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Invitrogen™

Sistema de expresión de ARNi lentiviral BLOCK-iT™ Pol II miR

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El sistema de expresión de ARNi lentiviral BLOCK-iT™ Poll II miR combina la
tecnología de ARNi BLOCK-iT™ Pol II miR de Invitrogen y la tecnología lentiviral ViraPower™ para facilitar la creación de un
lentivirus incompetente para la replicación que ofrezca una secuencia de
microARN (miARN) de interés para células de
mamíferos con y sin división para el análisis de interferencia de ARN (ARNi), ensanchando así las posibles aplicaciones de RNAi
más allá de las de otros
sistemas retrovirales tradicionales (Naldini, 1998).

El sistema de expresión de ARNi lentiviral BLOCK-iT™ Pol II miR incluye:
o Un kit de vectores de expresión de ARNi BLOCK-iT™ Pol II miR para la producción de un clon de
expresión que contiene un oligonucleótido bicatenario que codifica una secuencia de pre-miARN para la expresión en células de mamíferos. El vector de expresión de ARNi BLOCK-iT™ Pol II miR (pcDNA™6.2-GW/miR) proporciona una forma rápida y eficaz de clonar dúplex de oligonucleótidos bc que codifican una secuencia de diana de miARN deseada en un vector que contiene un promotor de Pol II (CMV) para su uso en análisis de ARNi. El vector de expresión de ARNi BLOCK-iT™ Pol II miR está diseñado específicamente para
permitir la expresión de secuencias de miARN y contener secuencias
de flanqueo miR específicas que permiten el procesamiento adecuado del miARN.
El vector pDONR™ 221 sirve para transferir el casete de expresión de pre-miAR
al plásmido de expresión lentiviral mediante tecnología Gateway™. La tecnología Gateway™ es un método de clonación universal que aprovecha las propiedades de recombinación específicas del sitio del bacteriófago lambda (Landy, 1989) para proporcionar una forma rápida y altamente eficaz de mover su secuencia de ADN de interés a múltiples sistemas vectoriales.
o Un vector de destino pLenti6/V5-DEST en el que se transfiere el casete
de pre-miARN del clon de expresión mediante la tecnología Gateway™. Este plásmido de expresión contiene elementos que permiten el envasado de la construcción en viriones y el marcador de resistencia a la blasticidina para la selección de líneas celulares transducidas de forma estable.
o Mezclas de enzimas Gateway™ BP y LR Clonase™ II que facilitan la transferencia
del casete de expresión premiARN desde el vector de expresión al vector de destino
pLenti6/V5-DEST.
o Componentes del sistema lentiviral ViraPower™ para la producción de un
lentivirus incompetente para la replicación que expresa de forma estable el miARN
de interés en las células de mamíferos con y sin división. La tecnología lentiviral ViraPower™ facilita la administración altamente eficiente, in vitro o in vivo de un gen o ARN diana a células de mamíferos con y sin división mediante un lentivirus incompetente en la replicación. Basado en el sistema lentikat™ desarrollado por Cell Genesys (Dull et al., 1998), la tecnología lentiviral ViraPower™ posee características que mejoran su bioseguridad al tiempo que permite una expresión de alto nivel en una gama más amplia de tipos de células que los sistemas retrovirales tradicionales.
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Método de clonaciónGateway™
Sistema constitutivo o inducibleConstitutivo
Tipo de entregaLentivírico
Línea de productosBLOCK-iT, Gateway
Tipo de productoKit de vectores de expresión de ARNi
Cantidad20 reacciones
Tipo de RNAimiARN
Agente de selección (eucariótico)Blasticidina
VectorpLenti
PromotorCMV
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
El sistema de expresión de ARNi lentiviral BLOCK-iT™ Poll II miR contiene el kit de vectores de expresión de ARNi miR BLOCK-iT™ Pol IIque contiene dos cajas. La caja de clonación contiene pcDNA™6.2-GW/miR linealizado, tampón de recocido (10), ligasa de DNA T4, tampón de ligación de DNA (5), oligonucleótido de control lacZ, plásmido de control lacZ, plásmido de control negativo, agua sin ADNasa/ARNasa y cebadores de secuenciación directa e inversa. Almacene los vectores, tampones, oligos de control y plásmidos, agua y primers de secuenciación a -20 °C. La caja One Shot™ contiene reactivos de transformación que incluyen 21 alícuotas de 50 µl de E. coli químicamente competente TOP10 One Shot™, medio S.O.C. y un plasmídico de control superhelicoidal pUC19. Almacenar estos reactivos de transformación a -80 °C. Se garantiza la estabilidad de todos los reactivos durante 6 meses si se almacenan correctamente.

