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PureLink™ Mikrobiom-DNA-Aufreinigungskit
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PureLink™ Mikrobiom-DNA-Aufreinigungskit

Das PureLink™ Mikrobiom-DNA-Aufreinigungskit ermöglicht die schnelle Aufreinigung von qualitativ hochwertiger mikrobieller DNA und Wirts-DNA aus einer Vielzahl von Probentypen, darunterWeitere Informationen
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KatalognummerMenge
A2979050 Aufreinigungen
Katalognummer A29790
Preis (EUR)
404,00
Each
Menge:
50 Aufreinigungen
Preis (EUR)
404,00
Each
Das PureLink™ Mikrobiom-DNA-Aufreinigungskit ermöglicht die schnelle Aufreinigung von qualitativ hochwertiger mikrobieller DNA und Wirts-DNA aus einer Vielzahl von Probentypen, darunter auch anspruchsvolle Stuhl- und Bodenproben. Das Kit verwendet die bewährte PureLink Spin-Säulentechnik für robuste Ausbeuten an aufgereinigter DNA, die für Downstream-PCR, Sequenzierung oder andere Anwendungen geeignet ist. Der hocheffiziente Dreifachlyse-Ansatz, die schnelle Entfernung von Inhibitoren und seine Vielseitigkeit machen es zum ultimativen Kit für Mikrobiom-Forschungsprojekte sowie für Programme zum schnellen Nachweis pathogener Bakterien in verschiedenen Proben.

Zu den Merkmalen des PureLink Aufreinigungskits für Mikrobiom-DNA gehören:

• Effiziente Lyse aller Mikroorganismen (einschließlich langlebiger Spezies mit dickeren und komplexeren Zellwänden) durch eine Kombination von wärmeinduzierter, chemischer und mechanischer Störung mit Spezial-Beads
• Elimination hemmender Verbindungen durch Präzipitation mithilfe eines neuartigen Aufreinigungspuffers
• Optimierte Protokolle für zahlreiche biologische Proben
• Recovery von hochreiner DNA, die mit gängigen Downstream-Prozessen, wie qPCR und Next-Generation-Sequencing, kompatibel ist

Isolierung von mikrobieller und Wirts-DNA aus einem diversen Satz von Probentypen mit nur einem Kit
Das PureLink Mikrobiom-DNA-Aufreinigungskit wurde für die Verwendung mit einem weiten Bereich von biologischen Proben optimiert und minimiert daher den Bedarf an anderen Einzelkits für spezifische Probentypen.

Das Kit ermöglicht die Aufreinigung von mikrobieller und gegebenenfalls Wirts-DNA aus den folgenden Probentypen:

• Stuhl
• Urin
• Speichel
• Abstriche (Vaginal-, Bukkal, Haut-, Rektal-, Umgebungs-)
• Transportmedien
• Wachstumsmedien
• Bodenproben

Analyse des humanen Mikrobioms
Der menschliche Körper wird von 100 Billionen Bakterien, Archaeen, Pilzen, Protisten und Viren bevölkert, die alle eine fundamentale Rolle für unser Wohlbefinden spielen. Der Begriff „Mikrobiom“ bezieht sich auf viele unterschiedliche Mikroben in diesen Lebensgemeinschaften. Derzeit ist die Untersuchung ihrer Gene die einfachste Methode für den Nachweis solcher Organismen. Abweichungen von gesunden Zusammensetzungen von Mikroben wurden mit vielen Erkrankungen des Menschen assoziiert, u. a. mit chronisch-entzündlicher Darmerkrankung, Adipositas, Krebs, Asthma, Diabetes und Allergien.

