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Pour les données de performance complémentaires des kits et réactifs spécifiques, suivez les liens indiqués dans les légendes des figures du n° de catalogue dont ils sont issus. Pour obtenir des données d’application complémentaires, téléchargez les notes d’application répertoriées dans cette section et sur la page Ressources.
Tests SARS-CoV-2
Les échantillons d’écouvillons nasopharyngés ont été enrichis de 250 copies/ml (à gauche) ou de 750 copies/ml (à droite) d’ARN viral SARS-CoV-2 (1x ou 3x la limite de détection, respectivement), et l’ARN a été extrait de 200 μl ou 400 μl de l’échantillon enrichi en trois exemplaires à l’aide du kit de virus/agents pathogènes MagMAX (Réf N° A42352) avec (+) ou sans (-) Wash 3. Après élution dans 50 μl, les échantillons ont été dosés par qRT-PCR pour quatre cibles d'ARN (symboles colorés) en trois exemplaires. Les valeurs Ct pour chaque cible étaient très homogènes (les symboles se rapprochent énormément) et pratiquement identiques entre les volumes d'échantillons et les conditions de lavage, ce qui permet de valider les protocoles rationalisés à faible volume. Tous les échantillons négatifs avaient des valeurs Ct marquées comme « Non détecté » (données non affichées).
Récupération et pureté de l’ADN à partir de sang entier
Un instrument KingFisher Duo Prime a été utilisé pour isoler l’ADN du sang entier de deux donneurs à l’aide du kit MagMAX Multi-Sample Ultra 2.0 (Réf. N° A36570). Les échantillons >de 400 µl ont été traités à l’aide du protocole pour grand volume dans une plaque à 24 puits, tandis que les échantillons de 50 à 400 µl ont été traités à l’aide du protocole pour petit volume dans une plaque à 96 puits. (Aucune normalisation du volume d’échantillon n’était nécessaire, même lorsque des échantillons de 50 µl et 400 µl ont été exécutés en même temps sur la même plaque.) Le temps d'exécution était de 45 minutes. (Haut) Les volumes de récupération étaient linéaires pour les entrées de petit et de grand volume. (Bas) Les rapports A260/A280 et A260/A230 ont démontré une grande pureté sur les volumes d'échantillons.
Homogénéité du séquençage des échantillons de cancer du FFPE
L’ADN et l’ARN ont été extraits de biopsies au trocart correspondantes et d’échantillons de ponction à l’aiguille fine à l’aide du kit Ultra d’ADN/ARN MagMAX FFPE (Réf. n° A31881) de l'instrument KingFisher Duo Prime. Les bibliothèques ont été préparées et les échantillons ont été modélisés et séquencés. Les mesures de séquençage telles que (A) la longueur de lecture moyenne et (B) la cartographie et l'uniformité de l'ADN étaient constantes, démontrant ainsi la récupération fonctionnelle des acides nucléiques de différents types d'échantillons.
L’ARN total a été isolé du sérum de 10 personnes atteintes d’un cancer de la prostate et de 10 personnes en bonne santé à l’aide du kit d’isolement MagMAX mirVana (Réf. N° A27828) sur l'instrument KingFisher Flex. Les niveaux d’expression de 19 miARN ont été mesurés par qRT-PCR à l’aide des kits de synthèse TaqMan Advanced miRNA cDNA (Réf. N° A28007) et TaqMan Advanced miRNA Assays (Réf. N° A25576). L’axe des y affiche les valeurs de ΔCt pour chaque miARN, normalisées à l'ARNm de référence. Les différences fondamentales entre les échantillons de mâles sains (bleus) et les échantillons de cancer de la prostate (verts) permettent d'identifier les biomarqueurs potentiels du cancer.
Identification des microbiotes
L’acide nucléique total provenant d’échantillons de matières fécales, d’urine et de salive provenant de deux donneurs a été isolé à l’aide du kit d’isolation d’acide nucléique MagMAX Microbiome Ultra (Réf. N° A42357 et A42358) de l'instrument KingFisher Flex, soumis au séquençage métagénomique aléatoire, et comparés aux profils microbiens connus. La figure montre des cartes thermiques en abondance pour les microbiotes sélectionnés pour tous les échantillons. Les résultats ont confirmé que chaque habitat corporel abritait différents taxons de signatures dominants, avec seulement quelques espèces partagées, principalement entre l'urine et la salive. Dans chaque communauté, il y a eu un chevauchement important entre les donateurs, mais aussi des différences individuelles marquées.
Détection de pathogènes vétérinaires
Dans le cadre d’une recherche menée à l’école de médecine vétérinaire de l’Université de Californie Davis, du sang entier, des matières fécales et des sécrétions nasales ont été obtenues à partir d'espèces canines, félines et équines. Les acides nucléiques totaux ont été extraits sur l'instrument KingFisher Flex et un système automatisé sous vide et amplifiés par qPCR. Les valeurs du cycle de quantification (Cq) étaient comparables pour les deux méthodes et le nombre total d'agents pathogènes détectés était similaire. Cependant, le temps d'extraction avec l'instrument KingFisher Flex était trois fois plus rapide.
Immunoprécipitation
Les cellules Jurkat avec l’expression CD81 ont été lysées et incubées avec la protéine G Dynabeads (Réf. N° 10004D) revêtue d'un anticorps anti-CD81. Le CD81 a été isolé du lysat cellulaire en trois exemplaires à l’aide d’un protocole IP Walkaway optimisé sur les instruments KingFisher Duo Prime et Flex, puis comparé au protocole manuel. L’électrophorèse et le transfert Western ont confirmé que les deux instruments avaient réalisé de bonnes performances, équivalentes aux résultats obtenus via le protocole manuel.
Cartographie de peptides
Le médicament infliximab a été digéré à l’aide du kit de trypsine SMART Digest de l'instrument KingFisher Duo Prime. L’analyse de la carte des peptides UV par LC-MS a confirmé une couverture de séquence complète de 100 % pour les chaînes légère et lourde de l'anticorps. Dans d’autres données, le protocole automatisé a été jugé reproductible et facile à utiliser, même par ceux qui n’avaient aucune expérience préalable en matière de digestion des protéines.
Retrait de l'exosome
Les exosomes CD9 + des cellules cancéreuses du côlon SW480 ont été isolés sur l'instrument KingFisher Flex en ciblant le CD9, puis en les colorant et en les analysant par cytométrie de flux. Les exosomes CD9 des cellules Jurkat ont été inclus comme organes de commande. Les histogrammes montrent une population distincte de CD9 + (rouge) parmi les cellules SW480 (B) par rapport aux organes de commande Jurkat (C). Le diagramme de dispersion et le profil de déclenchement sont également indiqués (A).
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser à des fins diagnostiques.