El sistema de expresión de ARNi lentiviral BLOCK-iT™ Poll II miR también incluye todos los reactivos necesarios para la clonación Gateway™ en el sistema de expresión lentiviral, incluyendo: vector pLenti6/V5-DEST, control pLenti6-V5/GW-lacZ, pDONR™221, kit de soporte Bsd lentiviral ViraPower™ (mezcla de envase ViraPower™, reactivo de transfección Lipofectamine™ 2000 y blasticidina), línea celular 293FT, E. coli químicamente competente One Shot™ Stbl3™, E. coli químicamente competente One Shot™ TOP10 y mezclas de enzimas Gateway™ LR y BP Clonase™ II. Almacene el reactivo Lipofectamine™ 2000 a +4 °C (no lo congele). Almacene los vectores, la mezcla de envase ViraPower™, la blasticidina, y ambas mezclas de enzimas Clonase™ II a - 20 °C. Almacene las células competentes a - 80 °C. Almacene la línea celular 293FT en nitrógeno líquido. Se garantiza la estabilidad de todos los reactivos durante 6 meses si se almacenan correctamente.

Preguntas frecuentes

How large of a PCR product can I recombine with a pDONR vector via BP cloning? Does the same apply for TOPO-adapted Entry vectors?

There is no theoretical limit to insert size for a BP reaction with a pDONR vector. Maximum size tested in-house is 12 kb. TOPO vectors are more sensitive to insert size and 3-5 kb is the upper limit for decent cloning efficiency.

How should I clean up my attB-PCR product?

After generating your attB-PCR product, we recommend purifying it to remove PCR buffer, unincorporated dNTPs, attB primers, and any attB primer-dimers. Primers and primer-dimers can recombine efficiently with the Donor vector in the BP reaction and may increase background after transformation into E. coli, whereas leftover PCR buffer may inhibit the BP reaction. Standard PCR product purification protocols using phenol/chloroform extraction followed by ammonium acetate and ethanol or isopropanol precipitation are not recommended for purification of the attB-PCR product as these protocols generally have exclusion limits of less than 100 bp and do not efficiently remove large primer-dimer products. We recommend a PEG purification protocol (see page 17 of the Gateway Technology with Clonase II manual). If you use the above protocol and your attB-PCR product is still not suitably purified, you may further gel-purify the product. We recommend using the PureLink Quick Gel Extraction kit.

I'm trying to propagate my Gateway destination vector and am not seeing any colonies. What should I do?

Check the genotype of the cell strain you are using. Our Gateway destination vectors typically contain a ccdB cassette, which, if uninterrupted, will inhibit E. coli growth. Therefore, un-cloned vectors should be propagated in a ccdB survival cell strain, such as our ccdB Survival 2 T1R competent cells.

What is the difference between LR Clonase II and LR Clonase II Plus?

LR Clonase II Plus contains an optimized formulation of recombination enzymes for use in MultiSite Gateway LR reactions. LR Clonase and LR Clonase II enzyme mixes are not recommended for MultiSite Gateway LR recombination reactions, but LR Clonase II Plus is compatible with both multi-site and single-site LR recombination reactions.

What are the benefits of the BLOCK-iT miR RNAi expression system over similar systems?

The BLOCK-iT miR RNAi expression system allows you to take advantage of promoter flexibility by choosing from a variety of Pol II promoters like CMV, Ubc, tissue specific, or inducible promoters. The miRNA vectors also allow you to clone multiple sequences in the same vector, thereby enabling you to target more than one gene or more than one location in a gene using a single plasmid. An additional advantage offered by some of the miRNA expression vectors is that transfection efficiency can be monitored with the EmGFP fusion partner.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our RNAi Support Center.