Die Aufreinigung der gesamten in einer biologischen Probe enthaltenen mikrobiellen DNA ist ein wichtiger Schritt zur Erforschung, auf welche Weise sich das Mikrobiom auf die menschliche Gesundheit auswirkt. Dabei ist es entscheidend, dass die rückgewonnene DNA eine genaue Darstellung der unterschiedlichen Mikroben in der Probe liefert. Der Ansatz der mechanischen Störung und der dreifachen Lyse, die im PureLink Mikrobiom-DNA-Kit zur Anwendung kommt, hilft sicherzustellen, dass mikrobielle DNA selbst aus hartnäckigsten Proben, wie grampositive Bakterien in Stuhl, rückgewonnen werden kann – so können Sie das gesamte Spektrum der vorhandenen Mikroben identifizieren.
For research use only. Not for use in diagnostic procedures.
Specifications
SäulentypSpin-Säule
Elutionsvolumen50 to 200 μL
EndprodukttypMicrobial and host DNA
Zur Verwendung mit (Anwendung)Sequenzierung der nächsten Generation, Echtzeit-PCR, PCR
Hochdurchsatz-KompatibilitätNicht mit hohen Durchsatz kompatibel (manuell)
Menge50 Aufreinigungen
ProbentypBakterien, Speichel, Bodenproben, Lebensmittel und Umwelt, Umweltproben, Swabs (Buccal, Vaginal, Skin, Rectal, or Environmental), Zellen, Food and Environmental
UmfangMini
VersandbedingungRaumtemperatur
AusgangsmaterialmengeBuccal/Vaginal/Skin/Rectal/Environmental Swab: 1 swab
Microbial Culture: ≤5 mL
Saliva: ≤2 mL
Soil: ≤2 g
Stool: ≤2 g
Urine: ≤10 mL
PrüfzeitUp to 55 min. (Including sample homogenization)
Ertrag≤25 μg
Isolation TechnologyKieselgel-Zentrifugationssäule
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
• S1-Lysepuffer, 1 x 40 ml
• S2-Lyseverstärker, 1 x 5 ml
• S3-Reinigungspuffer, 1 x 12,5 ml
• S4-Bindungspuffer, 1 x 45 ml
• S5-Waschpuffer-Konzentrat, 1 x 13 ml
• S6-Elutionspuffer, 1 x 5 ml
• PureLink Spin-Säulen mit Entnahmeröhrchen, 50 Säulen/Röhrchen
• PureLink Entnahmeröhrchen, 100 St.
• Bead-Röhrchen*, 50 Röhrchen mit Spezial-Beads
* Lieferung in separater Box.

Bei Raumtemperatur lagern.

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

I am using the PureLink Microbiome DNA Purification Kit (Cat. No. A29790). When should I remove the swab?

The swab should be removed after incubation, prior to bead beating.

Does the elution buffer in the PureLink Microbiome DNA Purification Kit (Cat. No. A29790) contain EDTA?

Yes, the elution buffer in the PureLink Microbiome DNA Purification Kit contains EDTA. An alternative that does not contain EDTA is Tris Buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0-9.0). Eluting in water is possible, but the low pH of water could lead to reduced stability and less accurate OD readings.

When using the PureLink Microbiome DNA Purification Kit with soil samples, I am getting less than 400 µL supernatant after lysis. Can you provide me with any suggestions?

For some samples, including soil and stool samples, it can be difficult to withdraw 400 µL supernatant while avoiding debris. If less than 250 µL of supernatant is transferred, add S1-Lysis buffer to bring the volume to 400 µL, before adding S3-Cleanup Buffer.

I am getting low yield using PureLink Microbiome DNA Purification Kit. How can I improve the yield?

Low yield could be caused by inefficient lysis and/or low levels of DNA in the sample. Please try heating samples at 95 degrees C for 5-10 minutes instead of 65 degrees C for 10 minutes after adding S2-Lysis Enhancer. Bead beat for a longer time or at a higher power setting. You can also try to perform the experiment with more starting material, but do not exceed what we specify in the protocol. However for some challenging samples, too much starting material can also result in low yield. In this case, please try less starting material and/or increase the volume of S1-Lysis Buffer.

There are inhibitors in the isolated DNA from environmental samples using PureLink Microbiome DNA Purification Kit. Is there a way to rescue it and obtain good PCR results?

There are several options to rescue your DNA obtain good PCR results including diluting your DNA sample, using specific enzymes, and/or using an additive. The methods are described below:

- Dilute your DNA sample 10-100 times prior to PCR which will dilute out the contaminants while the PCR signal in many cases will remain strong.
- Use “tough” enzymes that were specifically designed and optimized to be effective in harsh environments, and work in the presence of high levels of inhibitors, for instance, TaqPath qPCR Master Mix, CG Reagent.
- Use a BSA additive for the PCR reaction. In most cases, if used at appropriate concentration, BSA can rescue your sample.

You can also try repeating the purification with less starting material or increased volume of S1-Lysis buffer. Additionally, after the addition of the S3- Cleanup buffer, you can try incubating the sample for 10 minutes on ice before centrifugation.

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Zitierungen und Referenzen (1)

Zitierungen und Referenzen
Abstract
Evaluation of a Highly Efficient DNA Extraction Method for Bacillus anthracis Endospores.
Authors:Knüpfer M,Braun P,Baumann K,Rehn A,Antwerpen M,Grass G,Wölfel AR
Journal:Microorganisms
PubMed ID:32443768
A variety of methods have been established in order to optimize the accessibility of DNA originating from Bacillus anthracis cells and endospores to facilitate highly sensitive molecular diagnostics. However, most endospore lysis techniques have not been evaluated in respect to their quantitative proficiencies. Here, we started by systematically assessing the ... More