分離方法 | 高純度有機萃取 (須進行酒精沉澱) | 快速、便利的二氧化矽管柱 | 快速、便利的 96 孔濾盤形式二氧化矽管柱 | 採用磁珠、可擴增的彈性形式 | 最高純度與便利性；隨附有機萃取與二氧化矽管柱 (無須進行沉澱) |
| 製備時間 | 1 小時 | 20 分鐘 | 20 分鐘 | 45 分鐘 | 1 小時 |
| 起始材料量 | 最多 1 x 108 顆細胞 | 最多 1 x 109 顆細胞 | 最多 1 x 109 顆細胞 | 最多 0.3 g 固態樣本或 175 µl 液態樣本 | 最多 109 顆細胞 |
| 適用於高處理量 | ✓ | ✓ | |||
| 套組大小 | 100 次製備 | 50 次製備 | 96 次製備 | 100 次製備 | 50 次製備 |
技術資源
越來越多生物 (動物、昆蟲、植物、真菌、細菌) 與環境 (水、空氣、食物) 樣本的病毒分析採用需要受試樣本之病毒 RNA 或 DNA 的分子試驗策略。純化病毒 RNA 為取得良好回收率與偵測靈敏度帶來獨特的挑戰。Ambion RNA 專家已開發出經過最佳化的 RNA 純化產品，可處理各式各樣的樣本類型來提供最高病毒 RNA 產量、最高純度和最高完整性，並有數種形式可供選擇。
「PureLink 病毒 RNA/DNA 迷你套組的高濃縮病毒 RNA 提供了適用工具，可對病毒基因體進行更靈敏且更精細的下游分析」
杜克大學杜克人類疫苗機構 Feng Gao 醫師實驗室的 Dongning Wang 博士
產品規格
| 最適合的下游應用 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 產品 | 形式 | 即時 RT-PCR | 微陣列分析 | 定序 | 北方墨點法 | 選殖 |
總 RNA | ||||||
| PureLink 病毒 RNA⁄DNA 迷你套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ✓ | |||
| RNAqueous 套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| MagMAX AI⁄ND 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子 | ✓ | ✓ | |||
| MagMAX-96 AI⁄ND 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ✓ | |||
DNA/RNA | ||||||
| PureLink Pro 96 病毒 RNA⁄DNA 純化套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽過濾器，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ||||
| MagMAX 總核酸分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ✓ | |||
| MagMAX-96 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ✓ | |||
| Dynabeads SILANE 病毒核酸 | 離液鹽式溶解，磁珠，適用於自動化 | |||||
| iPrep PureLink 病毒套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子，適用於自動化 | ✓ | ||||
| MagMAX 病毒 RNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，磁性粒子 | ✓ | ||||
| MagMAX-96 病毒 RNA 分離套組 (5 x 96 rxn) | 離液鹽式溶解，磁性粒子，96 孔處理，適用於自動化 | ✓ | ||||
微型 RNA | ||||||
| mirVana miRNA 分離套組 | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ||||
| mirVana miRNA 分離套組 (無酚 - 必須另購) | 離液鹽式溶解，二氧化矽濾器 | ✓ | ||||
| TRIzol LS 試劑 | 於 TRIzol 試劑中溶解，單步驟試劑 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
mRNA | ||||||
| Dynabeads mRNA DIRECT 套組 | 離液鹽式溶解，磁珠 | ✓ | ✓ | |||
| Dynabeads mRNA DIRECT 微套組 | 離液鹽式溶解，磁珠 | ✓ | ✓ | |||
資源
支援
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.