QuantiGene™ Plex Human Virus-Host Panel, 50-plex

Das QuantiGene Plex Human Virus-Host Panel ist ein 50-Plex-Panel, das sich auf RNA-Ziele konzentriert, die für die Infektionsbiologie von Atemwegsinfektionen beim Menschen relevant sind, und umfasst Ziele in Bezug auf Immunantwort, virale Infektionsverfahren, Zytokinsturm, virale RNAs (Sars-CoV-2, Influenza, respiratorisches Syncytialvirus/RSV) und mehr. Dieses Panel wurde funktionell überprüft. Wenn ein bestimmtes Zielziel nicht enthalten ist, kann ein benutzerdefiniertes Panel entworfen werden. Jedes neue und kundenspezifische Panel wird innerhalb von drei Wochen nach Ihrer Bestellung entworfen, gebaut, validiert und versendet. Dieses Panel wird in Kombination mit dem QuantiGene Plex Assay-Kit verwendet, das alle Puffer, Platten und Nachweisreagenzien enthält, die zur Durchführung des Assays in 96- oder 384-Well-Platten erforderlich sind.

Das QuantiGene Plex Human Virus-Host-Panel bietet folgende Funktionen:
• True Multiplexing – misst bis zu 80 Gene von Interesse und Housekeeping-Gene in der gleichen Well ohne Kreuzreaktivität
• Unterstützung für schwierige Probenarten – arbeitet mit degradierter und quervernetzter RNA in FFPE-Geweben und Blut
• Standardisierte Plattform – verwendet 96- oder 384-Well-Platten, die mit Luminex 200, MagPix- und FlexMap3D-Systemen kompatibel sind
• Einfacher Arbeitsablauf – verwendet einen ELISA-ähnlichen Arbeitsablauf für die direkte Hybridisierung von Transkripten an Beads und die Transkriptkennzeichnung
• Großer Bestand an validierten Zielen – wenn diesem Panel zusätzliche Ziele hinzugefügt werden müssen, wählen Sie aus über 22.000 Genen zur Erstellung von Pathway- und krankheitsbezogenen Panels
• Schnelle Trendanalyse für kundenspezifische Panels – wenn wir nicht über Ihre Gene verfügen, wir können innerhalb von drei Wochen ein maßgeschneidertes Panel erstellen

QuantiGene Plex Assays sind hybridisierungsbasierte Assays für die direkte Quantifizierung von RNA direkt aus Zelllysaten, Gewebehomogenaten oder gereinigter RNA, und sie ermöglichen die Messung mehrerer Ziele in derselben Well über Multiplexing. QuantiGene Plex Assays enthalten zwei Komponenten: Ein zielspezifisches Sondenset und magnetische Capture Beads. Sie verwenden die zielspezifischen Sonden zur Erfassung der zu untersuchenden RNA, und die verzweigte DNA-Technologie verstärkt dann fluoreszierende Signale, die mit einem Luminex xMAP-Instrument gelesen werden.

Ziele: SARS-CoV-2 Pan-Sonde (orf1ab, Membran Glykoprotein, Nukleokapsid), ORF3a, ORF7a, ORF8, RDRP/NSP12, S-Protein, TMPRSS2, ACE2, At2, NF-κB, DPP4 (CD26), Hüllprotein, Influenza-Pan-Sonde, RSV Pan-Sonde, CD4, CD8a, HLA-DR, CD38, CD25, CD14, CD19, RORC, TBX21, Gata3, nCAM1 (CD56), CD11d, IFITM1, CCL2 (MCP-1), CCL3 (MIP-1a), IFNg, Il12A, IL6, IL8a, Il1b, IFNa, Il10, IL2, TNFa, Il4, Granzyme B, IL18, IP10 (CXCL10), GM-CSF, Il17A (CTLA8), VEGF-A, GAPDH, GUSB, HPRT1, PPIB, RPL13A

Technologie
QuantiGene Plex Assays verwenden die Technologie für verzweigte DNA (bDNA). Zuerst werden Zellen (oder Blut) lysiert oder Gewebeproben (einschließlich FFPE) homogenisiert, um die Target-RNA freizugeben. Zweitens wird das Oligonukleotid-Sondenset über Nacht mit der Target-RNA und dem Luminex xMAP-Bead inkubiert. Während dieser Inkubation hybridisieren die Sonden gemeinsam mit dem Target und fangen die an jede Bead gebundenen Sonden ein, um die Target-RNA zu erfassen. In einem dritten Schritt wird die Signalverstärkung über eine sequenzielle Hybridisierung der bDNA-Vorverstärker, Verstärker und Markierungs-Sonden-Moleküle auf das Ziel angewendet. Die Zugabe von Streptavidin Phycoerythrin erzeugt ein Lumineszenzsignal, das direkt proportional zur Menge der in der Probe vorhandenen Target-mRNA ist. Dies ermöglicht die (relative) Quantifizierung der Genexpression und ermöglicht mit diesem speziellen Panel die Untersuchung von viralen Infektionsprozessen, humanen (Host-)Immunprofilen und Zytokinsturm-Biomarkern sowie das Vorhandensein von SARS-CoV-2 und ausgewählten Influenza- und RSV-Stämmen.

Anwendungen
Die Anwendungen der QuantiGene Plex Assay-Forschung umfassen das Screening von Verbindungen für die Arzneimittelforschung, die Biomarker-Verifikation, die siRNA-Knockdown-Effizienz, die prospektive und/oder retrospektive Analyse von klinischen Proben, die Validierung von Mikroarrays, prädiktive Toxikologie sowie den Nachweis von Translokationen und Fusiongenen.